RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524319.1

ANKRD46-211, Transcript of ankyrin repeat domain 46, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ANKRD46, Length 1,648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD46-211ENST00000524319 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.52■■■■■ 5.04
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ANKRD46-211ENST00000524319 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.23■■■■□ 3.71
ANKRD46-211ENST00000524319 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.19■■■■□ 3.7
ANKRD46-211ENST00000524319 NACADO15069 1562 aa38■■■■□ 3.67
ANKRD46-211ENST00000524319 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.72■■■■□ 3.63
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ANKRD46-211ENST00000524319 SCRIBQ14160 1630 aa37.37■■■■□ 3.57
ANKRD46-211ENST00000524319 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.08■■■■□ 3.53
ANKRD46-211ENST00000524319 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.64■■■■□ 3.46
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ANKRD46-211ENST00000524319 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.14■■■■□ 3.38
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ANKRD46-211ENST00000524319 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
ANKRD46-211ENST00000524319 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
ANKRD46-211ENST00000524319 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.92■■■■□ 3.34
ANKRD46-211ENST00000524319 SMARCA4P51532 1647 aa35.86■■■■□ 3.33
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ANKRD46-211ENST00000524319 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.47■■■■□ 3.27
ANKRD46-211ENST00000524319 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.28■■■■□ 3.24
ANKRD46-211ENST00000524319 SMARCA2P51531 1590 aa35.28■■■■□ 3.24
ANKRD46-211ENST00000524319 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
ANKRD46-211ENST00000524319 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.06■■■■□ 3.2
ANKRD46-211ENST00000524319 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
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ANKRD46-211ENST00000524319 HMGXB3Q12766 1538 aa35.02■■■■□ 3.2
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ANKRD46-211ENST00000524319 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.36■■■■□ 3.09
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ANKRD46-211ENST00000524319 PRDM2Q13029 1718 aa34.14■■■■□ 3.06
ANKRD46-211ENST00000524319 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.06■■■■□ 3.04
ANKRD46-211ENST00000524319 ABCC8Q09428 1581 aa34.03■■■■□ 3.04
ANKRD46-211ENST00000524319 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.92■■■■□ 3.02
ANKRD46-211ENST00000524319 NESP48681 1621 aa33.88■■■■□ 3.01
ANKRD46-211ENST00000524319 TRIM41Q8WV44 630 aa33.86■■■■□ 3.01
ANKRD46-211ENST00000524319 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.82■■■■□ 3
ANKRD46-211ENST00000524319 SYNJ1O43426 1573 aa33.77■■■■□ 3
ANKRD46-211ENST00000524319 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.71■■■□□ 2.99
ANKRD46-211ENST00000524319 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.67■■■□□ 2.98
ANKRD46-211ENST00000524319 TOP2BQ02880 1626 aa33.66■■■□□ 2.98
ANKRD46-211ENST00000524319 CUX1P39880 1505 aa33.61■■■□□ 2.97
ANKRD46-211ENST00000524319 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.57■■■□□ 2.96
ANKRD46-211ENST00000524319 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.57■■■□□ 2.96
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ANKRD46-211ENST00000524319 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.42■■■□□ 2.94
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ANKRD46-211ENST00000524319 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.27■■■□□ 2.92
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ANKRD46-211ENST00000524319 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
ANKRD46-211ENST00000524319 ERCC6Q03468 1493 aa33.14■■■□□ 2.9
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ANKRD46-211ENST00000524319 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
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ANKRD46-211ENST00000524319 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33■■■□□ 2.87
ANKRD46-211ENST00000524319 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.98■■■□□ 2.87
ANKRD46-211ENST00000524319 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.98■■■□□ 2.87
ANKRD46-211ENST00000524319 KIF27Q86VH2 1401 aa32.97■■■□□ 2.87
ANKRD46-211ENST00000524319 CUX2O14529 1486 aa32.96■■■□□ 2.87
ANKRD46-211ENST00000524319 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.95■■■□□ 2.87
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ANKRD46-211ENST00000524319 KIF21BO75037 1637 aa32.86■■■□□ 2.85
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ANKRD46-211ENST00000524319 IFT140Q96RY7 1462 aa32.76■■■□□ 2.83
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ANKRD46-211ENST00000524319 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
ANKRD46-211ENST00000524319 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.53■■■□□ 2.8
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ANKRD46-211ENST00000524319 GRIN2BQ13224 1484 aa32.44■■■□□ 2.78
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ANKRD46-211ENST00000524319 CEP162Q5TB80 1403 aa32.34■■■□□ 2.77
ANKRD46-211ENST00000524319 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.29■■■□□ 2.76
ANKRD46-211ENST00000524319 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.26■■■□□ 2.76
ANKRD46-211ENST00000524319 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
ANKRD46-211ENST00000524319 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.22■■■□□ 2.75
ANKRD46-211ENST00000524319 CLIP1P30622 1438 aa32.15■■■□□ 2.74
ANKRD46-211ENST00000524319 SYNJ2O15056 1496 aa32.09■■■□□ 2.73
ANKRD46-211ENST00000524319 GRIN2AQ12879 1464 aa32.07■■■□□ 2.72
ANKRD46-211ENST00000524319 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.98■■■□□ 2.71
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