RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522821.5

TTC13-209, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

TSL 4

Gene TTC13, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-209ENST00000522821 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.66■■■■■ 6.82
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TTC13-209ENST00000522821 ABCC9O60706 1549 aa51.3■■■■■ 5.8
TTC13-209ENST00000522821 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.94■■■■■ 5.42
TTC13-209ENST00000522821 NACADO15069 1562 aa48.68■■■■■ 5.38
TTC13-209ENST00000522821 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.53■■■■■ 5.36
TTC13-209ENST00000522821 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.12■■■■■ 5.29
TTC13-209ENST00000522821 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.88■■■■■ 5.26
TTC13-209ENST00000522821 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.84■■■■■ 5.25
TTC13-209ENST00000522821 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.82■■■■■ 5.25
TTC13-209ENST00000522821 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.78■■■■■ 5.24
TTC13-209ENST00000522821 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.64■■■■■ 5.22
TTC13-209ENST00000522821 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.52■■■■■ 5.2
TTC13-209ENST00000522821 SCRIBQ14160 1630 aa47.05■■■■■ 5.12
TTC13-209ENST00000522821 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.9■■■■■ 5.1
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TTC13-209ENST00000522821 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.32■■■■■ 5.01
TTC13-209ENST00000522821 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.17■■■■■ 4.98
TTC13-209ENST00000522821 NCAPD3P42695 1498 aa44.96■■■■■ 4.79
TTC13-209ENST00000522821 SMARCA4P51532 1647 aa44.9■■■■■ 4.78
TTC13-209ENST00000522821 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.88■■■■■ 4.78
TTC13-209ENST00000522821 SMARCA2P51531 1590 aa44.75■■■■■ 4.75
TTC13-209ENST00000522821 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
TTC13-209ENST00000522821 HMGXB3Q12766 1538 aa44.65■■■■■ 4.74
TTC13-209ENST00000522821 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.47■■■■■ 4.71
TTC13-209ENST00000522821 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.46■■■■■ 4.71
TTC13-209ENST00000522821 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.45■■■■■ 4.71
TTC13-209ENST00000522821 ERCC6Q03468 1493 aa44.26■■■■■ 4.68
TTC13-209ENST00000522821 NESP48681 1621 aa44.17■■■■■ 4.66
TTC13-209ENST00000522821 CUX2O14529 1486 aa44.05■■■■■ 4.64
TTC13-209ENST00000522821 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.96■■■■■ 4.63
TTC13-209ENST00000522821 WIZO95785 1651 aa43.91■■■■■ 4.62
TTC13-209ENST00000522821 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.87■■■■■ 4.61
TTC13-209ENST00000522821 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
TTC13-209ENST00000522821 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.58
TTC13-209ENST00000522821 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.63■■■■■ 4.57
TTC13-209ENST00000522821 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.62■■■■■ 4.57
TTC13-209ENST00000522821 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.56■■■■■ 4.56
TTC13-209ENST00000522821 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
TTC13-209ENST00000522821 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.25■■■■■ 4.51
TTC13-209ENST00000522821 CFTRP13569 1480 aa43.19■■■■■ 4.5
TTC13-209ENST00000522821 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.13■■■■■ 4.5
TTC13-209ENST00000522821 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.13■■■■■ 4.49
TTC13-209ENST00000522821 WDR62O43379 1518 aa43.12■■■■■ 4.49
TTC13-209ENST00000522821 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.9■■■■■ 4.46
TTC13-209ENST00000522821 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
TTC13-209ENST00000522821 PRDM2Q13029 1718 aa42.69■■■■■ 4.42
TTC13-209ENST00000522821 TOPBP1Q92547 1522 aa42.34■■■■■ 4.37
TTC13-209ENST00000522821 IFT140Q96RY7 1462 aa42.26■■■■■ 4.36
TTC13-209ENST00000522821 ABCC8Q09428 1581 aa42.23■■■■■ 4.35
TTC13-209ENST00000522821 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.21■■■■■ 4.35
TTC13-209ENST00000522821 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.18■■■■■ 4.34
TTC13-209ENST00000522821 OSCARQ8IYS5 282 aa42.09■■■■■ 4.33
TTC13-209ENST00000522821 TRIM41Q8WV44 630 aa42■■■■■ 4.31
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TTC13-209ENST00000522821 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
TTC13-209ENST00000522821 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.3
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TTC13-209ENST00000522821 CUX1P39880 1505 aa41.74■■■■■ 4.27
TTC13-209ENST00000522821 SOGA1O94964 1423 aa41.74■■■■■ 4.27
TTC13-209ENST00000522821 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.73■■■■■ 4.27
TTC13-209ENST00000522821 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
TTC13-209ENST00000522821 CHD1O14646 1710 aa41.53■■■■■ 4.24
TTC13-209ENST00000522821 WDR97A6NE52 1622 aa41.51■■■■■ 4.23
TTC13-209ENST00000522821 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.51■■■■■ 4.23
TTC13-209ENST00000522821 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.51■■■■■ 4.23
TTC13-209ENST00000522821 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.51■■■■■ 4.23
TTC13-209ENST00000522821 FBLN2P98095 1184 aa41.49■■■■■ 4.23
TTC13-209ENST00000522821 ARHGEF11O15085 1522 aa41.44■■■■■ 4.22
TTC13-209ENST00000522821 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.43■■■■■ 4.22
TTC13-209ENST00000522821 GRIN2BQ13224 1484 aa41.34■■■■■ 4.21
TTC13-209ENST00000522821 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
TTC13-209ENST00000522821 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.26■■■■■ 4.2
TTC13-209ENST00000522821 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.24■■■■■ 4.19
TTC13-209ENST00000522821 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
TTC13-209ENST00000522821 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.18■■■■■ 4.18
TTC13-209ENST00000522821 SYNJ2O15056 1496 aa41.17■■■■■ 4.18
TTC13-209ENST00000522821 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.17■■■■■ 4.18
TTC13-209ENST00000522821 PBRM1Q86U86 1689 aa41.17■■■■■ 4.18
TTC13-209ENST00000522821 TOP2BQ02880 1626 aa41.15■■■■■ 4.18
TTC13-209ENST00000522821 SYNJ1O43426 1573 aa41.13■■■■■ 4.18
TTC13-209ENST00000522821 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.13■■■■■ 4.17
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TTC13-209ENST00000522821 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.1■■■■■ 4.17
TTC13-209ENST00000522821 ARAP1Q96P48 1450 aa41.06■■■■■ 4.16
TTC13-209ENST00000522821 ADAMTS12P58397 1594 aa40.85■■■■■ 4.13
TTC13-209ENST00000522821 GRIN2AQ12879 1464 aa40.82■■■■■ 4.12
TTC13-209ENST00000522821 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.74■■■■■ 4.11
TTC13-209ENST00000522821 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.74■■■■■ 4.11
TTC13-209ENST00000522821 NUP160Q12769 1436 aa40.67■■■■■ 4.1
TTC13-209ENST00000522821 CEP170Q5SW79 1584 aa40.66■■■■■ 4.1
TTC13-209ENST00000522821 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
TTC13-209ENST00000522821 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.51■■■■■ 4.08
TTC13-209ENST00000522821 SHROOM2Q13796 1616 aa40.43■■■■■ 4.06
TTC13-209ENST00000522821 KIF27Q86VH2 1401 aa40.36■■■■■ 4.05
TTC13-209ENST00000522821 IGF1RP08069 1367 aa40.32■■■■■ 4.04
TTC13-209ENST00000522821 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.26■■■■■ 4.04
TTC13-209ENST00000522821 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
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