RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522565.5

CETN3-204, Transcript of centrin 3, humanhuman

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Gene CETN3, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETN3-204ENST00000522565 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.82■■■□□ 2.2
CETN3-204ENST00000522565 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CETN3-204ENST00000522565 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.78■■□□□ 1.72
CETN3-204ENST00000522565 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.56■■□□□ 1.68
CETN3-204ENST00000522565 ABCC9O60706 1549 aa25.02■■□□□ 1.6
CETN3-204ENST00000522565 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.16■■□□□ 1.46
CETN3-204ENST00000522565 NACADO15069 1562 aa24.08■■□□□ 1.45
CETN3-204ENST00000522565 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CETN3-204ENST00000522565 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.98■■□□□ 1.43
CETN3-204ENST00000522565 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.87■■□□□ 1.41
CETN3-204ENST00000522565 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.83■■□□□ 1.41
CETN3-204ENST00000522565 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.8■■□□□ 1.4
CETN3-204ENST00000522565 SCRIBQ14160 1630 aa23.53■■□□□ 1.36
CETN3-204ENST00000522565 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.37■■□□□ 1.33
CETN3-204ENST00000522565 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
CETN3-204ENST00000522565 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.11■■□□□ 1.29
CETN3-204ENST00000522565 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CETN3-204ENST00000522565 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.69■■□□□ 1.22
CETN3-204ENST00000522565 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.67■■□□□ 1.22
CETN3-204ENST00000522565 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CETN3-204ENST00000522565 SMARCA4P51532 1647 aa22.46■■□□□ 1.19
CETN3-204ENST00000522565 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.44■■□□□ 1.18
CETN3-204ENST00000522565 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
CETN3-204ENST00000522565 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CETN3-204ENST00000522565 SMARCA2P51531 1590 aa22.25■■□□□ 1.15
CETN3-204ENST00000522565 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.24■■□□□ 1.15
CETN3-204ENST00000522565 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.17■■□□□ 1.14
CETN3-204ENST00000522565 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.16■■□□□ 1.14
CETN3-204ENST00000522565 HMGXB3Q12766 1538 aa22.15■■□□□ 1.14
CETN3-204ENST00000522565 WIZO95785 1651 aa22.11■■□□□ 1.13
CETN3-204ENST00000522565 NCAPD3P42695 1498 aa22.09■■□□□ 1.13
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CETN3-204ENST00000522565 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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CETN3-204ENST00000522565 NESP48681 1621 aa21.66■■□□□ 1.06
CETN3-204ENST00000522565 PRDM2Q13029 1718 aa21.6■■□□□ 1.05
CETN3-204ENST00000522565 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.6■■□□□ 1.05
CETN3-204ENST00000522565 ERCC6Q03468 1493 aa21.6■■□□□ 1.05
CETN3-204ENST00000522565 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.46■■□□□ 1.03
CETN3-204ENST00000522565 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.45■■□□□ 1.02
CETN3-204ENST00000522565 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CETN3-204ENST00000522565 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CETN3-204ENST00000522565 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.4■■□□□ 1.02
CETN3-204ENST00000522565 CFTRP13569 1480 aa21.39■■□□□ 1.01
CETN3-204ENST00000522565 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.33■■□□□ 1.01
CETN3-204ENST00000522565 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.32■■□□□ 1
CETN3-204ENST00000522565 CUX2O14529 1486 aa21.28■■□□□ 1
CETN3-204ENST00000522565 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.26■□□□□ 0.99
CETN3-204ENST00000522565 WDR62O43379 1518 aa21.21■□□□□ 0.99
CETN3-204ENST00000522565 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CETN3-204ENST00000522565 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.04■□□□□ 0.96
CETN3-204ENST00000522565 TOPBP1Q92547 1522 aa21■□□□□ 0.95
CETN3-204ENST00000522565 ABCC8Q09428 1581 aa20.96■□□□□ 0.95
CETN3-204ENST00000522565 CUX1P39880 1505 aa20.88■□□□□ 0.93
CETN3-204ENST00000522565 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.82■□□□□ 0.92
CETN3-204ENST00000522565 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CETN3-204ENST00000522565 IFT140Q96RY7 1462 aa20.81■□□□□ 0.92
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CETN3-204ENST00000522565 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.81■□□□□ 0.92
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CETN3-204ENST00000522565 WDR97A6NE52 1622 aa20.78■□□□□ 0.92
CETN3-204ENST00000522565 SYNJ1O43426 1573 aa20.78■□□□□ 0.92
CETN3-204ENST00000522565 TOP2BQ02880 1626 aa20.76■□□□□ 0.91
CETN3-204ENST00000522565 FOXD1Q16676 465 aa20.76■□□□□ 0.91
CETN3-204ENST00000522565 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
CETN3-204ENST00000522565 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.91
CETN3-204ENST00000522565 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.7■□□□□ 0.9
CETN3-204ENST00000522565 PBRM1Q86U86 1689 aa20.68■□□□□ 0.9
CETN3-204ENST00000522565 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.67■□□□□ 0.9
CETN3-204ENST00000522565 SOGA1O94964 1423 aa20.66■□□□□ 0.9
CETN3-204ENST00000522565 CHD1O14646 1710 aa20.61■□□□□ 0.89
CETN3-204ENST00000522565 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.6■□□□□ 0.89
CETN3-204ENST00000522565 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
CETN3-204ENST00000522565 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.56■□□□□ 0.88
CETN3-204ENST00000522565 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CETN3-204ENST00000522565 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.49■□□□□ 0.87
CETN3-204ENST00000522565 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.48■□□□□ 0.87
CETN3-204ENST00000522565 GRIN2BQ13224 1484 aa20.47■□□□□ 0.87
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CETN3-204ENST00000522565 ADAMTS12P58397 1594 aa20.4■□□□□ 0.86
CETN3-204ENST00000522565 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.36■□□□□ 0.85
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CETN3-204ENST00000522565 SYNJ2O15056 1496 aa20.33■□□□□ 0.85
CETN3-204ENST00000522565 FBLN2P98095 1184 aa20.32■□□□□ 0.84
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CETN3-204ENST00000522565 KIF27Q86VH2 1401 aa20.27■□□□□ 0.84
CETN3-204ENST00000522565 OSCARQ8IYS5 282 aa20.27■□□□□ 0.84
CETN3-204ENST00000522565 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
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CETN3-204ENST00000522565 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.22■□□□□ 0.83
CETN3-204ENST00000522565 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.22■□□□□ 0.83
CETN3-204ENST00000522565 TRIM41Q8WV44 630 aa20.21■□□□□ 0.83
CETN3-204ENST00000522565 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.2■□□□□ 0.82
CETN3-204ENST00000522565 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.2■□□□□ 0.82
CETN3-204ENST00000522565 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.2■□□□□ 0.82
CETN3-204ENST00000522565 CEP170Q5SW79 1584 aa20.19■□□□□ 0.82
CETN3-204ENST00000522565 ARHGEF11O15085 1522 aa20.12■□□□□ 0.81
CETN3-204ENST00000522565 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.12■□□□□ 0.81
CETN3-204ENST00000522565 NUP160Q12769 1436 aa20.08■□□□□ 0.8
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