RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519616.1

MGAT4B-208, Transcript of alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B, humanhuman

TSL 5

Gene MGAT4B, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4B-208ENST00000519616 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.81■■■■■ 6.2
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MGAT4B-208ENST00000519616 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.97■■■■■ 4.95
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MGAT4B-208ENST00000519616 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.13■■■■■ 4.65
MGAT4B-208ENST00000519616 SCRIBQ14160 1630 aa44.04■■■■■ 4.64
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MGAT4B-208ENST00000519616 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.38■■■■■ 4.54
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MGAT4B-208ENST00000519616 SMARCA2P51531 1590 aa41.93■■■■■ 4.3
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MGAT4B-208ENST00000519616 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
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MGAT4B-208ENST00000519616 CUX2O14529 1486 aa41.57■■■■■ 4.25
MGAT4B-208ENST00000519616 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.46■■■■■ 4.23
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MGAT4B-208ENST00000519616 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.84■■■■■ 4.13
MGAT4B-208ENST00000519616 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.74■■■■■ 4.11
MGAT4B-208ENST00000519616 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.58■■■■■ 4.09
MGAT4B-208ENST00000519616 WDR62O43379 1518 aa40.56■■■■■ 4.08
MGAT4B-208ENST00000519616 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
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MGAT4B-208ENST00000519616 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.43■■■■■ 4.06
MGAT4B-208ENST00000519616 CFTRP13569 1480 aa40.37■■■■■ 4.05
MGAT4B-208ENST00000519616 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.35■■■■■ 4.05
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MGAT4B-208ENST00000519616 IFT140Q96RY7 1462 aa39.59■■■■□ 3.93
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MGAT4B-208ENST00000519616 ABCC8Q09428 1581 aa39.5■■■■□ 3.91
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MGAT4B-208ENST00000519616 WDR97A6NE52 1622 aa39.01■■■■□ 3.84
MGAT4B-208ENST00000519616 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39■■■■□ 3.83
MGAT4B-208ENST00000519616 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.98■■■■□ 3.83
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MGAT4B-208ENST00000519616 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.67■■■■□ 3.78
MGAT4B-208ENST00000519616 GRIN2BQ13224 1484 aa38.66■■■■□ 3.78
MGAT4B-208ENST00000519616 FBLN2P98095 1184 aa38.66■■■■□ 3.78
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MGAT4B-208ENST00000519616 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.61■■■■□ 3.77
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MGAT4B-208ENST00000519616 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.48■■■■□ 3.75
MGAT4B-208ENST00000519616 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.47■■■■□ 3.75
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MGAT4B-208ENST00000519616 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.31■■■■□ 3.72
MGAT4B-208ENST00000519616 ADAMTS12P58397 1594 aa38.31■■■■□ 3.72
MGAT4B-208ENST00000519616 GRIN2AQ12879 1464 aa38.21■■■■□ 3.71
MGAT4B-208ENST00000519616 CEP170Q5SW79 1584 aa38.12■■■■□ 3.69
MGAT4B-208ENST00000519616 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.1■■■■□ 3.69
MGAT4B-208ENST00000519616 NUP160Q12769 1436 aa38.08■■■■□ 3.69
MGAT4B-208ENST00000519616 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.03■■■■□ 3.68
MGAT4B-208ENST00000519616 SHROOM2Q13796 1616 aa38.01■■■■□ 3.68
MGAT4B-208ENST00000519616 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
MGAT4B-208ENST00000519616 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38■■■■□ 3.67
MGAT4B-208ENST00000519616 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.79■■■■□ 3.64
MGAT4B-208ENST00000519616 CUL7Q14999 1698 aa37.63■■■■□ 3.62
MGAT4B-208ENST00000519616 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
MGAT4B-208ENST00000519616 KIF27Q86VH2 1401 aa37.53■■■■□ 3.6
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