RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520577.1

RASA4-208, Transcript of RAS p21 protein activator 4, human

TSL 4

Gene RASA4, Length 542 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASA4-208	ENST00000520577	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		43.48	■■■■■ 4.55
RASA4-208	ENST00000520577	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		38.81	■■■■□ 3.8
RASA4-208	ENST00000520577	ABCC9	O60706	1549 aa		38.71	■■■■□ 3.79
RASA4-208	ENST00000520577	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		36.91	■■■■□ 3.5
RASA4-208	ENST00000520577	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		36.74	■■■■□ 3.47
RASA4-208	ENST00000520577	NACAD	O15069	1562 aa		36.73	■■■■□ 3.47
RASA4-208	ENST00000520577	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.31	■■■■□ 3.4
RASA4-208	ENST00000520577	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		36.19	■■■■□ 3.38
RASA4-208	ENST00000520577	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	36.15	■■■■□ 3.38
RASA4-208	ENST00000520577	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	36.05	■■■■□ 3.36
RASA4-208	ENST00000520577	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		35.94	■■■■□ 3.34
RASA4-208	ENST00000520577	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		35.93	■■■■□ 3.34
RASA4-208	ENST00000520577	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		35.81	■■■■□ 3.32
RASA4-208	ENST00000520577	SCRIB	Q14160	1630 aa		35.42	■■■■□ 3.26
RASA4-208	ENST00000520577	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		35.36	■■■■□ 3.25
RASA4-208	ENST00000520577	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		34.92	■■■■□ 3.18
RASA4-208	ENST00000520577	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.91	■■■■□ 3.18
RASA4-208	ENST00000520577	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		34.85	■■■■□ 3.17
RASA4-208	ENST00000520577	NCAPD3	P42695	1498 aa		33.95	■■■■□ 3.03
RASA4-208	ENST00000520577	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		33.87	■■■■□ 3.01
RASA4-208	ENST00000520577	SMARCA4	P51532	1647 aa		33.82	■■■■□ 3
RASA4-208	ENST00000520577	SMARCA2	P51531	1590 aa		33.75	■■■□□ 2.99
RASA4-208	ENST00000520577	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
RASA4-208	ENST00000520577	HMGXB3	Q12766	1538 aa		33.64	■■■□□ 2.98
RASA4-208	ENST00000520577	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
RASA4-208	ENST00000520577	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		33.51	■■■□□ 2.95
RASA4-208	ENST00000520577	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		33.5	■■■□□ 2.95
RASA4-208	ENST00000520577	ERCC6	Q03468	1493 aa		33.41	■■■□□ 2.94
RASA4-208	ENST00000520577	NES	P48681	1621 aa		33.3	■■■□□ 2.92
RASA4-208	ENST00000520577	CUX2	O14529	1486 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RASA4-208	ENST00000520577	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.09	■■■□□ 2.89
RASA4-208	ENST00000520577	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		33.08	■■■□□ 2.89
RASA4-208	ENST00000520577	WIZ	O95785	1651 aa		33.06	■■■□□ 2.88
RASA4-208	ENST00000520577	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		32.97	■■■□□ 2.87
RASA4-208	ENST00000520577	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		32.96	■■■□□ 2.87
RASA4-208	ENST00000520577	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
RASA4-208	ENST00000520577	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
RASA4-208	ENST00000520577	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.78	■■■□□ 2.84
RASA4-208	ENST00000520577	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
RASA4-208	ENST00000520577	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RASA4-208	ENST00000520577	CFTR	P13569	1480 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RASA4-208	ENST00000520577	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RASA4-208	ENST00000520577	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RASA4-208	ENST00000520577	WDR62	O43379	1518 aa		32.5	■■■□□ 2.79
RASA4-208	ENST00000520577	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RASA4-208	ENST00000520577	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
RASA4-208	ENST00000520577	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RASA4-208	ENST00000520577	TOPBP1	Q92547	1522 aa		31.93	■■■□□ 2.7
RASA4-208	ENST00000520577	ABCC8	Q09428	1581 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RASA4-208	ENST00000520577	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RASA4-208	ENST00000520577	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.89	■■■□□ 2.7
RASA4-208	ENST00000520577	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
RASA4-208	ENST00000520577	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RASA4-208	ENST00000520577	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
RASA4-208	ENST00000520577	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RASA4-208	ENST00000520577	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
RASA4-208	ENST00000520577	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
RASA4-208	ENST00000520577	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	31.59	■■■□□ 2.65
RASA4-208	ENST00000520577	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
RASA4-208	ENST00000520577	SOGA1	O94964	1423 aa		31.55	■■■□□ 2.64
RASA4-208	ENST00000520577	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		31.52	■■■□□ 2.64
RASA4-208	ENST00000520577	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.63
RASA4-208	ENST00000520577	CUX1	P39880	1505 aa		31.45	■■■□□ 2.63
RASA4-208	ENST00000520577	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		31.45	■■■□□ 2.62
RASA4-208	ENST00000520577	FBLN2	P98095	1184 aa		31.39	■■■□□ 2.62
RASA4-208	ENST00000520577	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RASA4-208	ENST00000520577	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RASA4-208	ENST00000520577	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RASA4-208	ENST00000520577	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.27	■■■□□ 2.6
RASA4-208	ENST00000520577	ARHGEF11	O15085	1522 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RASA4-208	ENST00000520577	CHD1	O14646	1710 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RASA4-208	ENST00000520577	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.22	■■■□□ 2.59
RASA4-208	ENST00000520577	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RASA4-208	ENST00000520577	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
RASA4-208	ENST00000520577	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
RASA4-208	ENST00000520577	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.13	■■■□□ 2.57
RASA4-208	ENST00000520577	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.13	■■■□□ 2.57
RASA4-208	ENST00000520577	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.12	■■■□□ 2.57
RASA4-208	ENST00000520577	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	31.08	■■■□□ 2.57
RASA4-208	ENST00000520577	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.07	■■■□□ 2.56
RASA4-208	ENST00000520577	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.99	■■■□□ 2.55
RASA4-208	ENST00000520577	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.98	■■■□□ 2.55
RASA4-208	ENST00000520577	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		30.98	■■■□□ 2.55
RASA4-208	ENST00000520577	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		30.97	■■■□□ 2.55
RASA4-208	ENST00000520577	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.96	■■■□□ 2.55
RASA4-208	ENST00000520577	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.95	■■■□□ 2.55
RASA4-208	ENST00000520577	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.95	■■■□□ 2.55
RASA4-208	ENST00000520577	GRIN2A	Q12879	1464 aa		30.78	■■■□□ 2.52
RASA4-208	ENST00000520577	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		30.75	■■■□□ 2.51
RASA4-208	ENST00000520577	ADAMTS12	P58397	1594 aa		30.73	■■■□□ 2.51
RASA4-208	ENST00000520577	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		30.73	■■■□□ 2.51
RASA4-208	ENST00000520577	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	30.7	■■■□□ 2.51
RASA4-208	ENST00000520577	NUP160	Q12769	1436 aa		30.68	■■■□□ 2.5
RASA4-208	ENST00000520577	CEP170	Q5SW79	1584 aa		30.62	■■■□□ 2.49
RASA4-208	ENST00000520577	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		30.51	■■■□□ 2.47
RASA4-208	ENST00000520577	IGF1R	P08069	1367 aa		30.48	■■■□□ 2.47
RASA4-208	ENST00000520577	KIF27	Q86VH2	1401 aa		30.47	■■■□□ 2.47
RASA4-208	ENST00000520577	JPH4	Q96JJ6	628 aa		30.47	■■■□□ 2.47
RASA4-208	ENST00000520577	SHROOM2	Q13796	1616 aa		30.44	■■■□□ 2.46
RASA4-208	ENST00000520577	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	30.4	■■■□□ 2.46

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