RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522683.5

NDUFAF6-215, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 6, human

TSL 5

Gene NDUFAF6, Length 582 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFAF6-215	ENST00000522683	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		58.32	■■■■■ 6.93
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		51.9	■■■■■ 5.9
NDUFAF6-215	ENST00000522683	ABCC9	O60706	1549 aa		51.03	■■■■■ 5.76
NDUFAF6-215	ENST00000522683	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		48.95	■■■■■ 5.43
NDUFAF6-215	ENST00000522683	NACAD	O15069	1562 aa		48.85	■■■■■ 5.41
NDUFAF6-215	ENST00000522683	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		48.81	■■■■■ 5.4
NDUFAF6-215	ENST00000522683	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.53	■■■■■ 5.36
NDUFAF6-215	ENST00000522683	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		48.49	■■■■■ 5.35
NDUFAF6-215	ENST00000522683	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.22	■■■■■ 5.31
NDUFAF6-215	ENST00000522683	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		47.9	■■■■■ 5.26
NDUFAF6-215	ENST00000522683	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	47.68	■■■■■ 5.22
NDUFAF6-215	ENST00000522683	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		47.54	■■■■■ 5.2
NDUFAF6-215	ENST00000522683	SCRIB	Q14160	1630 aa		47.38	■■■■■ 5.17
NDUFAF6-215	ENST00000522683	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		47.1	■■■■■ 5.13
NDUFAF6-215	ENST00000522683	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		46.94	■■■■■ 5.1
NDUFAF6-215	ENST00000522683	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	46.27	■■■■■ 5
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		46.15	■■■■■ 4.98
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.87	■■■■■ 4.93
NDUFAF6-215	ENST00000522683	SMARCA4	P51532	1647 aa		45.29	■■■■■ 4.84
NDUFAF6-215	ENST00000522683	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.18	■■■■■ 4.82
NDUFAF6-215	ENST00000522683	NCAPD3	P42695	1498 aa		45.1	■■■■■ 4.81
NDUFAF6-215	ENST00000522683	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.1	■■■■■ 4.81
NDUFAF6-215	ENST00000522683	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.01	■■■■■ 4.8
NDUFAF6-215	ENST00000522683	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		44.96	■■■■■ 4.79
NDUFAF6-215	ENST00000522683	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		44.84	■■■■■ 4.77
NDUFAF6-215	ENST00000522683	HMGXB3	Q12766	1538 aa		44.84	■■■■■ 4.77
NDUFAF6-215	ENST00000522683	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	44.7	■■■■■ 4.75
NDUFAF6-215	ENST00000522683	WIZ	O95785	1651 aa		44.46	■■■■■ 4.71
NDUFAF6-215	ENST00000522683	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.37	■■■■■ 4.69
NDUFAF6-215	ENST00000522683	NES	P48681	1621 aa		44.12	■■■■■ 4.65
NDUFAF6-215	ENST00000522683	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.96	■■■■■ 4.63
NDUFAF6-215	ENST00000522683	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	43.95	■■■■■ 4.63
NDUFAF6-215	ENST00000522683	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		43.92	■■■■■ 4.62
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		43.78	■■■■■ 4.6
NDUFAF6-215	ENST00000522683	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		43.64	■■■■■ 4.58
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CUX2	O14529	1486 aa		43.57	■■■■■ 4.57
NDUFAF6-215	ENST00000522683	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		43.57	■■■■■ 4.57
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CFTR	P13569	1480 aa		43.48	■■■■■ 4.55
NDUFAF6-215	ENST00000522683	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	43.47	■■■■■ 4.55
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.46	■■■■■ 4.55
NDUFAF6-215	ENST00000522683	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		43.28	■■■■■ 4.52
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		43.23	■■■■■ 4.51
NDUFAF6-215	ENST00000522683	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		43.21	■■■■■ 4.51
NDUFAF6-215	ENST00000522683	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.11	■■■■■ 4.49
NDUFAF6-215	ENST00000522683	WDR62	O43379	1518 aa		43.08	■■■■■ 4.49
NDUFAF6-215	ENST00000522683	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	43.08	■■■■■ 4.49
NDUFAF6-215	ENST00000522683	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	42.88	■■■■■ 4.46
NDUFAF6-215	ENST00000522683	TOPBP1	Q92547	1522 aa		42.57	■■■■■ 4.41
NDUFAF6-215	ENST00000522683	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.53	■■■■■ 4.4
NDUFAF6-215	ENST00000522683	ABCC8	Q09428	1581 aa		42.51	■■■■■ 4.4
NDUFAF6-215	ENST00000522683	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		42.48	■■■■■ 4.39
NDUFAF6-215	ENST00000522683	IFT140	Q96RY7	1462 aa		42.33	■■■■■ 4.37
NDUFAF6-215	ENST00000522683	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.2	■■■■■ 4.35
NDUFAF6-215	ENST00000522683	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.19	■■■■■ 4.34
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CUX1	P39880	1505 aa		42.19	■■■■■ 4.34
NDUFAF6-215	ENST00000522683	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.33
NDUFAF6-215	ENST00000522683	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.06	■■■■■ 4.32
NDUFAF6-215	ENST00000522683	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.04	■■■■■ 4.32
NDUFAF6-215	ENST00000522683	SOGA1	O94964	1423 aa		42.02	■■■■■ 4.32
NDUFAF6-215	ENST00000522683	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	42	■■■■■ 4.31
NDUFAF6-215	ENST00000522683	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	41.93	■■■■■ 4.3
NDUFAF6-215	ENST00000522683	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	41.82	■■■■■ 4.29
NDUFAF6-215	ENST00000522683	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.81	■■■■■ 4.28
NDUFAF6-215	ENST00000522683	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.75	■■■■■ 4.27
NDUFAF6-215	ENST00000522683	SYNJ1	O43426	1573 aa		41.75	■■■■■ 4.27
NDUFAF6-215	ENST00000522683	TOP2B	Q02880	1626 aa		41.74	■■■■■ 4.27
NDUFAF6-215	ENST00000522683	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.74	■■■■■ 4.27
NDUFAF6-215	ENST00000522683	WDR97	A6NE52	1622 aa		41.73	■■■■■ 4.27
NDUFAF6-215	ENST00000522683	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		41.64	■■■■■ 4.26
NDUFAF6-215	ENST00000522683	GRIN2B	Q13224	1484 aa		41.53	■■■■■ 4.24
NDUFAF6-215	ENST00000522683	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		41.53	■■■■■ 4.24
NDUFAF6-215	ENST00000522683	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		41.52	■■■■■ 4.24
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CHD1	O14646	1710 aa		41.52	■■■■■ 4.24
NDUFAF6-215	ENST00000522683	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		41.49	■■■■■ 4.23
NDUFAF6-215	ENST00000522683	FBLN2	P98095	1184 aa		41.44	■■■■■ 4.22
NDUFAF6-215	ENST00000522683	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	41.44	■■■■■ 4.22
NDUFAF6-215	ENST00000522683	PBRM1	Q86U86	1689 aa		41.44	■■■■■ 4.22
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	41.29	■■■■■ 4.2
NDUFAF6-215	ENST00000522683	SYNJ2	O15056	1496 aa		41.28	■■■■■ 4.2
NDUFAF6-215	ENST00000522683	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		41.12	■■■■■ 4.17
NDUFAF6-215	ENST00000522683	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		41.12	■■■■■ 4.17
NDUFAF6-215	ENST00000522683	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		41.12	■■■■■ 4.17
NDUFAF6-215	ENST00000522683	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.12	■■■■■ 4.17
NDUFAF6-215	ENST00000522683	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.11	■■■■■ 4.17
NDUFAF6-215	ENST00000522683	ARHGEF11	O15085	1522 aa		41.08	■■■■■ 4.17
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		41.07	■■■■■ 4.16
NDUFAF6-215	ENST00000522683	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.04	■■■■■ 4.16
NDUFAF6-215	ENST00000522683	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.02	■■■■■ 4.16
NDUFAF6-215	ENST00000522683	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.01	■■■■■ 4.16
NDUFAF6-215	ENST00000522683	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40.94	■■■■■ 4.14
NDUFAF6-215	ENST00000522683	IGF1R	P08069	1367 aa		40.85	■■■■■ 4.13
NDUFAF6-215	ENST00000522683	NUP160	Q12769	1436 aa		40.84	■■■■■ 4.13
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CEP170	Q5SW79	1584 aa		40.83	■■■■■ 4.13
NDUFAF6-215	ENST00000522683	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.76	■■■■■ 4.12
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.73	■■■■■ 4.11
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CUL7	Q14999	1698 aa		40.69	■■■■■ 4.1
NDUFAF6-215	ENST00000522683	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		40.58	■■■■■ 4.09
NDUFAF6-215	ENST00000522683	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		40.58	■■■■■ 4.09
NDUFAF6-215	ENST00000522683	SHROOM2	Q13796	1616 aa		40.56	■■■■■ 4.08
NDUFAF6-215	ENST00000522683	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		40.52	■■■■■ 4.08

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