RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524720.5

SYBU-210, Transcript of syntabulin, humanhuman

TSL 3

Gene SYBU, Length 748 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYBU-210ENST00000524720 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.83■■■■■ 6.85
SYBU-210ENST00000524720 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.74■■■■■ 5.87
SYBU-210ENST00000524720 ABCC9O60706 1549 aa51.68■■■■■ 5.86
SYBU-210ENST00000524720 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.23■■■■■ 5.47
SYBU-210ENST00000524720 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.02■■■■■ 5.44
SYBU-210ENST00000524720 NACADO15069 1562 aa48.91■■■■■ 5.42
SYBU-210ENST00000524720 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.23■■■■■ 5.31
SYBU-210ENST00000524720 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.22■■■■■ 5.31
SYBU-210ENST00000524720 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.21■■■■■ 5.31
SYBU-210ENST00000524720 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.02■■■■■ 5.28
SYBU-210ENST00000524720 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.95■■■■■ 5.27
SYBU-210ENST00000524720 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.71■■■■■ 5.23
SYBU-210ENST00000524720 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.7■■■■■ 5.23
SYBU-210ENST00000524720 SCRIBQ14160 1630 aa47.28■■■■■ 5.16
SYBU-210ENST00000524720 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.08■■■■■ 5.13
SYBU-210ENST00000524720 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.62■■■■■ 5.05
SYBU-210ENST00000524720 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
SYBU-210ENST00000524720 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.51■■■■■ 5.04
SYBU-210ENST00000524720 NCAPD3P42695 1498 aa45.15■■■■■ 4.82
SYBU-210ENST00000524720 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.06■■■■■ 4.8
SYBU-210ENST00000524720 SMARCA4P51532 1647 aa45.06■■■■■ 4.8
SYBU-210ENST00000524720 SMARCA2P51531 1590 aa44.96■■■■■ 4.79
SYBU-210ENST00000524720 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.9■■■■■ 4.78
SYBU-210ENST00000524720 HMGXB3Q12766 1538 aa44.81■■■■■ 4.76
SYBU-210ENST00000524720 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.7■■■■■ 4.75
SYBU-210ENST00000524720 ERCC6Q03468 1493 aa44.66■■■■■ 4.74
SYBU-210ENST00000524720 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.58■■■■■ 4.73
SYBU-210ENST00000524720 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.55■■■■■ 4.72
SYBU-210ENST00000524720 NESP48681 1621 aa44.42■■■■■ 4.7
SYBU-210ENST00000524720 CUX2O14529 1486 aa44.38■■■■■ 4.69
SYBU-210ENST00000524720 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.14■■■■■ 4.66
SYBU-210ENST00000524720 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.11■■■■■ 4.65
SYBU-210ENST00000524720 WIZO95785 1651 aa44.07■■■■■ 4.65
SYBU-210ENST00000524720 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.92■■■■■ 4.62
SYBU-210ENST00000524720 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.84■■■■■ 4.61
SYBU-210ENST00000524720 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
SYBU-210ENST00000524720 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.81■■■■■ 4.6
SYBU-210ENST00000524720 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.75■■■■■ 4.59
SYBU-210ENST00000524720 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
SYBU-210ENST00000524720 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.49■■■■■ 4.55
SYBU-210ENST00000524720 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.38■■■■■ 4.54
SYBU-210ENST00000524720 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.36■■■■■ 4.53
SYBU-210ENST00000524720 CFTRP13569 1480 aa43.34■■■■■ 4.53
SYBU-210ENST00000524720 WDR62O43379 1518 aa43.32■■■■■ 4.52
SYBU-210ENST00000524720 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.05■■■■■ 4.48
SYBU-210ENST00000524720 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
SYBU-210ENST00000524720 PRDM2Q13029 1718 aa42.88■■■■■ 4.45
SYBU-210ENST00000524720 TOPBP1Q92547 1522 aa42.53■■■■■ 4.4
SYBU-210ENST00000524720 OSCARQ8IYS5 282 aa42.51■■■■■ 4.4
SYBU-210ENST00000524720 IFT140Q96RY7 1462 aa42.49■■■■■ 4.39
SYBU-210ENST00000524720 ABCC8Q09428 1581 aa42.48■■■■■ 4.39
SYBU-210ENST00000524720 TRIM41Q8WV44 630 aa42.46■■■■■ 4.39
SYBU-210ENST00000524720 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
SYBU-210ENST00000524720 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.39■■■■■ 4.38
SYBU-210ENST00000524720 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
SYBU-210ENST00000524720 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
SYBU-210ENST00000524720 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
SYBU-210ENST00000524720 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.09■■■■■ 4.33
SYBU-210ENST00000524720 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
SYBU-210ENST00000524720 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.99■■■■■ 4.31
SYBU-210ENST00000524720 SOGA1O94964 1423 aa41.99■■■■■ 4.31
SYBU-210ENST00000524720 FBLN2P98095 1184 aa41.93■■■■■ 4.3
SYBU-210ENST00000524720 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.91■■■■■ 4.3
SYBU-210ENST00000524720 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
SYBU-210ENST00000524720 CUX1P39880 1505 aa41.87■■■■■ 4.29
SYBU-210ENST00000524720 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.82■■■■■ 4.29
SYBU-210ENST00000524720 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.82■■■■■ 4.29
SYBU-210ENST00000524720 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.82■■■■■ 4.29
SYBU-210ENST00000524720 CHD1O14646 1710 aa41.8■■■■■ 4.28
SYBU-210ENST00000524720 ARHGEF11O15085 1522 aa41.72■■■■■ 4.27
SYBU-210ENST00000524720 WDR97A6NE52 1622 aa41.66■■■■■ 4.26
SYBU-210ENST00000524720 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.65■■■■■ 4.26
SYBU-210ENST00000524720 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
SYBU-210ENST00000524720 GRIN2BQ13224 1484 aa41.57■■■■■ 4.25
SYBU-210ENST00000524720 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.54■■■■■ 4.24
SYBU-210ENST00000524720 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
SYBU-210ENST00000524720 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.47■■■■■ 4.23
SYBU-210ENST00000524720 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.4■■■■■ 4.22
SYBU-210ENST00000524720 SYNJ2O15056 1496 aa41.39■■■■■ 4.22
SYBU-210ENST00000524720 PBRM1Q86U86 1689 aa41.37■■■■■ 4.21
SYBU-210ENST00000524720 SYNJ1O43426 1573 aa41.37■■■■■ 4.21
SYBU-210ENST00000524720 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.36■■■■■ 4.21
SYBU-210ENST00000524720 ARAP1Q96P48 1450 aa41.31■■■■■ 4.2
SYBU-210ENST00000524720 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.29■■■■■ 4.2
SYBU-210ENST00000524720 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.28■■■■■ 4.2
SYBU-210ENST00000524720 TOP2BQ02880 1626 aa41.26■■■■■ 4.19
SYBU-210ENST00000524720 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.22■■■■■ 4.19
SYBU-210ENST00000524720 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
SYBU-210ENST00000524720 GRIN2AQ12879 1464 aa41.02■■■■■ 4.16
SYBU-210ENST00000524720 ADAMTS12P58397 1594 aa40.98■■■■■ 4.15
SYBU-210ENST00000524720 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.93■■■■■ 4.14
SYBU-210ENST00000524720 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.89■■■■■ 4.14
SYBU-210ENST00000524720 CEP170Q5SW79 1584 aa40.83■■■■■ 4.13
SYBU-210ENST00000524720 NUP160Q12769 1436 aa40.83■■■■■ 4.13
SYBU-210ENST00000524720 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.69■■■■■ 4.11
SYBU-210ENST00000524720 SHROOM2Q13796 1616 aa40.58■■■■■ 4.09
SYBU-210ENST00000524720 KIF27Q86VH2 1401 aa40.54■■■■■ 4.08
SYBU-210ENST00000524720 JPH4Q96JJ6 628 aa40.53■■■■■ 4.08
SYBU-210ENST00000524720 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
SYBU-210ENST00000524720 IGF1RP08069 1367 aa40.47■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms