RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525129.1

TMEM25-210, Transcript of transmembrane protein 25, humanhuman

TSL 3

Gene TMEM25, Length 287 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25-210ENST00000525129 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.04■■■□□ 2.72
TMEM25-210ENST00000525129 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.62■■■□□ 2.17
TMEM25-210ENST00000525129 ABCC9O60706 1549 aa28.39■■■□□ 2.14
TMEM25-210ENST00000525129 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.12■■□□□ 1.93
TMEM25-210ENST00000525129 NACADO15069 1562 aa27■■□□□ 1.91
TMEM25-210ENST00000525129 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.99■■□□□ 1.91
TMEM25-210ENST00000525129 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.69■■□□□ 1.86
TMEM25-210ENST00000525129 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
TMEM25-210ENST00000525129 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.53■■□□□ 1.84
TMEM25-210ENST00000525129 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
TMEM25-210ENST00000525129 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.45■■□□□ 1.83
TMEM25-210ENST00000525129 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.41■■□□□ 1.82
TMEM25-210ENST00000525129 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.33■■□□□ 1.8
TMEM25-210ENST00000525129 SCRIBQ14160 1630 aa26.14■■□□□ 1.77
TMEM25-210ENST00000525129 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM25-210ENST00000525129 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
TMEM25-210ENST00000525129 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.66■■□□□ 1.7
TMEM25-210ENST00000525129 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.53■■□□□ 1.68
TMEM25-210ENST00000525129 SMARCA4P51532 1647 aa24.94■■□□□ 1.58
TMEM25-210ENST00000525129 NCAPD3P42695 1498 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM25-210ENST00000525129 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.89■■□□□ 1.58
TMEM25-210ENST00000525129 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TMEM25-210ENST00000525129 SMARCA2P51531 1590 aa24.83■■□□□ 1.57
TMEM25-210ENST00000525129 HMGXB3Q12766 1538 aa24.76■■□□□ 1.55
TMEM25-210ENST00000525129 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM25-210ENST00000525129 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
TMEM25-210ENST00000525129 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.67■■□□□ 1.54
TMEM25-210ENST00000525129 ERCC6Q03468 1493 aa24.49■■□□□ 1.51
TMEM25-210ENST00000525129 NESP48681 1621 aa24.47■■□□□ 1.51
TMEM25-210ENST00000525129 WIZO95785 1651 aa24.43■■□□□ 1.5
TMEM25-210ENST00000525129 CUX2O14529 1486 aa24.33■■□□□ 1.49
TMEM25-210ENST00000525129 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.32■■□□□ 1.48
TMEM25-210ENST00000525129 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TMEM25-210ENST00000525129 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.19■■□□□ 1.46
TMEM25-210ENST00000525129 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.18■■□□□ 1.46
TMEM25-210ENST00000525129 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.17■■□□□ 1.46
TMEM25-210ENST00000525129 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TMEM25-210ENST00000525129 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TMEM25-210ENST00000525129 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM25-210ENST00000525129 CFTRP13569 1480 aa23.96■■□□□ 1.43
TMEM25-210ENST00000525129 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.95■■□□□ 1.42
TMEM25-210ENST00000525129 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.92■■□□□ 1.42
TMEM25-210ENST00000525129 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.91■■□□□ 1.42
TMEM25-210ENST00000525129 WDR62O43379 1518 aa23.88■■□□□ 1.41
TMEM25-210ENST00000525129 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.86■■□□□ 1.41
TMEM25-210ENST00000525129 PRDM2Q13029 1718 aa23.76■■□□□ 1.39
TMEM25-210ENST00000525129 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
TMEM25-210ENST00000525129 TOPBP1Q92547 1522 aa23.49■■□□□ 1.35
TMEM25-210ENST00000525129 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TMEM25-210ENST00000525129 ABCC8Q09428 1581 aa23.44■■□□□ 1.34
TMEM25-210ENST00000525129 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.43■■□□□ 1.34
TMEM25-210ENST00000525129 IFT140Q96RY7 1462 aa23.43■■□□□ 1.34
TMEM25-210ENST00000525129 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TMEM25-210ENST00000525129 OSCARQ8IYS5 282 aa23.3■■□□□ 1.32
TMEM25-210ENST00000525129 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TMEM25-210ENST00000525129 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TMEM25-210ENST00000525129 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TMEM25-210ENST00000525129 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
TMEM25-210ENST00000525129 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.2■■□□□ 1.3
TMEM25-210ENST00000525129 CUX1P39880 1505 aa23.19■■□□□ 1.3
TMEM25-210ENST00000525129 SOGA1O94964 1423 aa23.18■■□□□ 1.3
TMEM25-210ENST00000525129 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.17■■□□□ 1.3
TMEM25-210ENST00000525129 TRIM41Q8WV44 630 aa23.13■■□□□ 1.29
TMEM25-210ENST00000525129 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
TMEM25-210ENST00000525129 CHD1O14646 1710 aa23.05■■□□□ 1.28
TMEM25-210ENST00000525129 WDR97A6NE52 1622 aa23.02■■□□□ 1.28
TMEM25-210ENST00000525129 FBLN2P98095 1184 aa23.02■■□□□ 1.28
TMEM25-210ENST00000525129 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM25-210ENST00000525129 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM25-210ENST00000525129 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM25-210ENST00000525129 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM25-210ENST00000525129 GRIN2BQ13224 1484 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM25-210ENST00000525129 ARHGEF11O15085 1522 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM25-210ENST00000525129 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM25-210ENST00000525129 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
TMEM25-210ENST00000525129 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM25-210ENST00000525129 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TMEM25-210ENST00000525129 TOP2BQ02880 1626 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM25-210ENST00000525129 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.89■■□□□ 1.25
TMEM25-210ENST00000525129 PBRM1Q86U86 1689 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM25-210ENST00000525129 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TMEM25-210ENST00000525129 SYNJ1O43426 1573 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM25-210ENST00000525129 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM25-210ENST00000525129 SYNJ2O15056 1496 aa22.82■■□□□ 1.24
TMEM25-210ENST00000525129 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM25-210ENST00000525129 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM25-210ENST00000525129 ARAP1Q96P48 1450 aa22.7■■□□□ 1.22
TMEM25-210ENST00000525129 ADAMTS12P58397 1594 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM25-210ENST00000525129 GRIN2AQ12879 1464 aa22.64■■□□□ 1.21
TMEM25-210ENST00000525129 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.62■■□□□ 1.21
TMEM25-210ENST00000525129 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.61■■□□□ 1.21
TMEM25-210ENST00000525129 CEP170Q5SW79 1584 aa22.55■■□□□ 1.2
TMEM25-210ENST00000525129 NUP160Q12769 1436 aa22.55■■□□□ 1.2
TMEM25-210ENST00000525129 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.46■■□□□ 1.19
TMEM25-210ENST00000525129 KIF27Q86VH2 1401 aa22.45■■□□□ 1.18
TMEM25-210ENST00000525129 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TMEM25-210ENST00000525129 SHROOM2Q13796 1616 aa22.42■■□□□ 1.18
TMEM25-210ENST00000525129 IGF1RP08069 1367 aa22.41■■□□□ 1.18
TMEM25-210ENST00000525129 CUL7Q14999 1698 aa22.36■■□□□ 1.17
TMEM25-210ENST00000525129 JPH4Q96JJ6 628 aa22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms