RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522072.1

PTDSS1-206, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTDSS1, Length 1,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-206ENST00000522072 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.56■■■□□ 2.32
PTDSS1-206ENST00000522072 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.61■■□□□ 1.85
PTDSS1-206ENST00000522072 ABCC9O60706 1549 aa26.34■■□□□ 1.81
PTDSS1-206ENST00000522072 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.2■■□□□ 1.62
PTDSS1-206ENST00000522072 NACADO15069 1562 aa25.02■■□□□ 1.6
PTDSS1-206ENST00000522072 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.84■■□□□ 1.57
PTDSS1-206ENST00000522072 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-206ENST00000522072 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.67■■□□□ 1.54
PTDSS1-206ENST00000522072 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PTDSS1-206ENST00000522072 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
PTDSS1-206ENST00000522072 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.43■■□□□ 1.5
PTDSS1-206ENST00000522072 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.42■■□□□ 1.5
PTDSS1-206ENST00000522072 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.42■■□□□ 1.5
PTDSS1-206ENST00000522072 SCRIBQ14160 1630 aa24.24■■□□□ 1.47
PTDSS1-206ENST00000522072 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.1■■□□□ 1.45
PTDSS1-206ENST00000522072 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.86■■□□□ 1.41
PTDSS1-206ENST00000522072 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
PTDSS1-206ENST00000522072 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.7■■□□□ 1.38
PTDSS1-206ENST00000522072 SMARCA4P51532 1647 aa23.11■■□□□ 1.29
PTDSS1-206ENST00000522072 SMARCA2P51531 1590 aa23.01■■□□□ 1.27
PTDSS1-206ENST00000522072 NCAPD3P42695 1498 aa23.01■■□□□ 1.27
PTDSS1-206ENST00000522072 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.98■■□□□ 1.27
PTDSS1-206ENST00000522072 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PTDSS1-206ENST00000522072 HMGXB3Q12766 1538 aa22.96■■□□□ 1.27
PTDSS1-206ENST00000522072 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTDSS1-206ENST00000522072 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.83■■□□□ 1.25
PTDSS1-206ENST00000522072 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.79■■□□□ 1.24
PTDSS1-206ENST00000522072 ERCC6Q03468 1493 aa22.78■■□□□ 1.24
PTDSS1-206ENST00000522072 NESP48681 1621 aa22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1-206ENST00000522072 CUX2O14529 1486 aa22.65■■□□□ 1.22
PTDSS1-206ENST00000522072 WIZO95785 1651 aa22.6■■□□□ 1.21
PTDSS1-206ENST00000522072 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.59■■□□□ 1.21
PTDSS1-206ENST00000522072 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-206ENST00000522072 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTDSS1-206ENST00000522072 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.38■■□□□ 1.17
PTDSS1-206ENST00000522072 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-206ENST00000522072 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1-206ENST00000522072 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1-206ENST00000522072 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTDSS1-206ENST00000522072 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1-206ENST00000522072 PRDM2Q13029 1718 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-206ENST00000522072 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-206ENST00000522072 WDR62O43379 1518 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-206ENST00000522072 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-206ENST00000522072 CFTRP13569 1480 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-206ENST00000522072 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1-206ENST00000522072 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTDSS1-206ENST00000522072 TOPBP1Q92547 1522 aa21.74■■□□□ 1.07
PTDSS1-206ENST00000522072 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.72■■□□□ 1.07
PTDSS1-206ENST00000522072 IFT140Q96RY7 1462 aa21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1-206ENST00000522072 ABCC8Q09428 1581 aa21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1-206ENST00000522072 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1-206ENST00000522072 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1-206ENST00000522072 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PTDSS1-206ENST00000522072 OSCARQ8IYS5 282 aa21.54■■□□□ 1.04
PTDSS1-206ENST00000522072 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
PTDSS1-206ENST00000522072 TRIM41Q8WV44 630 aa21.51■■□□□ 1.03
PTDSS1-206ENST00000522072 CHD1O14646 1710 aa21.51■■□□□ 1.03
PTDSS1-206ENST00000522072 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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PTDSS1-206ENST00000522072 CUX1P39880 1505 aa21.43■■□□□ 1.02
PTDSS1-206ENST00000522072 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.42■■□□□ 1.02
PTDSS1-206ENST00000522072 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1-206ENST00000522072 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1-206ENST00000522072 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1-206ENST00000522072 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1-206ENST00000522072 WDR97A6NE52 1622 aa21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1-206ENST00000522072 SOGA1O94964 1423 aa21.38■■□□□ 1.01
PTDSS1-206ENST00000522072 PBRM1Q86U86 1689 aa21.32■■□□□ 1
PTDSS1-206ENST00000522072 ARHGEF11O15085 1522 aa21.3■■□□□ 1
PTDSS1-206ENST00000522072 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTDSS1-206ENST00000522072 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.28■■□□□ 1
PTDSS1-206ENST00000522072 FBLN2P98095 1184 aa21.27■■□□□ 1
PTDSS1-206ENST00000522072 GRIN2BQ13224 1484 aa21.22■□□□□ 0.99
PTDSS1-206ENST00000522072 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
PTDSS1-206ENST00000522072 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.2■□□□□ 0.98
PTDSS1-206ENST00000522072 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.2■□□□□ 0.98
PTDSS1-206ENST00000522072 SYNJ1O43426 1573 aa21.18■□□□□ 0.98
PTDSS1-206ENST00000522072 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1-206ENST00000522072 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1-206ENST00000522072 TOP2BQ02880 1626 aa21.15■□□□□ 0.98
PTDSS1-206ENST00000522072 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.14■□□□□ 0.97
PTDSS1-206ENST00000522072 SYNJ2O15056 1496 aa21.13■□□□□ 0.97
PTDSS1-206ENST00000522072 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PTDSS1-206ENST00000522072 ARAP1Q96P48 1450 aa21.09■□□□□ 0.97
PTDSS1-206ENST00000522072 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
PTDSS1-206ENST00000522072 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.05■□□□□ 0.96
PTDSS1-206ENST00000522072 ADAMTS12P58397 1594 aa21.03■□□□□ 0.96
PTDSS1-206ENST00000522072 GRIN2AQ12879 1464 aa20.95■□□□□ 0.94
PTDSS1-206ENST00000522072 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.93■□□□□ 0.94
PTDSS1-206ENST00000522072 CEP170Q5SW79 1584 aa20.91■□□□□ 0.94
PTDSS1-206ENST00000522072 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.87■□□□□ 0.93
PTDSS1-206ENST00000522072 NUP160Q12769 1436 aa20.84■□□□□ 0.93
PTDSS1-206ENST00000522072 SHROOM2Q13796 1616 aa20.82■□□□□ 0.92
PTDSS1-206ENST00000522072 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.81■□□□□ 0.92
PTDSS1-206ENST00000522072 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PTDSS1-206ENST00000522072 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1-206ENST00000522072 CUL7Q14999 1698 aa20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1-206ENST00000522072 KIF27Q86VH2 1401 aa20.68■□□□□ 0.9
PTDSS1-206ENST00000522072 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
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