RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525070.1

SIGIRR-204, Transcript of single Ig and TIR domain containing, humanhuman

TSL 3

Gene SIGIRR, Length 729 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRR-204ENST00000525070 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.75■■■■■ 4.43
SIGIRR-204ENST00000525070 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.16■■■■□ 3.7
SIGIRR-204ENST00000525070 ABCC9O60706 1549 aa37.57■■■■□ 3.61
SIGIRR-204ENST00000525070 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.09■■■■□ 3.37
SIGIRR-204ENST00000525070 NACADO15069 1562 aa35.98■■■■□ 3.35
SIGIRR-204ENST00000525070 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.94■■■■□ 3.34
SIGIRR-204ENST00000525070 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.66■■■■□ 3.3
SIGIRR-204ENST00000525070 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
SIGIRR-204ENST00000525070 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.38■■■■□ 3.25
SIGIRR-204ENST00000525070 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.2■■■■□ 3.23
SIGIRR-204ENST00000525070 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.08■■■■□ 3.21
SIGIRR-204ENST00000525070 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.89■■■■□ 3.18
SIGIRR-204ENST00000525070 SCRIBQ14160 1630 aa34.74■■■■□ 3.15
SIGIRR-204ENST00000525070 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.71■■■■□ 3.15
SIGIRR-204ENST00000525070 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.62■■■■□ 3.13
SIGIRR-204ENST00000525070 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
SIGIRR-204ENST00000525070 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.98■■■■□ 3.03
SIGIRR-204ENST00000525070 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.82■■■■□ 3.01
SIGIRR-204ENST00000525070 SMARCA4P51532 1647 aa33.22■■■□□ 2.91
SIGIRR-204ENST00000525070 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
SIGIRR-204ENST00000525070 NCAPD3P42695 1498 aa33.18■■■□□ 2.9
SIGIRR-204ENST00000525070 SMARCA2P51531 1590 aa33.13■■■□□ 2.89
SIGIRR-204ENST00000525070 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.12■■■□□ 2.89
SIGIRR-204ENST00000525070 HMGXB3Q12766 1538 aa32.97■■■□□ 2.87
SIGIRR-204ENST00000525070 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.91■■■□□ 2.86
SIGIRR-204ENST00000525070 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.9■■■□□ 2.86
SIGIRR-204ENST00000525070 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
SIGIRR-204ENST00000525070 WIZO95785 1651 aa32.55■■■□□ 2.8
SIGIRR-204ENST00000525070 ERCC6Q03468 1493 aa32.48■■■□□ 2.79
SIGIRR-204ENST00000525070 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
SIGIRR-204ENST00000525070 NESP48681 1621 aa32.39■■■□□ 2.78
SIGIRR-204ENST00000525070 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.36■■■□□ 2.77
SIGIRR-204ENST00000525070 CUX2O14529 1486 aa32.23■■■□□ 2.75
SIGIRR-204ENST00000525070 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
SIGIRR-204ENST00000525070 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.2■■■□□ 2.75
SIGIRR-204ENST00000525070 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.19■■■□□ 2.74
SIGIRR-204ENST00000525070 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.04■■■□□ 2.72
SIGIRR-204ENST00000525070 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
SIGIRR-204ENST00000525070 CFTRP13569 1480 aa31.93■■■□□ 2.7
SIGIRR-204ENST00000525070 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.83■■■□□ 2.69
SIGIRR-204ENST00000525070 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.82■■■□□ 2.68
SIGIRR-204ENST00000525070 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.81■■■□□ 2.68
SIGIRR-204ENST00000525070 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.81■■■□□ 2.68
SIGIRR-204ENST00000525070 PRDM2Q13029 1718 aa31.7■■■□□ 2.67
SIGIRR-204ENST00000525070 WDR62O43379 1518 aa31.7■■■□□ 2.66
SIGIRR-204ENST00000525070 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.6■■■□□ 2.65
SIGIRR-204ENST00000525070 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
SIGIRR-204ENST00000525070 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
SIGIRR-204ENST00000525070 ABCC8Q09428 1581 aa31.35■■■□□ 2.61
SIGIRR-204ENST00000525070 TOPBP1Q92547 1522 aa31.26■■■□□ 2.59
SIGIRR-204ENST00000525070 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.21■■■□□ 2.59
SIGIRR-204ENST00000525070 IFT140Q96RY7 1462 aa31.18■■■□□ 2.58
SIGIRR-204ENST00000525070 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
SIGIRR-204ENST00000525070 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
SIGIRR-204ENST00000525070 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
SIGIRR-204ENST00000525070 OSCARQ8IYS5 282 aa30.91■■■□□ 2.54
SIGIRR-204ENST00000525070 SOGA1O94964 1423 aa30.9■■■□□ 2.54
SIGIRR-204ENST00000525070 CUX1P39880 1505 aa30.88■■■□□ 2.53
SIGIRR-204ENST00000525070 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
SIGIRR-204ENST00000525070 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.85■■■□□ 2.53
SIGIRR-204ENST00000525070 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.82■■■□□ 2.53
SIGIRR-204ENST00000525070 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.81■■■□□ 2.52
SIGIRR-204ENST00000525070 WDR97A6NE52 1622 aa30.74■■■□□ 2.51
SIGIRR-204ENST00000525070 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
SIGIRR-204ENST00000525070 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.64■■■□□ 2.5
SIGIRR-204ENST00000525070 FBLN2P98095 1184 aa30.59■■■□□ 2.49
SIGIRR-204ENST00000525070 TOP2BQ02880 1626 aa30.58■■■□□ 2.49
SIGIRR-204ENST00000525070 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.58■■■□□ 2.49
SIGIRR-204ENST00000525070 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.57■■■□□ 2.48
SIGIRR-204ENST00000525070 GRIN2BQ13224 1484 aa30.56■■■□□ 2.48
SIGIRR-204ENST00000525070 CHD1O14646 1710 aa30.56■■■□□ 2.48
SIGIRR-204ENST00000525070 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.51■■■□□ 2.48
SIGIRR-204ENST00000525070 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.48
SIGIRR-204ENST00000525070 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.5■■■□□ 2.47
SIGIRR-204ENST00000525070 SYNJ1O43426 1573 aa30.5■■■□□ 2.47
SIGIRR-204ENST00000525070 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
SIGIRR-204ENST00000525070 PBRM1Q86U86 1689 aa30.45■■■□□ 2.46
SIGIRR-204ENST00000525070 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.43■■■□□ 2.46
SIGIRR-204ENST00000525070 TRIM41Q8WV44 630 aa30.42■■■□□ 2.46
SIGIRR-204ENST00000525070 SYNJ2O15056 1496 aa30.38■■■□□ 2.45
SIGIRR-204ENST00000525070 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.33■■■□□ 2.45
SIGIRR-204ENST00000525070 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.33■■■□□ 2.45
SIGIRR-204ENST00000525070 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.33■■■□□ 2.45
SIGIRR-204ENST00000525070 ARHGEF11O15085 1522 aa30.3■■■□□ 2.44
SIGIRR-204ENST00000525070 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.22■■■□□ 2.43
SIGIRR-204ENST00000525070 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.18■■■□□ 2.42
SIGIRR-204ENST00000525070 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.16■■■□□ 2.42
SIGIRR-204ENST00000525070 ADAMTS12P58397 1594 aa30.15■■■□□ 2.42
SIGIRR-204ENST00000525070 GRIN2AQ12879 1464 aa30.13■■■□□ 2.41
SIGIRR-204ENST00000525070 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.11■■■□□ 2.41
SIGIRR-204ENST00000525070 KIF27Q86VH2 1401 aa30.06■■■□□ 2.4
SIGIRR-204ENST00000525070 ARAP1Q96P48 1450 aa30■■■□□ 2.39
SIGIRR-204ENST00000525070 NUP160Q12769 1436 aa30■■■□□ 2.39
SIGIRR-204ENST00000525070 CEP170Q5SW79 1584 aa29.95■■■□□ 2.39
SIGIRR-204ENST00000525070 IGF1RP08069 1367 aa29.93■■■□□ 2.38
SIGIRR-204ENST00000525070 CUL7Q14999 1698 aa29.89■■■□□ 2.38
SIGIRR-204ENST00000525070 SHROOM2Q13796 1616 aa29.8■■■□□ 2.36
SIGIRR-204ENST00000525070 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.78■■■□□ 2.36
SIGIRR-204ENST00000525070 JPH4Q96JJ6 628 aa29.78■■■□□ 2.36
SIGIRR-204ENST00000525070 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.71■■■□□ 2.35
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