RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519842.1

HOXA7-202, Transcript of homeobox A7, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA7, Length 585 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7-202ENST00000519842 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.48■■■■■ 5.03
HOXA7-202ENST00000519842 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.64■■■■■ 4.26
HOXA7-202ENST00000519842 ABCC9O60706 1549 aa41.34■■■■■ 4.21
HOXA7-202ENST00000519842 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.42■■■■□ 3.9
HOXA7-202ENST00000519842 NACADO15069 1562 aa39.19■■■■□ 3.86
HOXA7-202ENST00000519842 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39■■■■□ 3.83
HOXA7-202ENST00000519842 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.77■■■■□ 3.8
HOXA7-202ENST00000519842 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.68■■■■□ 3.78
HOXA7-202ENST00000519842 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
HOXA7-202ENST00000519842 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.46■■■■□ 3.75
HOXA7-202ENST00000519842 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.43■■■■□ 3.74
HOXA7-202ENST00000519842 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.36■■■■□ 3.73
HOXA7-202ENST00000519842 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.34■■■■□ 3.73
HOXA7-202ENST00000519842 SCRIBQ14160 1630 aa38.05■■■■□ 3.68
HOXA7-202ENST00000519842 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.69■■■■□ 3.62
HOXA7-202ENST00000519842 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.38■■■■□ 3.57
HOXA7-202ENST00000519842 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
HOXA7-202ENST00000519842 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.14■■■■□ 3.54
HOXA7-202ENST00000519842 SMARCA4P51532 1647 aa36.26■■■■□ 3.4
HOXA7-202ENST00000519842 NCAPD3P42695 1498 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXA7-202ENST00000519842 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXA7-202ENST00000519842 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
HOXA7-202ENST00000519842 SMARCA2P51531 1590 aa36.03■■■■□ 3.36
HOXA7-202ENST00000519842 HMGXB3Q12766 1538 aa35.98■■■■□ 3.35
HOXA7-202ENST00000519842 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.88■■■■□ 3.33
HOXA7-202ENST00000519842 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.84■■■■□ 3.33
HOXA7-202ENST00000519842 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
HOXA7-202ENST00000519842 NESP48681 1621 aa35.64■■■■□ 3.3
HOXA7-202ENST00000519842 ERCC6Q03468 1493 aa35.6■■■■□ 3.29
HOXA7-202ENST00000519842 WIZO95785 1651 aa35.53■■■■□ 3.28
HOXA7-202ENST00000519842 CUX2O14529 1486 aa35.39■■■■□ 3.26
HOXA7-202ENST00000519842 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.34■■■■□ 3.25
HOXA7-202ENST00000519842 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXA7-202ENST00000519842 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
HOXA7-202ENST00000519842 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
HOXA7-202ENST00000519842 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.04■■■■□ 3.2
HOXA7-202ENST00000519842 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.03■■■■□ 3.2
HOXA7-202ENST00000519842 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
HOXA7-202ENST00000519842 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.94■■■■□ 3.18
HOXA7-202ENST00000519842 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.82■■■■□ 3.16
HOXA7-202ENST00000519842 WDR62O43379 1518 aa34.76■■■■□ 3.15
HOXA7-202ENST00000519842 CFTRP13569 1480 aa34.75■■■■□ 3.15
HOXA7-202ENST00000519842 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXA7-202ENST00000519842 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.73■■■■□ 3.15
HOXA7-202ENST00000519842 PRDM2Q13029 1718 aa34.65■■■■□ 3.14
HOXA7-202ENST00000519842 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.58■■■■□ 3.13
HOXA7-202ENST00000519842 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
HOXA7-202ENST00000519842 TOPBP1Q92547 1522 aa34.14■■■■□ 3.06
HOXA7-202ENST00000519842 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.05■■■■□ 3.04
HOXA7-202ENST00000519842 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.04
HOXA7-202ENST00000519842 IFT140Q96RY7 1462 aa33.99■■■■□ 3.03
HOXA7-202ENST00000519842 ABCC8Q09428 1581 aa33.93■■■■□ 3.02
HOXA7-202ENST00000519842 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
HOXA7-202ENST00000519842 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
HOXA7-202ENST00000519842 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
HOXA7-202ENST00000519842 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
HOXA7-202ENST00000519842 CUX1P39880 1505 aa33.71■■■□□ 2.99
HOXA7-202ENST00000519842 OSCARQ8IYS5 282 aa33.71■■■□□ 2.99
HOXA7-202ENST00000519842 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.69■■■□□ 2.98
HOXA7-202ENST00000519842 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.68■■■□□ 2.98
HOXA7-202ENST00000519842 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.65■■■□□ 2.98
HOXA7-202ENST00000519842 TRIM41Q8WV44 630 aa33.65■■■□□ 2.98
HOXA7-202ENST00000519842 CHD1O14646 1710 aa33.65■■■□□ 2.98
HOXA7-202ENST00000519842 SOGA1O94964 1423 aa33.56■■■□□ 2.96
HOXA7-202ENST00000519842 WDR97A6NE52 1622 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXA7-202ENST00000519842 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.5■■■□□ 2.95
HOXA7-202ENST00000519842 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.5■■■□□ 2.95
HOXA7-202ENST00000519842 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.5■■■□□ 2.95
HOXA7-202ENST00000519842 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
HOXA7-202ENST00000519842 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.4■■■□□ 2.94
HOXA7-202ENST00000519842 ARHGEF11O15085 1522 aa33.38■■■□□ 2.93
HOXA7-202ENST00000519842 PBRM1Q86U86 1689 aa33.36■■■□□ 2.93
HOXA7-202ENST00000519842 FBLN2P98095 1184 aa33.32■■■□□ 2.92
HOXA7-202ENST00000519842 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.27■■■□□ 2.92
HOXA7-202ENST00000519842 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.27■■■□□ 2.92
HOXA7-202ENST00000519842 SYNJ1O43426 1573 aa33.26■■■□□ 2.92
HOXA7-202ENST00000519842 GRIN2BQ13224 1484 aa33.26■■■□□ 2.92
HOXA7-202ENST00000519842 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.24■■■□□ 2.91
HOXA7-202ENST00000519842 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.23■■■□□ 2.91
HOXA7-202ENST00000519842 TOP2BQ02880 1626 aa33.22■■■□□ 2.91
HOXA7-202ENST00000519842 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.2■■■□□ 2.91
HOXA7-202ENST00000519842 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.16■■■□□ 2.9
HOXA7-202ENST00000519842 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.16■■■□□ 2.9
HOXA7-202ENST00000519842 SYNJ2O15056 1496 aa33.13■■■□□ 2.89
HOXA7-202ENST00000519842 ARAP1Q96P48 1450 aa33.09■■■□□ 2.89
HOXA7-202ENST00000519842 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
HOXA7-202ENST00000519842 ADAMTS12P58397 1594 aa33■■■□□ 2.87
HOXA7-202ENST00000519842 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.98■■■□□ 2.87
HOXA7-202ENST00000519842 GRIN2AQ12879 1464 aa32.88■■■□□ 2.85
HOXA7-202ENST00000519842 CEP170Q5SW79 1584 aa32.84■■■□□ 2.85
HOXA7-202ENST00000519842 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.82■■■□□ 2.84
HOXA7-202ENST00000519842 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.76■■■□□ 2.83
HOXA7-202ENST00000519842 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.75■■■□□ 2.83
HOXA7-202ENST00000519842 NUP160Q12769 1436 aa32.74■■■□□ 2.83
HOXA7-202ENST00000519842 SHROOM2Q13796 1616 aa32.64■■■□□ 2.82
HOXA7-202ENST00000519842 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXA7-202ENST00000519842 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
HOXA7-202ENST00000519842 CUL7Q14999 1698 aa32.46■■■□□ 2.79
HOXA7-202ENST00000519842 KIF27Q86VH2 1401 aa32.46■■■□□ 2.79
HOXA7-202ENST00000519842 IGF1RP08069 1367 aa32.41■■■□□ 2.78
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