RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525385.5

TM7SF2-205, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 2, human

TSL 5

Gene TM7SF2, Length 1,014 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TM7SF2-205	ENST00000525385	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		47.26	■■■■■ 5.16
TM7SF2-205	ENST00000525385	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		42.08	■■■■■ 4.33
TM7SF2-205	ENST00000525385	ABCC9	O60706	1549 aa		41.34	■■■■■ 4.21
TM7SF2-205	ENST00000525385	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		39.67	■■■■□ 3.94
TM7SF2-205	ENST00000525385	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		39.62	■■■■□ 3.93
TM7SF2-205	ENST00000525385	NACAD	O15069	1562 aa		39.58	■■■■□ 3.93
TM7SF2-205	ENST00000525385	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	39.35	■■■■□ 3.89
TM7SF2-205	ENST00000525385	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		39.25	■■■■□ 3.87
TM7SF2-205	ENST00000525385	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		39.06	■■■■□ 3.84
TM7SF2-205	ENST00000525385	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		38.79	■■■■□ 3.8
TM7SF2-205	ENST00000525385	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	38.6	■■■■□ 3.77
TM7SF2-205	ENST00000525385	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		38.47	■■■■□ 3.75
TM7SF2-205	ENST00000525385	SCRIB	Q14160	1630 aa		38.45	■■■■□ 3.75
TM7SF2-205	ENST00000525385	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		38.02	■■■■□ 3.68
TM7SF2-205	ENST00000525385	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		38	■■■■□ 3.67
TM7SF2-205	ENST00000525385	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	37.48	■■■■□ 3.59
TM7SF2-205	ENST00000525385	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		37.37	■■■■□ 3.57
TM7SF2-205	ENST00000525385	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		37.13	■■■■□ 3.54
TM7SF2-205	ENST00000525385	SMARCA4	P51532	1647 aa		36.72	■■■■□ 3.47
TM7SF2-205	ENST00000525385	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	36.65	■■■■□ 3.46
TM7SF2-205	ENST00000525385	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		36.53	■■■■□ 3.44
TM7SF2-205	ENST00000525385	NCAPD3	P42695	1498 aa		36.5	■■■■□ 3.43
TM7SF2-205	ENST00000525385	SMARCA2	P51531	1590 aa		36.49	■■■■□ 3.43
TM7SF2-205	ENST00000525385	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		36.44	■■■■□ 3.42
TM7SF2-205	ENST00000525385	HMGXB3	Q12766	1538 aa		36.34	■■■■□ 3.41
TM7SF2-205	ENST00000525385	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		36.32	■■■■□ 3.4
TM7SF2-205	ENST00000525385	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	36.26	■■■■□ 3.4
TM7SF2-205	ENST00000525385	WIZ	O95785	1651 aa		36.07	■■■■□ 3.36
TM7SF2-205	ENST00000525385	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	35.96	■■■■□ 3.35
TM7SF2-205	ENST00000525385	NES	P48681	1621 aa		35.72	■■■■□ 3.31
TM7SF2-205	ENST00000525385	ERCC6	Q03468	1493 aa		35.66	■■■■□ 3.3
TM7SF2-205	ENST00000525385	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	35.65	■■■■□ 3.3
TM7SF2-205	ENST00000525385	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		35.59	■■■■□ 3.29
TM7SF2-205	ENST00000525385	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		35.46	■■■■□ 3.27
TM7SF2-205	ENST00000525385	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		35.36	■■■■□ 3.25
TM7SF2-205	ENST00000525385	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		35.31	■■■■□ 3.24
TM7SF2-205	ENST00000525385	CUX2	O14529	1486 aa		35.27	■■■■□ 3.24
TM7SF2-205	ENST00000525385	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		35.23	■■■■□ 3.23
TM7SF2-205	ENST00000525385	CFTR	P13569	1480 aa		35.22	■■■■□ 3.23
TM7SF2-205	ENST00000525385	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	35.21	■■■■□ 3.23
TM7SF2-205	ENST00000525385	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		35.08	■■■■□ 3.21
TM7SF2-205	ENST00000525385	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		35.05	■■■■□ 3.2
TM7SF2-205	ENST00000525385	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	35.03	■■■■□ 3.2
TM7SF2-205	ENST00000525385	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		35.02	■■■■□ 3.2
TM7SF2-205	ENST00000525385	PRDM2	Q13029	1718 aa		34.98	■■■■□ 3.19
TM7SF2-205	ENST00000525385	WDR62	O43379	1518 aa		34.9	■■■■□ 3.18
TM7SF2-205	ENST00000525385	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	34.73	■■■■□ 3.15
TM7SF2-205	ENST00000525385	TOPBP1	Q92547	1522 aa		34.5	■■■■□ 3.11
TM7SF2-205	ENST00000525385	ABCC8	Q09428	1581 aa		34.46	■■■■□ 3.11
TM7SF2-205	ENST00000525385	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		34.45	■■■■□ 3.11
TM7SF2-205	ENST00000525385	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		34.38	■■■■□ 3.09
TM7SF2-205	ENST00000525385	IFT140	Q96RY7	1462 aa		34.3	■■■■□ 3.08
TM7SF2-205	ENST00000525385	CUX1	P39880	1505 aa		34.2	■■■■□ 3.07
TM7SF2-205	ENST00000525385	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	34.2	■■■■□ 3.06
TM7SF2-205	ENST00000525385	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	34.18	■■■■□ 3.06
TM7SF2-205	ENST00000525385	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	34.12	■■■■□ 3.05
TM7SF2-205	ENST00000525385	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		34.11	■■■■□ 3.05
TM7SF2-205	ENST00000525385	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		34.07	■■■■□ 3.04
TM7SF2-205	ENST00000525385	SOGA1	O94964	1423 aa		34.05	■■■■□ 3.04
TM7SF2-205	ENST00000525385	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	34.05	■■■■□ 3.04
TM7SF2-205	ENST00000525385	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	33.97	■■■■□ 3.03	8e-6	■■■■□ 23.2
TM7SF2-205	ENST00000525385	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	33.93	■■■■□ 3.02	5e-6	■■■■■ 29.2
TM7SF2-205	ENST00000525385	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	33.89	■■■■□ 3.02
TM7SF2-205	ENST00000525385	SYNJ1	O43426	1573 aa		33.87	■■■■□ 3.01
TM7SF2-205	ENST00000525385	TOP2B	Q02880	1626 aa		33.86	■■■■□ 3.01
TM7SF2-205	ENST00000525385	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		33.86	■■■■□ 3.01
TM7SF2-205	ENST00000525385	WDR97	A6NE52	1622 aa		33.82	■■■■□ 3.01
TM7SF2-205	ENST00000525385	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		33.78	■■■■□ 3
TM7SF2-205	ENST00000525385	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		33.74	■■■□□ 2.99
TM7SF2-205	ENST00000525385	GRIN2B	Q13224	1484 aa		33.67	■■■□□ 2.98
TM7SF2-205	ENST00000525385	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		33.67	■■■□□ 2.98
TM7SF2-205	ENST00000525385	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		33.67	■■■□□ 2.98
TM7SF2-205	ENST00000525385	CHD1	O14646	1710 aa		33.65	■■■□□ 2.98
TM7SF2-205	ENST00000525385	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		33.64	■■■□□ 2.98
TM7SF2-205	ENST00000525385	FBLN2	P98095	1184 aa		33.63	■■■□□ 2.97
TM7SF2-205	ENST00000525385	PBRM1	Q86U86	1689 aa		33.63	■■■□□ 2.97
TM7SF2-205	ENST00000525385	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
TM7SF2-205	ENST00000525385	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
TM7SF2-205	ENST00000525385	SYNJ2	O15056	1496 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TM7SF2-205	ENST00000525385	ADAMTS12	P58397	1594 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TM7SF2-205	ENST00000525385	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TM7SF2-205	ENST00000525385	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TM7SF2-205	ENST00000525385	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TM7SF2-205	ENST00000525385	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TM7SF2-205	ENST00000525385	ARHGEF11	O15085	1522 aa		33.26	■■■□□ 2.91
TM7SF2-205	ENST00000525385	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		33.26	■■■□□ 2.91
TM7SF2-205	ENST00000525385	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TM7SF2-205	ENST00000525385	GRIN2A	Q12879	1464 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TM7SF2-205	ENST00000525385	KIF27	Q86VH2	1401 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TM7SF2-205	ENST00000525385	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TM7SF2-205	ENST00000525385	CEP170	Q5SW79	1584 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TM7SF2-205	ENST00000525385	IGF1R	P08069	1367 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TM7SF2-205	ENST00000525385	NUP160	Q12769	1436 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TM7SF2-205	ENST00000525385	CUL7	Q14999	1698 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TM7SF2-205	ENST00000525385	ARAP1	Q96P48	1450 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TM7SF2-205	ENST00000525385	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TM7SF2-205	ENST00000525385	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.91	■■■□□ 2.86
TM7SF2-205	ENST00000525385	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.91	■■■□□ 2.86
TM7SF2-205	ENST00000525385	SHROOM2	Q13796	1616 aa		32.84	■■■□□ 2.85
TM7SF2-205	ENST00000525385	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.81	■■■□□ 2.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.5 ms