RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524875.1

SLC36A4-202, Transcript of solute carrier family 36 member 4, humanhuman

TSL 3

Gene SLC36A4, Length 711 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4-202ENST00000524875 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.63■■■■■ 6.34
SLC36A4-202ENST00000524875 ABCC9O60706 1549 aa49.32■■■■■ 5.49
SLC36A4-202ENST00000524875 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.14■■■■■ 5.46
SLC36A4-202ENST00000524875 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.88■■■■■ 5.1
SLC36A4-202ENST00000524875 NACADO15069 1562 aa46.52■■■■■ 5.04
SLC36A4-202ENST00000524875 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.49■■■■■ 5.03
SLC36A4-202ENST00000524875 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.09■■■■■ 4.97
SLC36A4-202ENST00000524875 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.85■■■■■ 4.93
SLC36A4-202ENST00000524875 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.85■■■■■ 4.93
SLC36A4-202ENST00000524875 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.79■■■■■ 4.92
SLC36A4-202ENST00000524875 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.53■■■■■ 4.88
SLC36A4-202ENST00000524875 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.23■■■■■ 4.83
SLC36A4-202ENST00000524875 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.16■■■■■ 4.82
SLC36A4-202ENST00000524875 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.96■■■■■ 4.79
SLC36A4-202ENST00000524875 SCRIBQ14160 1630 aa44.7■■■■■ 4.75
SLC36A4-202ENST00000524875 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.57■■■■■ 4.72
SLC36A4-202ENST00000524875 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.48■■■■■ 4.71
SLC36A4-202ENST00000524875 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
SLC36A4-202ENST00000524875 NCAPD3P42695 1498 aa42.96■■■■■ 4.47
SLC36A4-202ENST00000524875 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.89■■■■■ 4.46
SLC36A4-202ENST00000524875 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.77■■■■■ 4.44
SLC36A4-202ENST00000524875 CUX2O14529 1486 aa42.68■■■■■ 4.42
SLC36A4-202ENST00000524875 SMARCA4P51532 1647 aa42.66■■■■■ 4.42
SLC36A4-202ENST00000524875 SMARCA2P51531 1590 aa42.65■■■■■ 4.42
SLC36A4-202ENST00000524875 HMGXB3Q12766 1538 aa42.62■■■■■ 4.41
SLC36A4-202ENST00000524875 ERCC6Q03468 1493 aa42.61■■■■■ 4.41
SLC36A4-202ENST00000524875 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
SLC36A4-202ENST00000524875 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
SLC36A4-202ENST00000524875 NESP48681 1621 aa42.3■■■■■ 4.36
SLC36A4-202ENST00000524875 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.29■■■■■ 4.36
SLC36A4-202ENST00000524875 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.07■■■■■ 4.33
SLC36A4-202ENST00000524875 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.01■■■■■ 4.32
SLC36A4-202ENST00000524875 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
SLC36A4-202ENST00000524875 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.78■■■■■ 4.28
SLC36A4-202ENST00000524875 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.74■■■■■ 4.27
SLC36A4-202ENST00000524875 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.62■■■■■ 4.25
SLC36A4-202ENST00000524875 WIZO95785 1651 aa41.53■■■■■ 4.24
SLC36A4-202ENST00000524875 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.42■■■■■ 4.22
SLC36A4-202ENST00000524875 WDR62O43379 1518 aa41.35■■■■■ 4.21
SLC36A4-202ENST00000524875 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.21■■■■■ 4.19
SLC36A4-202ENST00000524875 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.14■■■■■ 4.18
SLC36A4-202ENST00000524875 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
SLC36A4-202ENST00000524875 CFTRP13569 1480 aa41.1■■■■■ 4.17
SLC36A4-202ENST00000524875 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
SLC36A4-202ENST00000524875 TRIM41Q8WV44 630 aa40.83■■■■■ 4.13
SLC36A4-202ENST00000524875 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
SLC36A4-202ENST00000524875 PRDM2Q13029 1718 aa40.64■■■■■ 4.1
SLC36A4-202ENST00000524875 OSCARQ8IYS5 282 aa40.63■■■■■ 4.09
SLC36A4-202ENST00000524875 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.55■■■■■ 4.08
SLC36A4-202ENST00000524875 IFT140Q96RY7 1462 aa40.4■■■■■ 4.06
SLC36A4-202ENST00000524875 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
SLC36A4-202ENST00000524875 TOPBP1Q92547 1522 aa40.33■■■■■ 4.05
SLC36A4-202ENST00000524875 ABCC8Q09428 1581 aa40.25■■■■■ 4.03
SLC36A4-202ENST00000524875 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.17■■■■■ 4.02
SLC36A4-202ENST00000524875 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.14■■■■■ 4.02
SLC36A4-202ENST00000524875 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.14■■■■■ 4.02
SLC36A4-202ENST00000524875 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.14■■■■■ 4.02
SLC36A4-202ENST00000524875 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
SLC36A4-202ENST00000524875 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
SLC36A4-202ENST00000524875 ARHGEF11O15085 1522 aa40.01■■■■□ 3.99
SLC36A4-202ENST00000524875 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.94■■■■□ 3.98
SLC36A4-202ENST00000524875 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
SLC36A4-202ENST00000524875 CHD1O14646 1710 aa39.84■■■■□ 3.97
SLC36A4-202ENST00000524875 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.74■■■■□ 3.95
SLC36A4-202ENST00000524875 SOGA1O94964 1423 aa39.7■■■■□ 3.95
SLC36A4-202ENST00000524875 FBLN2P98095 1184 aa39.67■■■■□ 3.94
SLC36A4-202ENST00000524875 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.67■■■■□ 3.94
SLC36A4-202ENST00000524875 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
SLC36A4-202ENST00000524875 WDR97A6NE52 1622 aa39.62■■■■□ 3.93
SLC36A4-202ENST00000524875 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.61■■■■□ 3.93
SLC36A4-202ENST00000524875 ARAP1Q96P48 1450 aa39.59■■■■□ 3.93
SLC36A4-202ENST00000524875 CUX1P39880 1505 aa39.55■■■■□ 3.92
SLC36A4-202ENST00000524875 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.53■■■■□ 3.92
SLC36A4-202ENST00000524875 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
SLC36A4-202ENST00000524875 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.43■■■■□ 3.9
SLC36A4-202ENST00000524875 GRIN2BQ13224 1484 aa39.41■■■■□ 3.9
SLC36A4-202ENST00000524875 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
SLC36A4-202ENST00000524875 SYNJ1O43426 1573 aa39.36■■■■□ 3.89
SLC36A4-202ENST00000524875 SYNJ2O15056 1496 aa39.31■■■■□ 3.88
SLC36A4-202ENST00000524875 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
SLC36A4-202ENST00000524875 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.23■■■■□ 3.87
SLC36A4-202ENST00000524875 PBRM1Q86U86 1689 aa39.21■■■■□ 3.87
SLC36A4-202ENST00000524875 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.18■■■■□ 3.86
SLC36A4-202ENST00000524875 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.14■■■■□ 3.86
SLC36A4-202ENST00000524875 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.84
SLC36A4-202ENST00000524875 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.96■■■■□ 3.83
SLC36A4-202ENST00000524875 GRIN2AQ12879 1464 aa38.91■■■■□ 3.82
SLC36A4-202ENST00000524875 ADAMTS12P58397 1594 aa38.86■■■■□ 3.81
SLC36A4-202ENST00000524875 TOP2BQ02880 1626 aa38.85■■■■□ 3.81
SLC36A4-202ENST00000524875 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.85■■■■□ 3.81
SLC36A4-202ENST00000524875 NUP160Q12769 1436 aa38.8■■■■□ 3.8
SLC36A4-202ENST00000524875 CEP170Q5SW79 1584 aa38.77■■■■□ 3.8
SLC36A4-202ENST00000524875 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.75■■■■□ 3.79
SLC36A4-202ENST00000524875 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.73■■■■□ 3.79
SLC36A4-202ENST00000524875 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.68■■■■□ 3.78
SLC36A4-202ENST00000524875 SHROOM2Q13796 1616 aa38.66■■■■□ 3.78
SLC36A4-202ENST00000524875 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
SLC36A4-202ENST00000524875 JPH4Q96JJ6 628 aa38.36■■■■□ 3.73
SLC36A4-202ENST00000524875 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.72
SLC36A4-202ENST00000524875 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.32■■■■□ 3.72
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