RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521478.1

HOXA6-202, Transcript of homeobox A6, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA6, Length 814 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6-202ENST00000521478 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.36■■■■□ 3.57
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HOXA6-202ENST00000521478 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.5■■■□□ 2.95
HOXA6-202ENST00000521478 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.92■■■□□ 2.7
HOXA6-202ENST00000521478 NACADO15069 1562 aa31.71■■■□□ 2.67
HOXA6-202ENST00000521478 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.57■■■□□ 2.64
HOXA6-202ENST00000521478 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.55■■■□□ 2.64
HOXA6-202ENST00000521478 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.28■■■□□ 2.6
HOXA6-202ENST00000521478 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.25■■■□□ 2.59
HOXA6-202ENST00000521478 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.18■■■□□ 2.58
HOXA6-202ENST00000521478 BICRAQ9NZM4 1560 aa31■■■□□ 2.55
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HOXA6-202ENST00000521478 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXA6-202ENST00000521478 SCRIBQ14160 1630 aa30.51■■■□□ 2.47
HOXA6-202ENST00000521478 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXA6-202ENST00000521478 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXA6-202ENST00000521478 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXA6-202ENST00000521478 NCAPD3P42695 1498 aa29.29■■■□□ 2.28
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HOXA6-202ENST00000521478 SMARCA4P51532 1647 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXA6-202ENST00000521478 SMARCA2P51531 1590 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXA6-202ENST00000521478 HMGXB3Q12766 1538 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXA6-202ENST00000521478 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29■■■□□ 2.23
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HOXA6-202ENST00000521478 CUX2O14529 1486 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXA6-202ENST00000521478 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
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HOXA6-202ENST00000521478 NESP48681 1621 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXA6-202ENST00000521478 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXA6-202ENST00000521478 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXA6-202ENST00000521478 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
HOXA6-202ENST00000521478 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXA6-202ENST00000521478 WIZO95785 1651 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXA6-202ENST00000521478 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXA6-202ENST00000521478 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXA6-202ENST00000521478 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXA6-202ENST00000521478 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
HOXA6-202ENST00000521478 WDR62O43379 1518 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXA6-202ENST00000521478 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXA6-202ENST00000521478 CFTRP13569 1480 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXA6-202ENST00000521478 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
HOXA6-202ENST00000521478 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXA6-202ENST00000521478 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
HOXA6-202ENST00000521478 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.76■■■□□ 2.04
HOXA6-202ENST00000521478 PRDM2Q13029 1718 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXA6-202ENST00000521478 TRIM41Q8WV44 630 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXA6-202ENST00000521478 OSCARQ8IYS5 282 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXA6-202ENST00000521478 IFT140Q96RY7 1462 aa27.53■■■□□ 2
HOXA6-202ENST00000521478 TOPBP1Q92547 1522 aa27.52■■■□□ 2
HOXA6-202ENST00000521478 ABCC8Q09428 1581 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXA6-202ENST00000521478 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
HOXA6-202ENST00000521478 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.4■■□□□ 1.98
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HOXA6-202ENST00000521478 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXA6-202ENST00000521478 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXA6-202ENST00000521478 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
HOXA6-202ENST00000521478 ARHGEF11O15085 1522 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXA6-202ENST00000521478 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXA6-202ENST00000521478 SOGA1O94964 1423 aa27.14■■□□□ 1.93
HOXA6-202ENST00000521478 CHD1O14646 1710 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXA6-202ENST00000521478 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXA6-202ENST00000521478 FBLN2P98095 1184 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXA6-202ENST00000521478 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXA6-202ENST00000521478 CUX1P39880 1505 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXA6-202ENST00000521478 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27■■□□□ 1.91
HOXA6-202ENST00000521478 WDR97A6NE52 1622 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXA6-202ENST00000521478 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXA6-202ENST00000521478 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXA6-202ENST00000521478 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXA6-202ENST00000521478 GRIN2BQ13224 1484 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXA6-202ENST00000521478 ARAP1Q96P48 1450 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXA6-202ENST00000521478 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXA6-202ENST00000521478 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXA6-202ENST00000521478 SYNJ2O15056 1496 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXA6-202ENST00000521478 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXA6-202ENST00000521478 SYNJ1O43426 1573 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXA6-202ENST00000521478 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.76■■□□□ 1.87
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HOXA6-202ENST00000521478 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXA6-202ENST00000521478 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXA6-202ENST00000521478 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
HOXA6-202ENST00000521478 TOP2BQ02880 1626 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXA6-202ENST00000521478 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXA6-202ENST00000521478 GRIN2AQ12879 1464 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXA6-202ENST00000521478 ADAMTS12P58397 1594 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXA6-202ENST00000521478 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXA6-202ENST00000521478 NUP160Q12769 1436 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXA6-202ENST00000521478 CEP170Q5SW79 1584 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXA6-202ENST00000521478 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXA6-202ENST00000521478 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXA6-202ENST00000521478 SHROOM2Q13796 1616 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXA6-202ENST00000521478 JPH4Q96JJ6 628 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXA6-202ENST00000521478 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
HOXA6-202ENST00000521478 IGF1RP08069 1367 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXA6-202ENST00000521478 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.1■■□□□ 1.77
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