RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524546.5

FNTA-202, Transcript of farnesyltransferase, CAAX box, alpha, humanhuman

TSL 3

Gene FNTA, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTA-202ENST00000524546 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.09■■■■■ 6.73
FNTA-202ENST00000524546 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.92■■■■■ 5.74
FNTA-202ENST00000524546 ABCC9O60706 1549 aa50.36■■■■■ 5.65
FNTA-202ENST00000524546 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.13■■■■■ 5.3
FNTA-202ENST00000524546 NACADO15069 1562 aa47.97■■■■■ 5.27
FNTA-202ENST00000524546 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.86■■■■■ 5.25
FNTA-202ENST00000524546 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.51■■■■■ 5.2
FNTA-202ENST00000524546 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
FNTA-202ENST00000524546 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.22■■■■■ 5.15
FNTA-202ENST00000524546 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.15■■■■■ 5.14
FNTA-202ENST00000524546 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47■■■■■ 5.11
FNTA-202ENST00000524546 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.85■■■■■ 5.09
FNTA-202ENST00000524546 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.77■■■■■ 5.08
FNTA-202ENST00000524546 SCRIBQ14160 1630 aa46.5■■■■■ 5.03
FNTA-202ENST00000524546 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.08■■■■■ 4.97
FNTA-202ENST00000524546 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.57■■■■■ 4.89
FNTA-202ENST00000524546 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.53■■■■■ 4.88
FNTA-202ENST00000524546 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.25■■■■■ 4.83
FNTA-202ENST00000524546 SMARCA4P51532 1647 aa44.42■■■■■ 4.7
FNTA-202ENST00000524546 NCAPD3P42695 1498 aa44.3■■■■■ 4.68
FNTA-202ENST00000524546 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.28■■■■■ 4.68
FNTA-202ENST00000524546 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.22■■■■■ 4.67
FNTA-202ENST00000524546 SMARCA2P51531 1590 aa44.14■■■■■ 4.66
FNTA-202ENST00000524546 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.05■■■■■ 4.64
FNTA-202ENST00000524546 HMGXB3Q12766 1538 aa44.02■■■■■ 4.64
FNTA-202ENST00000524546 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.97■■■■■ 4.63
FNTA-202ENST00000524546 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
FNTA-202ENST00000524546 WIZO95785 1651 aa43.57■■■■■ 4.57
FNTA-202ENST00000524546 NESP48681 1621 aa43.49■■■■■ 4.55
FNTA-202ENST00000524546 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
FNTA-202ENST00000524546 ERCC6Q03468 1493 aa43.33■■■■■ 4.53
FNTA-202ENST00000524546 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.18■■■■■ 4.5
FNTA-202ENST00000524546 CUX2O14529 1486 aa43.05■■■■■ 4.48
FNTA-202ENST00000524546 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
FNTA-202ENST00000524546 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.97■■■■■ 4.47
FNTA-202ENST00000524546 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.95■■■■■ 4.47
FNTA-202ENST00000524546 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
FNTA-202ENST00000524546 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.87■■■■■ 4.45
FNTA-202ENST00000524546 CFTRP13569 1480 aa42.64■■■■■ 4.42
FNTA-202ENST00000524546 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.54■■■■■ 4.4
FNTA-202ENST00000524546 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.51■■■■■ 4.4
FNTA-202ENST00000524546 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.5■■■■■ 4.39
FNTA-202ENST00000524546 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.45■■■■■ 4.39
FNTA-202ENST00000524546 WDR62O43379 1518 aa42.41■■■■■ 4.38
FNTA-202ENST00000524546 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.35■■■■■ 4.37
FNTA-202ENST00000524546 PRDM2Q13029 1718 aa42.3■■■■■ 4.36
FNTA-202ENST00000524546 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
FNTA-202ENST00000524546 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
FNTA-202ENST00000524546 TOPBP1Q92547 1522 aa41.79■■■■■ 4.28
FNTA-202ENST00000524546 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.67■■■■■ 4.26
FNTA-202ENST00000524546 ABCC8Q09428 1581 aa41.63■■■■■ 4.26
FNTA-202ENST00000524546 IFT140Q96RY7 1462 aa41.58■■■■■ 4.25
FNTA-202ENST00000524546 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
FNTA-202ENST00000524546 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
FNTA-202ENST00000524546 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
FNTA-202ENST00000524546 CUX1P39880 1505 aa41.35■■■■■ 4.21
FNTA-202ENST00000524546 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
FNTA-202ENST00000524546 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.28■■■■■ 4.2
FNTA-202ENST00000524546 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.24■■■■■ 4.19
FNTA-202ENST00000524546 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.23■■■■■ 4.199e-7■■■□□ 18.2
FNTA-202ENST00000524546 SOGA1O94964 1423 aa41.19■■■■■ 4.18
FNTA-202ENST00000524546 OSCARQ8IYS5 282 aa41.18■■■■■ 4.18
FNTA-202ENST00000524546 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
FNTA-202ENST00000524546 WDR97A6NE52 1622 aa40.96■■■■■ 4.15
FNTA-202ENST00000524546 CHD1O14646 1710 aa40.93■■■■■ 4.14
FNTA-202ENST00000524546 SYNJ1O43426 1573 aa40.84■■■■■ 4.13
FNTA-202ENST00000524546 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.83■■■■■ 4.13
FNTA-202ENST00000524546 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.83■■■■■ 4.13
FNTA-202ENST00000524546 TOP2BQ02880 1626 aa40.82■■■■■ 4.12
FNTA-202ENST00000524546 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.81■■■■■ 4.12
FNTA-202ENST00000524546 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.79■■■■■ 4.12
FNTA-202ENST00000524546 FBLN2P98095 1184 aa40.75■■■■■ 4.11
FNTA-202ENST00000524546 TRIM41Q8WV44 630 aa40.75■■■■■ 4.11
FNTA-202ENST00000524546 GRIN2BQ13224 1484 aa40.75■■■■■ 4.11
FNTA-202ENST00000524546 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.71■■■■■ 4.11
FNTA-202ENST00000524546 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.71■■■■■ 4.11
FNTA-202ENST00000524546 PBRM1Q86U86 1689 aa40.7■■■■■ 4.11
FNTA-202ENST00000524546 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.67■■■■■ 4.1
FNTA-202ENST00000524546 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.67■■■■■ 4.1
FNTA-202ENST00000524546 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.67■■■■■ 4.1
FNTA-202ENST00000524546 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
FNTA-202ENST00000524546 ARHGEF11O15085 1522 aa40.58■■■■■ 4.09
FNTA-202ENST00000524546 SYNJ2O15056 1496 aa40.55■■■■■ 4.08
FNTA-202ENST00000524546 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
FNTA-202ENST00000524546 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.45■■■■■ 4.07
FNTA-202ENST00000524546 ADAMTS12P58397 1594 aa40.34■■■■■ 4.05
FNTA-202ENST00000524546 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.26■■■■■ 4.04
FNTA-202ENST00000524546 ARAP1Q96P48 1450 aa40.26■■■■■ 4.04
FNTA-202ENST00000524546 GRIN2AQ12879 1464 aa40.25■■■■■ 4.03
FNTA-202ENST00000524546 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.23■■■■■ 4.03
FNTA-202ENST00000524546 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.2■■■■■ 4.03
FNTA-202ENST00000524546 CEP170Q5SW79 1584 aa40.14■■■■■ 4.02
FNTA-202ENST00000524546 NUP160Q12769 1436 aa40.1■■■■■ 4.01
FNTA-202ENST00000524546 KIF27Q86VH2 1401 aa39.96■■■■□ 3.99
FNTA-202ENST00000524546 IGF1RP08069 1367 aa39.96■■■■□ 3.99
FNTA-202ENST00000524546 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.94■■■■□ 3.98
FNTA-202ENST00000524546 SHROOM2Q13796 1616 aa39.88■■■■□ 3.97
FNTA-202ENST00000524546 CUL7Q14999 1698 aa39.8■■■■□ 3.96
FNTA-202ENST00000524546 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.75■■■■□ 3.95
FNTA-202ENST00000524546 JPH4Q96JJ6 628 aa39.67■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.9 ms