RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521138.1

TTPA-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

TSL 5

Gene TTPA, Length 283 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-202ENST00000521138 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.89■■■■■ 6.38
TTPA-202ENST00000521138 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.24■■■■■ 5.47
TTPA-202ENST00000521138 ABCC9O60706 1549 aa49.15■■■■■ 5.46
TTPA-202ENST00000521138 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.81■■■■■ 5.08
TTPA-202ENST00000521138 NACADO15069 1562 aa46.52■■■■■ 5.04
TTPA-202ENST00000521138 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.14■■■■■ 4.98
TTPA-202ENST00000521138 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.12■■■■■ 4.97
TTPA-202ENST00000521138 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.95■■■■■ 4.95
TTPA-202ENST00000521138 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.84■■■■■ 4.93
TTPA-202ENST00000521138 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.74■■■■■ 4.91
TTPA-202ENST00000521138 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.55■■■■■ 4.88
TTPA-202ENST00000521138 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
TTPA-202ENST00000521138 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.37■■■■■ 4.85
TTPA-202ENST00000521138 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.88■■■■■ 4.78
TTPA-202ENST00000521138 SCRIBQ14160 1630 aa44.83■■■■■ 4.77
TTPA-202ENST00000521138 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.45■■■■■ 4.71
TTPA-202ENST00000521138 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.37■■■■■ 4.69
TTPA-202ENST00000521138 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.27■■■■■ 4.68
TTPA-202ENST00000521138 NCAPD3P42695 1498 aa42.97■■■■■ 4.47
TTPA-202ENST00000521138 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.84■■■■■ 4.45
TTPA-202ENST00000521138 SMARCA4P51532 1647 aa42.82■■■■■ 4.44
TTPA-202ENST00000521138 SMARCA2P51531 1590 aa42.69■■■■■ 4.42
TTPA-202ENST00000521138 HMGXB3Q12766 1538 aa42.66■■■■■ 4.42
TTPA-202ENST00000521138 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.57■■■■■ 4.41
TTPA-202ENST00000521138 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.44■■■■■ 4.39
TTPA-202ENST00000521138 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.38
TTPA-202ENST00000521138 ERCC6Q03468 1493 aa42.37■■■■■ 4.37
TTPA-202ENST00000521138 CUX2O14529 1486 aa42.36■■■■■ 4.37
TTPA-202ENST00000521138 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.31■■■■■ 4.36
TTPA-202ENST00000521138 NESP48681 1621 aa42.28■■■■■ 4.36
TTPA-202ENST00000521138 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.28■■■■■ 4.36
TTPA-202ENST00000521138 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.97■■■■■ 4.31
TTPA-202ENST00000521138 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
TTPA-202ENST00000521138 WIZO95785 1651 aa41.79■■■■■ 4.28
TTPA-202ENST00000521138 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.74■■■■■ 4.27
TTPA-202ENST00000521138 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.68■■■■■ 4.26
TTPA-202ENST00000521138 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.63■■■■■ 4.25
TTPA-202ENST00000521138 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
TTPA-202ENST00000521138 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.35■■■■■ 4.21
TTPA-202ENST00000521138 WDR62O43379 1518 aa41.29■■■■■ 4.2
TTPA-202ENST00000521138 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
TTPA-202ENST00000521138 CFTRP13569 1480 aa41.2■■■■■ 4.19
TTPA-202ENST00000521138 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.18■■■■■ 4.18
TTPA-202ENST00000521138 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.16■■■■■ 4.18
TTPA-202ENST00000521138 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
TTPA-202ENST00000521138 PRDM2Q13029 1718 aa40.8■■■■■ 4.12
TTPA-202ENST00000521138 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.79■■■■■ 4.12
TTPA-202ENST00000521138 TOPBP1Q92547 1522 aa40.41■■■■■ 4.06
TTPA-202ENST00000521138 OSCARQ8IYS5 282 aa40.36■■■■■ 4.05
TTPA-202ENST00000521138 IFT140Q96RY7 1462 aa40.36■■■■■ 4.05
TTPA-202ENST00000521138 TRIM41Q8WV44 630 aa40.35■■■■■ 4.05
TTPA-202ENST00000521138 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
TTPA-202ENST00000521138 ABCC8Q09428 1581 aa40.27■■■■■ 4.04
TTPA-202ENST00000521138 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.26■■■■■ 4.04
TTPA-202ENST00000521138 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
TTPA-202ENST00000521138 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
TTPA-202ENST00000521138 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
TTPA-202ENST00000521138 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.95■■■■□ 3.99
TTPA-202ENST00000521138 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.92■■■■□ 3.98
TTPA-202ENST00000521138 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.92■■■■□ 3.98
TTPA-202ENST00000521138 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.92■■■■□ 3.98
TTPA-202ENST00000521138 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.84■■■■□ 3.97
TTPA-202ENST00000521138 CHD1O14646 1710 aa39.81■■■■□ 3.96
TTPA-202ENST00000521138 ARHGEF11O15085 1522 aa39.8■■■■□ 3.96
TTPA-202ENST00000521138 SOGA1O94964 1423 aa39.77■■■■□ 3.96
TTPA-202ENST00000521138 CUX1P39880 1505 aa39.75■■■■□ 3.95
TTPA-202ENST00000521138 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.74■■■■□ 3.95
TTPA-202ENST00000521138 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
TTPA-202ENST00000521138 WDR97A6NE52 1622 aa39.64■■■■□ 3.94
TTPA-202ENST00000521138 FBLN2P98095 1184 aa39.55■■■■□ 3.92
TTPA-202ENST00000521138 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.54■■■■□ 3.92
TTPA-202ENST00000521138 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
TTPA-202ENST00000521138 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
TTPA-202ENST00000521138 GRIN2BQ13224 1484 aa39.43■■■■□ 3.9
TTPA-202ENST00000521138 ARAP1Q96P48 1450 aa39.43■■■■□ 3.9
TTPA-202ENST00000521138 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.41■■■■□ 3.9
TTPA-202ENST00000521138 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.39■■■■□ 3.9
TTPA-202ENST00000521138 PBRM1Q86U86 1689 aa39.32■■■■□ 3.88
TTPA-202ENST00000521138 SYNJ2O15056 1496 aa39.31■■■■□ 3.88
TTPA-202ENST00000521138 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.31■■■■□ 3.88
TTPA-202ENST00000521138 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
TTPA-202ENST00000521138 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.3■■■■□ 3.88
TTPA-202ENST00000521138 SYNJ1O43426 1573 aa39.29■■■■□ 3.88
TTPA-202ENST00000521138 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.28■■■■□ 3.88
TTPA-202ENST00000521138 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.13■■■■□ 3.85
TTPA-202ENST00000521138 TOP2BQ02880 1626 aa39.11■■■■□ 3.85
TTPA-202ENST00000521138 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.1■■■■□ 3.85
TTPA-202ENST00000521138 ADAMTS12P58397 1594 aa38.96■■■■□ 3.83
TTPA-202ENST00000521138 GRIN2AQ12879 1464 aa38.95■■■■□ 3.83
TTPA-202ENST00000521138 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.89■■■■□ 3.82
TTPA-202ENST00000521138 NUP160Q12769 1436 aa38.85■■■■□ 3.81
TTPA-202ENST00000521138 CEP170Q5SW79 1584 aa38.84■■■■□ 3.81
TTPA-202ENST00000521138 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.8■■■■□ 3.8
TTPA-202ENST00000521138 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.8■■■■□ 3.8
TTPA-202ENST00000521138 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.78■■■■□ 3.8
TTPA-202ENST00000521138 SHROOM2Q13796 1616 aa38.7■■■■□ 3.79
TTPA-202ENST00000521138 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.42■■■■□ 3.74
TTPA-202ENST00000521138 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
TTPA-202ENST00000521138 JPH4Q96JJ6 628 aa38.36■■■■□ 3.73
TTPA-202ENST00000521138 IGF1RP08069 1367 aa38.31■■■■□ 3.72
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