RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525059.1

PTDSS2-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS2, Length 1,258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-202ENST00000525059 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.32■■■■■ 5.65
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PTDSS2-202ENST00000525059 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.48■■■■■ 4.39
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PTDSS2-202ENST00000525059 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.16■■■■■ 4.34
PTDSS2-202ENST00000525059 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.05■■■■■ 4.32
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PTDSS2-202ENST00000525059 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.09■■■■■ 4.01
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PTDSS2-202ENST00000525059 NESP48681 1621 aa38.24■■■■□ 3.71
PTDSS2-202ENST00000525059 ERCC6Q03468 1493 aa38.24■■■■□ 3.71
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PTDSS2-202ENST00000525059 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.47■■■■□ 3.59
PTDSS2-202ENST00000525059 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.45■■■■□ 3.59
PTDSS2-202ENST00000525059 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.45■■■■□ 3.59
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PTDSS2-202ENST00000525059 TOPBP1Q92547 1522 aa36.83■■■■□ 3.49
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PTDSS2-202ENST00000525059 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
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PTDSS2-202ENST00000525059 CHD1O14646 1710 aa35.93■■■■□ 3.34
PTDSS2-202ENST00000525059 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.91■■■■□ 3.34
PTDSS2-202ENST00000525059 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.9■■■■□ 3.34
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PTDSS2-202ENST00000525059 SYNJ2O15056 1496 aa35.8■■■■□ 3.32
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PTDSS2-202ENST00000525059 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.52■■■■□ 3.28
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PTDSS2-202ENST00000525059 CEP170Q5SW79 1584 aa35.3■■■■□ 3.24
PTDSS2-202ENST00000525059 KIF27Q86VH2 1401 aa35.29■■■■□ 3.24
PTDSS2-202ENST00000525059 IGF1RP08069 1367 aa35.25■■■■□ 3.23
PTDSS2-202ENST00000525059 SHROOM2Q13796 1616 aa35.14■■■■□ 3.22
PTDSS2-202ENST00000525059 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.07■■■■□ 3.2
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PTDSS2-202ENST00000525059 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35■■■■□ 3.19
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