RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521231.1

HOXA-AS3-204, HOXA cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXA-AS3, Length 621 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS3-204ENST00000521231 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.31■■■■■ 5
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.63■■■■■ 4.26
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ABCC9O60706 1549 aa41.59■■■■■ 4.25
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.6■■■■□ 3.93
HOXA-AS3-204ENST00000521231 NACADO15069 1562 aa39.33■■■■□ 3.89
HOXA-AS3-204ENST00000521231 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.15■■■■□ 3.86
HOXA-AS3-204ENST00000521231 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.94■■■■□ 3.82
HOXA-AS3-204ENST00000521231 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.87■■■■□ 3.81
HOXA-AS3-204ENST00000521231 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.81■■■■□ 3.8
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.68■■■■□ 3.78
HOXA-AS3-204ENST00000521231 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.53■■■■□ 3.76
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
HOXA-AS3-204ENST00000521231 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.28■■■■□ 3.72
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.94■■■■□ 3.66
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SCRIBQ14160 1630 aa37.84■■■■□ 3.65
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.64■■■■□ 3.62
HOXA-AS3-204ENST00000521231 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.48■■■■□ 3.59
HOXA-AS3-204ENST00000521231 NCAPD3P42695 1498 aa36.32■■■■□ 3.41
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.18■■■■□ 3.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SMARCA4P51532 1647 aa36.15■■■■□ 3.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SMARCA2P51531 1590 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 HMGXB3Q12766 1538 aa36.03■■■■□ 3.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.98■■■■□ 3.35
HOXA-AS3-204ENST00000521231 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CUX2O14529 1486 aa35.91■■■■□ 3.34
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ERCC6Q03468 1493 aa35.86■■■■□ 3.33
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.85■■■■□ 3.33
HOXA-AS3-204ENST00000521231 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
HOXA-AS3-204ENST00000521231 NESP48681 1621 aa35.75■■■■□ 3.31
HOXA-AS3-204ENST00000521231 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.68■■■■□ 3.3
HOXA-AS3-204ENST00000521231 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.51■■■■□ 3.27
HOXA-AS3-204ENST00000521231 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
HOXA-AS3-204ENST00000521231 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.35■■■■□ 3.25
HOXA-AS3-204ENST00000521231 WIZO95785 1651 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.23■■■■□ 3.23
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.17■■■■□ 3.22
HOXA-AS3-204ENST00000521231 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.96■■■■□ 3.19
HOXA-AS3-204ENST00000521231 WDR62O43379 1518 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CFTRP13569 1480 aa34.78■■■■□ 3.16
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.78■■■■□ 3.16
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
HOXA-AS3-204ENST00000521231 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.76■■■■□ 3.15
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PRDM2Q13029 1718 aa34.54■■■■□ 3.12
HOXA-AS3-204ENST00000521231 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.39■■■■□ 3.1
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TRIM41Q8WV44 630 aa34.24■■■■□ 3.07
HOXA-AS3-204ENST00000521231 OSCARQ8IYS5 282 aa34.21■■■■□ 3.07
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TOPBP1Q92547 1522 aa34.12■■■■□ 3.05
HOXA-AS3-204ENST00000521231 IFT140Q96RY7 1462 aa34.11■■■■□ 3.05
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ABCC8Q09428 1581 aa34.03■■■■□ 3.04
HOXA-AS3-204ENST00000521231 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.99■■■■□ 3.03
HOXA-AS3-204ENST00000521231 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.85■■■■□ 3.01
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.85■■■■□ 3.01
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.85■■■■□ 3.01
HOXA-AS3-204ENST00000521231 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.76■■■■□ 3
HOXA-AS3-204ENST00000521231 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.76■■■□□ 2.99
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CHD1O14646 1710 aa33.73■■■□□ 2.99
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ARHGEF11O15085 1522 aa33.7■■■□□ 2.99
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.63■■■□□ 2.97
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SOGA1O94964 1423 aa33.58■■■□□ 2.97
HOXA-AS3-204ENST00000521231 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CUX1P39880 1505 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.96
HOXA-AS3-204ENST00000521231 WDR97A6NE52 1622 aa33.51■■■□□ 2.96
HOXA-AS3-204ENST00000521231 FBLN2P98095 1184 aa33.44■■■□□ 2.94
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.4■■■□□ 2.94
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.39■■■□□ 2.94
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ARAP1Q96P48 1450 aa33.37■■■□□ 2.93
HOXA-AS3-204ENST00000521231 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.31■■■□□ 2.92
HOXA-AS3-204ENST00000521231 GRIN2BQ13224 1484 aa33.3■■■□□ 2.92
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PBRM1Q86U86 1689 aa33.25■■■□□ 2.91
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SYNJ1O43426 1573 aa33.23■■■□□ 2.91
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.22■■■□□ 2.91
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SYNJ2O15056 1496 aa33.21■■■□□ 2.91
HOXA-AS3-204ENST00000521231 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.18■■■□□ 2.9
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.18■■■□□ 2.9
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.16■■■□□ 2.9
HOXA-AS3-204ENST00000521231 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.01■■■□□ 2.87
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.99■■■□□ 2.87
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TOP2BQ02880 1626 aa32.98■■■□□ 2.87
HOXA-AS3-204ENST00000521231 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.96■■■□□ 2.87
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ADAMTS12P58397 1594 aa32.88■■■□□ 2.85
HOXA-AS3-204ENST00000521231 GRIN2AQ12879 1464 aa32.88■■■□□ 2.85
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CEP170Q5SW79 1584 aa32.81■■■□□ 2.84
HOXA-AS3-204ENST00000521231 NUP160Q12769 1436 aa32.8■■■□□ 2.84
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.78■■■□□ 2.84
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.75■■■□□ 2.83
HOXA-AS3-204ENST00000521231 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.75■■■□□ 2.83
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SHROOM2Q13796 1616 aa32.73■■■□□ 2.83
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.42■■■□□ 2.78
HOXA-AS3-204ENST00000521231 JPH4Q96JJ6 628 aa32.42■■■□□ 2.78
HOXA-AS3-204ENST00000521231 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.36■■■□□ 2.77
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