RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524318.3

SFTPC-211, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

TSL 3

Gene SFTPC, Length 993 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-211ENST00000524318 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.98■■□□□ 1.75
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SFTPC-211ENST00000524318 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.1■■□□□ 1.13
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SFTPC-211ENST00000524318 NACADO15069 1562 aa21.97■■□□□ 1.11
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SFTPC-211ENST00000524318 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.69■■□□□ 1.06
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SFTPC-211ENST00000524318 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.93■□□□□ 0.94
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SFTPC-211ENST00000524318 SMARCA2P51531 1590 aa20.18■□□□□ 0.82
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SFTPC-211ENST00000524318 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.02■□□□□ 0.8
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SFTPC-211ENST00000524318 CUX2O14529 1486 aa19.93■□□□□ 0.78
SFTPC-211ENST00000524318 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.88■□□□□ 0.77
SFTPC-211ENST00000524318 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.8■□□□□ 0.76
SFTPC-211ENST00000524318 WIZO95785 1651 aa19.78■□□□□ 0.76
SFTPC-211ENST00000524318 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.72■□□□□ 0.75
SFTPC-211ENST00000524318 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.7■□□□□ 0.74
SFTPC-211ENST00000524318 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
SFTPC-211ENST00000524318 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.66■□□□□ 0.74
SFTPC-211ENST00000524318 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
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SFTPC-211ENST00000524318 CFTRP13569 1480 aa19.48■□□□□ 0.71
SFTPC-211ENST00000524318 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.47■□□□□ 0.71
SFTPC-211ENST00000524318 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.47■□□□□ 0.71
SFTPC-211ENST00000524318 WDR62O43379 1518 aa19.45■□□□□ 0.7
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SFTPC-211ENST00000524318 OSCARQ8IYS5 282 aa19.12■□□□□ 0.65
SFTPC-211ENST00000524318 TOPBP1Q92547 1522 aa19.1■□□□□ 0.65
SFTPC-211ENST00000524318 ABCC8Q09428 1581 aa19.08■□□□□ 0.65
SFTPC-211ENST00000524318 IFT140Q96RY7 1462 aa19.08■□□□□ 0.64
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SFTPC-211ENST00000524318 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
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SFTPC-211ENST00000524318 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.85■□□□□ 0.61
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SFTPC-211ENST00000524318 FBLN2P98095 1184 aa18.81■□□□□ 0.6
SFTPC-211ENST00000524318 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.8■□□□□ 0.6
SFTPC-211ENST00000524318 CUX1P39880 1505 aa18.79■□□□□ 0.6
SFTPC-211ENST00000524318 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.78■□□□□ 0.6
SFTPC-211ENST00000524318 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.78■□□□□ 0.6
SFTPC-211ENST00000524318 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.78■□□□□ 0.6
SFTPC-211ENST00000524318 CHD1O14646 1710 aa18.75■□□□□ 0.59
SFTPC-211ENST00000524318 ARHGEF11O15085 1522 aa18.73■□□□□ 0.59
SFTPC-211ENST00000524318 WDR97A6NE52 1622 aa18.71■□□□□ 0.58
SFTPC-211ENST00000524318 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
SFTPC-211ENST00000524318 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.68■□□□□ 0.58
SFTPC-211ENST00000524318 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.67■□□□□ 0.58
SFTPC-211ENST00000524318 GRIN2BQ13224 1484 aa18.66■□□□□ 0.58
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SFTPC-211ENST00000524318 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.62■□□□□ 0.57
SFTPC-211ENST00000524318 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.59■□□□□ 0.57
SFTPC-211ENST00000524318 SYNJ2O15056 1496 aa18.58■□□□□ 0.56
SFTPC-211ENST00000524318 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.56
SFTPC-211ENST00000524318 SYNJ1O43426 1573 aa18.55■□□□□ 0.56
SFTPC-211ENST00000524318 PBRM1Q86U86 1689 aa18.55■□□□□ 0.56
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SFTPC-211ENST00000524318 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.54■□□□□ 0.56
SFTPC-211ENST00000524318 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.53■□□□□ 0.56
SFTPC-211ENST00000524318 TOP2BQ02880 1626 aa18.52■□□□□ 0.55
SFTPC-211ENST00000524318 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.5■□□□□ 0.55
SFTPC-211ENST00000524318 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SFTPC-211ENST00000524318 GRIN2AQ12879 1464 aa18.41■□□□□ 0.54
SFTPC-211ENST00000524318 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.39■□□□□ 0.53
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SFTPC-211ENST00000524318 NUP160Q12769 1436 aa18.34■□□□□ 0.53
SFTPC-211ENST00000524318 CEP170Q5SW79 1584 aa18.33■□□□□ 0.52
SFTPC-211ENST00000524318 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.28■□□□□ 0.52
SFTPC-211ENST00000524318 JPH4Q96JJ6 628 aa18.23■□□□□ 0.51
SFTPC-211ENST00000524318 SHROOM2Q13796 1616 aa18.23■□□□□ 0.51
SFTPC-211ENST00000524318 IGF1RP08069 1367 aa18.2■□□□□ 0.5
SFTPC-211ENST00000524318 KIF27Q86VH2 1401 aa18.19■□□□□ 0.5
SFTPC-211ENST00000524318 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
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