RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520714.5

MEG3-215, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 5

Gene MEG3, Length 1,351 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-215ENST00000520714 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.56■■■■■ 4.24
MEG3-215ENST00000520714 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.58■■■■□ 3.45
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MEG3-215ENST00000520714 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
MEG3-215ENST00000520714 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.53■■■■□ 3.12
MEG3-215ENST00000520714 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.41■■■■□ 3.1
MEG3-215ENST00000520714 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.27■■■■□ 3.08
MEG3-215ENST00000520714 NACADO15069 1562 aa34.24■■■■□ 3.07
MEG3-215ENST00000520714 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.1■■■■□ 3.05
MEG3-215ENST00000520714 SCRIBQ14160 1630 aa33.47■■■□□ 2.95
MEG3-215ENST00000520714 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.37■■■□□ 2.93
MEG3-215ENST00000520714 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.26■■■□□ 2.92
MEG3-215ENST00000520714 BICRAQ9NZM4 1560 aa33■■■□□ 2.87
MEG3-215ENST00000520714 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.98■■■□□ 2.87
MEG3-215ENST00000520714 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.29■■■□□ 2.76
MEG3-215ENST00000520714 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
MEG3-215ENST00000520714 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
MEG3-215ENST00000520714 SMARCA4P51532 1647 aa32.08■■■□□ 2.73
MEG3-215ENST00000520714 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.05■■■□□ 2.72
MEG3-215ENST00000520714 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
MEG3-215ENST00000520714 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.69
MEG3-215ENST00000520714 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.76■■■□□ 2.68
MEG3-215ENST00000520714 SMARCA2P51531 1590 aa31.73■■■□□ 2.67
MEG3-215ENST00000520714 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.73■■■□□ 2.67
MEG3-215ENST00000520714 WIZO95785 1651 aa31.73■■■□□ 2.67
MEG3-215ENST00000520714 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.73■■■□□ 2.67
MEG3-215ENST00000520714 NCAPD3P42695 1498 aa31.59■■■□□ 2.65
MEG3-215ENST00000520714 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.53■■■□□ 2.64
MEG3-215ENST00000520714 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
MEG3-215ENST00000520714 HMGXB3Q12766 1538 aa31.49■■■□□ 2.63
MEG3-215ENST00000520714 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
MEG3-215ENST00000520714 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.09■■■□□ 2.57
MEG3-215ENST00000520714 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.74■■■□□ 2.51
MEG3-215ENST00000520714 CFTRP13569 1480 aa30.69■■■□□ 2.5
MEG3-215ENST00000520714 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.63■■■□□ 2.49
MEG3-215ENST00000520714 NESP48681 1621 aa30.59■■■□□ 2.49
MEG3-215ENST00000520714 PRDM2Q13029 1718 aa30.46■■■□□ 2.47
MEG3-215ENST00000520714 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.45■■■□□ 2.46
MEG3-215ENST00000520714 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.37■■■□□ 2.45
MEG3-215ENST00000520714 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.27■■■□□ 2.44
MEG3-215ENST00000520714 ERCC6Q03468 1493 aa30.23■■■□□ 2.43
MEG3-215ENST00000520714 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.22■■■□□ 2.43
MEG3-215ENST00000520714 ABCC8Q09428 1581 aa30.18■■■□□ 2.42
MEG3-215ENST00000520714 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.14■■■□□ 2.42
MEG3-215ENST00000520714 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.13■■■□□ 2.41
MEG3-215ENST00000520714 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.06■■■□□ 2.4
MEG3-215ENST00000520714 TRIM41Q8WV44 630 aa30.02■■■□□ 2.4
MEG3-215ENST00000520714 CUX1P39880 1505 aa30.01■■■□□ 2.39
MEG3-215ENST00000520714 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
MEG3-215ENST00000520714 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30■■■□□ 2.39
MEG3-215ENST00000520714 SYNJ1O43426 1573 aa29.98■■■□□ 2.39
MEG3-215ENST00000520714 TOPBP1Q92547 1522 aa29.96■■■□□ 2.39
MEG3-215ENST00000520714 TOP2BQ02880 1626 aa29.95■■■□□ 2.39
MEG3-215ENST00000520714 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.93■■■□□ 2.38
MEG3-215ENST00000520714 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
MEG3-215ENST00000520714 WDR62O43379 1518 aa29.9■■■□□ 2.38
MEG3-215ENST00000520714 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.81■■■□□ 2.36
MEG3-215ENST00000520714 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
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MEG3-215ENST00000520714 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.64■■■□□ 2.34
MEG3-215ENST00000520714 CUX2O14529 1486 aa29.63■■■□□ 2.33
MEG3-215ENST00000520714 IFT140Q96RY7 1462 aa29.6■■■□□ 2.33
MEG3-215ENST00000520714 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.55■■■□□ 2.32
MEG3-215ENST00000520714 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
MEG3-215ENST00000520714 KIF27Q86VH2 1401 aa29.47■■■□□ 2.31
MEG3-215ENST00000520714 WDR97A6NE52 1622 aa29.47■■■□□ 2.31
MEG3-215ENST00000520714 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
MEG3-215ENST00000520714 EEA1Q15075 1411 aa29.42■■■□□ 2.3
MEG3-215ENST00000520714 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.4■■■□□ 2.3
MEG3-215ENST00000520714 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
MEG3-215ENST00000520714 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
MEG3-215ENST00000520714 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.35■■■□□ 2.29
MEG3-215ENST00000520714 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.34■■■□□ 2.29
MEG3-215ENST00000520714 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.33■■■□□ 2.29
MEG3-215ENST00000520714 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.29■■■□□ 2.28
MEG3-215ENST00000520714 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
MEG3-215ENST00000520714 GRIN2BQ13224 1484 aa29.24■■■□□ 2.27
MEG3-215ENST00000520714 IGF1RP08069 1367 aa29.23■■■□□ 2.27
MEG3-215ENST00000520714 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.21■■■□□ 2.27
MEG3-215ENST00000520714 PBRM1Q86U86 1689 aa29.19■■■□□ 2.26
MEG3-215ENST00000520714 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.11■■■□□ 2.25
MEG3-215ENST00000520714 CUL7Q14999 1698 aa29.09■■■□□ 2.25
MEG3-215ENST00000520714 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.08■■■□□ 2.25
MEG3-215ENST00000520714 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
MEG3-215ENST00000520714 PRXQ9BXM0 1461 aa29.06■■■□□ 2.24
MEG3-215ENST00000520714 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.04■■■□□ 2.24
MEG3-215ENST00000520714 ADAMTS12P58397 1594 aa29.01■■■□□ 2.23
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MEG3-215ENST00000520714 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29■■■□□ 2.23
MEG3-215ENST00000520714 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.95■■■□□ 2.22
MEG3-215ENST00000520714 SYNJ2O15056 1496 aa28.94■■■□□ 2.22
MEG3-215ENST00000520714 GOLGA3Q08378 1498 aa28.94■■■□□ 2.22
MEG3-215ENST00000520714 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
MEG3-215ENST00000520714 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.9■■■□□ 2.22
MEG3-215ENST00000520714 FBLN2P98095 1184 aa28.9■■■□□ 2.22
MEG3-215ENST00000520714 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
MEG3-215ENST00000520714 GRIN2AQ12879 1464 aa28.85■■■□□ 2.21
MEG3-215ENST00000520714 CHD1O14646 1710 aa28.76■■■□□ 2.19
MEG3-215ENST00000520714 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.73■■■□□ 2.19
MEG3-215ENST00000520714 NUP160Q12769 1436 aa28.68■■■□□ 2.18
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