RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524168.1

LOXL2-215, Transcript of lysyl oxidase like 2, human

TSL 3

Gene LOXL2, Length 746 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LOXL2-215	ENST00000524168	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		44.46	■■■■■ 4.71
LOXL2-215	ENST00000524168	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.83	■■■■□ 3.97
LOXL2-215	ENST00000524168	ABCC9	O60706	1549 aa		39.77	■■■■□ 3.96
LOXL2-215	ENST00000524168	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.92	■■■■□ 3.66
LOXL2-215	ENST00000524168	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.72	■■■■□ 3.63
LOXL2-215	ENST00000524168	NACAD	O15069	1562 aa		37.67	■■■■□ 3.62
LOXL2-215	ENST00000524168	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.14	■■■■□ 3.54
LOXL2-215	ENST00000524168	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		37.12	■■■■□ 3.53
LOXL2-215	ENST00000524168	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.09	■■■■□ 3.53
LOXL2-215	ENST00000524168	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.95	■■■■□ 3.51
LOXL2-215	ENST00000524168	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	36.84	■■■■□ 3.49
LOXL2-215	ENST00000524168	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		36.71	■■■■□ 3.47
LOXL2-215	ENST00000524168	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.68	■■■■□ 3.46
LOXL2-215	ENST00000524168	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.34	■■■■□ 3.41
LOXL2-215	ENST00000524168	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.29	■■■■□ 3.4
LOXL2-215	ENST00000524168	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.89	■■■■□ 3.34
LOXL2-215	ENST00000524168	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.84	■■■■□ 3.33
LOXL2-215	ENST00000524168	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.81	■■■■□ 3.32
LOXL2-215	ENST00000524168	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.75	■■■■□ 3.15
LOXL2-215	ENST00000524168	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.66	■■■■□ 3.14
LOXL2-215	ENST00000524168	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.65	■■■■□ 3.14
LOXL2-215	ENST00000524168	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.62	■■■■□ 3.13
LOXL2-215	ENST00000524168	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.54	■■■■□ 3.12
LOXL2-215	ENST00000524168	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.49	■■■■□ 3.11
LOXL2-215	ENST00000524168	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.42	■■■■□ 3.1
LOXL2-215	ENST00000524168	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.39	■■■■□ 3.1
LOXL2-215	ENST00000524168	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.27	■■■■□ 3.08
LOXL2-215	ENST00000524168	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.24	■■■■□ 3.07
LOXL2-215	ENST00000524168	CUX2	O14529	1486 aa		34.22	■■■■□ 3.07
LOXL2-215	ENST00000524168	NES	P48681	1621 aa		34.15	■■■■□ 3.06
LOXL2-215	ENST00000524168	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		34.08	■■■■□ 3.05
LOXL2-215	ENST00000524168	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.97	■■■■□ 3.03
LOXL2-215	ENST00000524168	WIZ	O95785	1651 aa		33.85	■■■■□ 3.01
LOXL2-215	ENST00000524168	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.84	■■■■□ 3.01
LOXL2-215	ENST00000524168	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.74	■■■□□ 2.99
LOXL2-215	ENST00000524168	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.73	■■■□□ 2.99
LOXL2-215	ENST00000524168	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.71	■■■□□ 2.99
LOXL2-215	ENST00000524168	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
LOXL2-215	ENST00000524168	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.48	■■■□□ 2.95
LOXL2-215	ENST00000524168	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
LOXL2-215	ENST00000524168	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.4	■■■□□ 2.94
LOXL2-215	ENST00000524168	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.36	■■■□□ 2.93
LOXL2-215	ENST00000524168	WDR62	O43379	1518 aa		33.34	■■■□□ 2.93
LOXL2-215	ENST00000524168	CFTR	P13569	1480 aa		33.34	■■■□□ 2.93
LOXL2-215	ENST00000524168	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.08	■■■□□ 2.89
LOXL2-215	ENST00000524168	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
LOXL2-215	ENST00000524168	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LOXL2-215	ENST00000524168	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.79	■■■□□ 2.84
LOXL2-215	ENST00000524168	TRIM41	Q8WV44	630 aa		32.74	■■■□□ 2.83
LOXL2-215	ENST00000524168	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.73	■■■□□ 2.83
LOXL2-215	ENST00000524168	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.73	■■■□□ 2.83
LOXL2-215	ENST00000524168	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.72	■■■□□ 2.83
LOXL2-215	ENST00000524168	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.62	■■■□□ 2.81
LOXL2-215	ENST00000524168	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
LOXL2-215	ENST00000524168	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
LOXL2-215	ENST00000524168	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
LOXL2-215	ENST00000524168	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
LOXL2-215	ENST00000524168	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
LOXL2-215	ENST00000524168	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.36	■■■□□ 2.77
LOXL2-215	ENST00000524168	SOGA1	O94964	1423 aa		32.31	■■■□□ 2.76
LOXL2-215	ENST00000524168	FBLN2	P98095	1184 aa		32.29	■■■□□ 2.76
LOXL2-215	ENST00000524168	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.27	■■■□□ 2.76
LOXL2-215	ENST00000524168	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
LOXL2-215	ENST00000524168	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.22	■■■□□ 2.75
LOXL2-215	ENST00000524168	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.21	■■■□□ 2.75
LOXL2-215	ENST00000524168	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.21	■■■□□ 2.75
LOXL2-215	ENST00000524168	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.21	■■■□□ 2.75
LOXL2-215	ENST00000524168	CHD1	O14646	1710 aa		32.17	■■■□□ 2.74
LOXL2-215	ENST00000524168	CUX1	P39880	1505 aa		32.17	■■■□□ 2.74
LOXL2-215	ENST00000524168	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.13	■■■□□ 2.73
LOXL2-215	ENST00000524168	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.1	■■■□□ 2.73
LOXL2-215	ENST00000524168	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
LOXL2-215	ENST00000524168	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.03	■■■□□ 2.72
LOXL2-215	ENST00000524168	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.01	■■■□□ 2.71
LOXL2-215	ENST00000524168	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32	■■■□□ 2.71
LOXL2-215	ENST00000524168	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
LOXL2-215	ENST00000524168	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.91	■■■□□ 2.7
LOXL2-215	ENST00000524168	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.86	■■■□□ 2.69
LOXL2-215	ENST00000524168	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.86	■■■□□ 2.69
LOXL2-215	ENST00000524168	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.85	■■■□□ 2.69
LOXL2-215	ENST00000524168	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	31.83	■■■□□ 2.69
LOXL2-215	ENST00000524168	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.83	■■■□□ 2.69
LOXL2-215	ENST00000524168	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.8	■■■□□ 2.68
LOXL2-215	ENST00000524168	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.76	■■■□□ 2.68
LOXL2-215	ENST00000524168	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.75	■■■□□ 2.67
LOXL2-215	ENST00000524168	TOP2B	Q02880	1626 aa		31.71	■■■□□ 2.67
LOXL2-215	ENST00000524168	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		31.69	■■■□□ 2.66
LOXL2-215	ENST00000524168	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
LOXL2-215	ENST00000524168	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.55	■■■□□ 2.64
LOXL2-215	ENST00000524168	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.51	■■■□□ 2.64
LOXL2-215	ENST00000524168	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.5	■■■□□ 2.63
LOXL2-215	ENST00000524168	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.47	■■■□□ 2.63
LOXL2-215	ENST00000524168	NUP160	Q12769	1436 aa		31.41	■■■□□ 2.62
LOXL2-215	ENST00000524168	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.39	■■■□□ 2.61
LOXL2-215	ENST00000524168	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.27	■■■□□ 2.6
LOXL2-215	ENST00000524168	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.22	■■■□□ 2.59
LOXL2-215	ENST00000524168	JPH4	Q96JJ6	628 aa		31.21	■■■□□ 2.59
LOXL2-215	ENST00000524168	KIF27	Q86VH2	1401 aa		31.19	■■■□□ 2.58
LOXL2-215	ENST00000524168	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
LOXL2-215	ENST00000524168	IGF1R	P08069	1367 aa		31.1	■■■□□ 2.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms