RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520063.1

TMPRSS4-209, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 3

Gene TMPRSS4, Length 354 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-209ENST00000520063 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.83■■■■□ 3.97
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TMPRSS4-209ENST00000520063 ABCC9O60706 1549 aa35.13■■■■□ 3.21
TMPRSS4-209ENST00000520063 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.68■■■□□ 2.98
TMPRSS4-209ENST00000520063 NACADO15069 1562 aa33.6■■■□□ 2.97
TMPRSS4-209ENST00000520063 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.36■■■□□ 2.93
TMPRSS4-209ENST00000520063 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.24■■■□□ 2.91
TMPRSS4-209ENST00000520063 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
TMPRSS4-209ENST00000520063 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.02■■■□□ 2.88
TMPRSS4-209ENST00000520063 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.84■■■□□ 2.85
TMPRSS4-209ENST00000520063 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.73■■■□□ 2.83
TMPRSS4-209ENST00000520063 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.7■■■□□ 2.82
TMPRSS4-209ENST00000520063 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.66■■■□□ 2.82
TMPRSS4-209ENST00000520063 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.44■■■□□ 2.78
TMPRSS4-209ENST00000520063 SCRIBQ14160 1630 aa32.33■■■□□ 2.77
TMPRSS4-209ENST00000520063 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
TMPRSS4-209ENST00000520063 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.79■■■□□ 2.68
TMPRSS4-209ENST00000520063 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.66■■■□□ 2.66
TMPRSS4-209ENST00000520063 NCAPD3P42695 1498 aa31.02■■■□□ 2.56
TMPRSS4-209ENST00000520063 SMARCA4P51532 1647 aa30.96■■■□□ 2.55
TMPRSS4-209ENST00000520063 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.94■■■□□ 2.54
TMPRSS4-209ENST00000520063 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
TMPRSS4-209ENST00000520063 SMARCA2P51531 1590 aa30.88■■■□□ 2.53
TMPRSS4-209ENST00000520063 HMGXB3Q12766 1538 aa30.82■■■□□ 2.52
TMPRSS4-209ENST00000520063 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.76■■■□□ 2.52
TMPRSS4-209ENST00000520063 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.65■■■□□ 2.5
TMPRSS4-209ENST00000520063 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
TMPRSS4-209ENST00000520063 ERCC6Q03468 1493 aa30.31■■■□□ 2.44
TMPRSS4-209ENST00000520063 NESP48681 1621 aa30.29■■■□□ 2.44
TMPRSS4-209ENST00000520063 CUX2O14529 1486 aa30.26■■■□□ 2.44
TMPRSS4-209ENST00000520063 WIZO95785 1651 aa30.24■■■□□ 2.43
TMPRSS4-209ENST00000520063 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.23■■■□□ 2.43
TMPRSS4-209ENST00000520063 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
TMPRSS4-209ENST00000520063 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.06■■■□□ 2.4
TMPRSS4-209ENST00000520063 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.04■■■□□ 2.4
TMPRSS4-209ENST00000520063 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
TMPRSS4-209ENST00000520063 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
TMPRSS4-209ENST00000520063 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.89■■■□□ 2.38
TMPRSS4-209ENST00000520063 CFTRP13569 1480 aa29.82■■■□□ 2.36
TMPRSS4-209ENST00000520063 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.8■■■□□ 2.36
TMPRSS4-209ENST00000520063 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.74■■■□□ 2.35
TMPRSS4-209ENST00000520063 WDR62O43379 1518 aa29.68■■■□□ 2.34
TMPRSS4-209ENST00000520063 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.68■■■□□ 2.34
TMPRSS4-209ENST00000520063 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.68■■■□□ 2.34
TMPRSS4-209ENST00000520063 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.61■■■□□ 2.33
TMPRSS4-209ENST00000520063 PRDM2Q13029 1718 aa29.46■■■□□ 2.31
TMPRSS4-209ENST00000520063 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
TMPRSS4-209ENST00000520063 ABCC8Q09428 1581 aa29.19■■■□□ 2.26
TMPRSS4-209ENST00000520063 TOPBP1Q92547 1522 aa29.16■■■□□ 2.26
TMPRSS4-209ENST00000520063 IFT140Q96RY7 1462 aa29.11■■■□□ 2.25
TMPRSS4-209ENST00000520063 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.1■■■□□ 2.25
TMPRSS4-209ENST00000520063 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
TMPRSS4-209ENST00000520063 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
TMPRSS4-209ENST00000520063 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
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TMPRSS4-209ENST00000520063 OSCARQ8IYS5 282 aa28.87■■■□□ 2.21
TMPRSS4-209ENST00000520063 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
TMPRSS4-209ENST00000520063 CUX1P39880 1505 aa28.78■■■□□ 2.2
TMPRSS4-209ENST00000520063 SOGA1O94964 1423 aa28.75■■■□□ 2.19
TMPRSS4-209ENST00000520063 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.73■■■□□ 2.19
TMPRSS4-209ENST00000520063 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.73■■■□□ 2.19
TMPRSS4-209ENST00000520063 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.72■■■□□ 2.19
TMPRSS4-209ENST00000520063 WDR97A6NE52 1622 aa28.71■■■□□ 2.19
TMPRSS4-209ENST00000520063 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
TMPRSS4-209ENST00000520063 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.5■■■□□ 2.15
TMPRSS4-209ENST00000520063 GRIN2BQ13224 1484 aa28.49■■■□□ 2.15
TMPRSS4-209ENST00000520063 CHD1O14646 1710 aa28.49■■■□□ 2.15
TMPRSS4-209ENST00000520063 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
TMPRSS4-209ENST00000520063 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.46■■■□□ 2.15
TMPRSS4-209ENST00000520063 TRIM41Q8WV44 630 aa28.46■■■□□ 2.15
TMPRSS4-209ENST00000520063 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.44■■■□□ 2.14
TMPRSS4-209ENST00000520063 TOP2BQ02880 1626 aa28.43■■■□□ 2.14
TMPRSS4-209ENST00000520063 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.43■■■□□ 2.14
TMPRSS4-209ENST00000520063 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.42■■■□□ 2.14
TMPRSS4-209ENST00000520063 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.42■■■□□ 2.14
TMPRSS4-209ENST00000520063 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.42■■■□□ 2.14
TMPRSS4-209ENST00000520063 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.42■■■□□ 2.14
TMPRSS4-209ENST00000520063 ARHGEF11O15085 1522 aa28.41■■■□□ 2.14
TMPRSS4-209ENST00000520063 FBLN2P98095 1184 aa28.39■■■□□ 2.14
TMPRSS4-209ENST00000520063 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.39■■■□□ 2.13
TMPRSS4-209ENST00000520063 SYNJ1O43426 1573 aa28.37■■■□□ 2.13
TMPRSS4-209ENST00000520063 SYNJ2O15056 1496 aa28.36■■■□□ 2.13
TMPRSS4-209ENST00000520063 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
TMPRSS4-209ENST00000520063 PBRM1Q86U86 1689 aa28.32■■■□□ 2.12
TMPRSS4-209ENST00000520063 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.28■■■□□ 2.12
TMPRSS4-209ENST00000520063 ARAP1Q96P48 1450 aa28.15■■■□□ 2.1
TMPRSS4-209ENST00000520063 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.15■■■□□ 2.1
TMPRSS4-209ENST00000520063 ADAMTS12P58397 1594 aa28.14■■■□□ 2.1
TMPRSS4-209ENST00000520063 GRIN2AQ12879 1464 aa28.11■■■□□ 2.09
TMPRSS4-209ENST00000520063 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.1■■■□□ 2.09
TMPRSS4-209ENST00000520063 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.1■■■□□ 2.09
TMPRSS4-209ENST00000520063 NUP160Q12769 1436 aa28.06■■■□□ 2.08
TMPRSS4-209ENST00000520063 CEP170Q5SW79 1584 aa27.97■■■□□ 2.07
TMPRSS4-209ENST00000520063 KIF27Q86VH2 1401 aa27.89■■■□□ 2.06
TMPRSS4-209ENST00000520063 SHROOM2Q13796 1616 aa27.87■■■□□ 2.05
TMPRSS4-209ENST00000520063 IGF1RP08069 1367 aa27.85■■■□□ 2.05
TMPRSS4-209ENST00000520063 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.78■■■□□ 2.04
TMPRSS4-209ENST00000520063 CUL7Q14999 1698 aa27.77■■■□□ 2.04
TMPRSS4-209ENST00000520063 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.73■■■□□ 2.03
TMPRSS4-209ENST00000520063 JPH4Q96JJ6 628 aa27.7■■■□□ 2.02
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