RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523456.1

PDGFRB-211, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 2

Gene PDGFRB, Length 1,023 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-211ENST00000523456 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.9■■■□□ 2.06
PDGFRB-211ENST00000523456 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.06■■□□□ 1.6
PDGFRB-211ENST00000523456 ABCC9O60706 1549 aa24.79■■□□□ 1.56
PDGFRB-211ENST00000523456 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.92■■□□□ 1.42
PDGFRB-211ENST00000523456 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.77■■□□□ 1.4
PDGFRB-211ENST00000523456 NACADO15069 1562 aa23.66■■□□□ 1.38
PDGFRB-211ENST00000523456 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.48■■□□□ 1.35
PDGFRB-211ENST00000523456 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.27■■□□□ 1.32
PDGFRB-211ENST00000523456 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.17■■□□□ 1.3
PDGFRB-211ENST00000523456 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PDGFRB-211ENST00000523456 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.15■■□□□ 1.3
PDGFRB-211ENST00000523456 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
PDGFRB-211ENST00000523456 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.03■■□□□ 1.28
PDGFRB-211ENST00000523456 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.92■■□□□ 1.26
PDGFRB-211ENST00000523456 SCRIBQ14160 1630 aa22.68■■□□□ 1.22
PDGFRB-211ENST00000523456 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PDGFRB-211ENST00000523456 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.46■■□□□ 1.19
PDGFRB-211ENST00000523456 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.42■■□□□ 1.18
PDGFRB-211ENST00000523456 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.39■■□□□ 1.17
PDGFRB-211ENST00000523456 NCAPD3P42695 1498 aa21.84■■□□□ 1.09
PDGFRB-211ENST00000523456 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.73■■□□□ 1.07
PDGFRB-211ENST00000523456 SMARCA4P51532 1647 aa21.73■■□□□ 1.07
PDGFRB-211ENST00000523456 SMARCA2P51531 1590 aa21.72■■□□□ 1.07
PDGFRB-211ENST00000523456 HMGXB3Q12766 1538 aa21.7■■□□□ 1.06
PDGFRB-211ENST00000523456 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PDGFRB-211ENST00000523456 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.61■■□□□ 1.05
PDGFRB-211ENST00000523456 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PDGFRB-211ENST00000523456 CUX2O14529 1486 aa21.5■■□□□ 1.03
PDGFRB-211ENST00000523456 ERCC6Q03468 1493 aa21.44■■□□□ 1.02
PDGFRB-211ENST00000523456 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.44■■□□□ 1.02
PDGFRB-211ENST00000523456 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.32■■□□□ 1
PDGFRB-211ENST00000523456 NESP48681 1621 aa21.31■■□□□ 1
PDGFRB-211ENST00000523456 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.18■□□□□ 0.98
PDGFRB-211ENST00000523456 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PDGFRB-211ENST00000523456 WIZO95785 1651 aa21.15■□□□□ 0.98
PDGFRB-211ENST00000523456 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.14■□□□□ 0.98
PDGFRB-211ENST00000523456 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.07■□□□□ 0.96
PDGFRB-211ENST00000523456 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PDGFRB-211ENST00000523456 TRIM41Q8WV44 630 aa21.05■□□□□ 0.96
PDGFRB-211ENST00000523456 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PDGFRB-211ENST00000523456 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.97■□□□□ 0.95
PDGFRB-211ENST00000523456 CFTRP13569 1480 aa20.94■□□□□ 0.94
PDGFRB-211ENST00000523456 WDR62O43379 1518 aa20.94■□□□□ 0.94
PDGFRB-211ENST00000523456 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.89■□□□□ 0.94
PDGFRB-211ENST00000523456 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.87■□□□□ 0.93
PDGFRB-211ENST00000523456 PRDM2Q13029 1718 aa20.73■□□□□ 0.91
PDGFRB-211ENST00000523456 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.69■□□□□ 0.9
PDGFRB-211ENST00000523456 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PDGFRB-211ENST00000523456 ABCC8Q09428 1581 aa20.55■□□□□ 0.88
PDGFRB-211ENST00000523456 IFT140Q96RY7 1462 aa20.51■□□□□ 0.87
PDGFRB-211ENST00000523456 TOPBP1Q92547 1522 aa20.48■□□□□ 0.87
PDGFRB-211ENST00000523456 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.44■□□□□ 0.86
PDGFRB-211ENST00000523456 OSCARQ8IYS5 282 aa20.43■□□□□ 0.86
PDGFRB-211ENST00000523456 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PDGFRB-211ENST00000523456 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PDGFRB-211ENST00000523456 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PDGFRB-211ENST00000523456 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PDGFRB-211ENST00000523456 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.25■□□□□ 0.83
PDGFRB-211ENST00000523456 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.25■□□□□ 0.83
PDGFRB-211ENST00000523456 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.25■□□□□ 0.83
PDGFRB-211ENST00000523456 WDR97A6NE52 1622 aa20.24■□□□□ 0.83
PDGFRB-211ENST00000523456 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
PDGFRB-211ENST00000523456 SOGA1O94964 1423 aa20.18■□□□□ 0.82
PDGFRB-211ENST00000523456 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.15■□□□□ 0.82
PDGFRB-211ENST00000523456 CUX1P39880 1505 aa20.14■□□□□ 0.81
PDGFRB-211ENST00000523456 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.13■□□□□ 0.81
PDGFRB-211ENST00000523456 ARHGEF11O15085 1522 aa20.11■□□□□ 0.81
PDGFRB-211ENST00000523456 CHD1O14646 1710 aa20.1■□□□□ 0.81
PDGFRB-211ENST00000523456 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PDGFRB-211ENST00000523456 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PDGFRB-211ENST00000523456 GRIN2BQ13224 1484 aa20.03■□□□□ 0.8
PDGFRB-211ENST00000523456 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.02■□□□□ 0.8
PDGFRB-211ENST00000523456 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PDGFRB-211ENST00000523456 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.99■□□□□ 0.79
PDGFRB-211ENST00000523456 SYNJ2O15056 1496 aa19.97■□□□□ 0.79
PDGFRB-211ENST00000523456 FBLN2P98095 1184 aa19.96■□□□□ 0.79
PDGFRB-211ENST00000523456 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.96■□□□□ 0.79
PDGFRB-211ENST00000523456 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.95■□□□□ 0.78
PDGFRB-211ENST00000523456 SYNJ1O43426 1573 aa19.95■□□□□ 0.78
PDGFRB-211ENST00000523456 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.94■□□□□ 0.78
PDGFRB-211ENST00000523456 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.94■□□□□ 0.78
PDGFRB-211ENST00000523456 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
PDGFRB-211ENST00000523456 PBRM1Q86U86 1689 aa19.91■□□□□ 0.78
PDGFRB-211ENST00000523456 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
PDGFRB-211ENST00000523456 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.91■□□□□ 0.78
PDGFRB-211ENST00000523456 ARAP1Q96P48 1450 aa19.91■□□□□ 0.78
PDGFRB-211ENST00000523456 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.9■□□□□ 0.78
PDGFRB-211ENST00000523456 TOP2BQ02880 1626 aa19.89■□□□□ 0.77
PDGFRB-211ENST00000523456 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
PDGFRB-211ENST00000523456 ADAMTS12P58397 1594 aa19.76■□□□□ 0.75
PDGFRB-211ENST00000523456 GRIN2AQ12879 1464 aa19.76■□□□□ 0.75
PDGFRB-211ENST00000523456 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.76■□□□□ 0.75
PDGFRB-211ENST00000523456 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.73■□□□□ 0.75
PDGFRB-211ENST00000523456 NUP160Q12769 1436 aa19.73■□□□□ 0.75
PDGFRB-211ENST00000523456 CEP170Q5SW79 1584 aa19.66■□□□□ 0.74
PDGFRB-211ENST00000523456 SHROOM2Q13796 1616 aa19.63■□□□□ 0.73
PDGFRB-211ENST00000523456 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.54■□□□□ 0.72
PDGFRB-211ENST00000523456 KIF27Q86VH2 1401 aa19.51■□□□□ 0.71
PDGFRB-211ENST00000523456 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.49■□□□□ 0.71
PDGFRB-211ENST00000523456 CUL7Q14999 1698 aa19.47■□□□□ 0.71
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