RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519243.1

LOXL2-205, Transcript of lysyl oxidase like 2, humanhuman

TSL 2

Gene LOXL2, Length 763 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL2-205ENST00000519243 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.69■■■■■ 6.67
LOXL2-205ENST00000519243 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.55■■■■■ 5.68
LOXL2-205ENST00000519243 ABCC9O60706 1549 aa49.93■■■■■ 5.58
LOXL2-205ENST00000519243 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.8■■■■■ 5.24
LOXL2-205ENST00000519243 NACADO15069 1562 aa47.66■■■■■ 5.22
LOXL2-205ENST00000519243 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.49■■■■■ 5.19
LOXL2-205ENST00000519243 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.27■■■■■ 5.16
LOXL2-205ENST00000519243 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
LOXL2-205ENST00000519243 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.89■■■■■ 5.1
LOXL2-205ENST00000519243 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.81■■■■■ 5.08
LOXL2-205ENST00000519243 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.63■■■■■ 5.06
LOXL2-205ENST00000519243 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.49■■■■■ 5.03
LOXL2-205ENST00000519243 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.45■■■■■ 5.03
LOXL2-205ENST00000519243 SCRIBQ14160 1630 aa46.06■■■■■ 4.96
LOXL2-205ENST00000519243 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.84■■■■■ 4.93
LOXL2-205ENST00000519243 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
LOXL2-205ENST00000519243 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.17■■■■■ 4.82
LOXL2-205ENST00000519243 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.91■■■■■ 4.78
LOXL2-205ENST00000519243 SMARCA4P51532 1647 aa44.06■■■■■ 4.64
LOXL2-205ENST00000519243 NCAPD3P42695 1498 aa44.05■■■■■ 4.64
LOXL2-205ENST00000519243 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.98■■■■■ 4.63
LOXL2-205ENST00000519243 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
LOXL2-205ENST00000519243 SMARCA2P51531 1590 aa43.83■■■■■ 4.61
LOXL2-205ENST00000519243 HMGXB3Q12766 1538 aa43.71■■■■■ 4.59
LOXL2-205ENST00000519243 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.7■■■■■ 4.59
LOXL2-205ENST00000519243 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.67■■■■■ 4.58
LOXL2-205ENST00000519243 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
LOXL2-205ENST00000519243 WIZO95785 1651 aa43.19■■■■■ 4.5
LOXL2-205ENST00000519243 NESP48681 1621 aa43.11■■■■■ 4.49
LOXL2-205ENST00000519243 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
LOXL2-205ENST00000519243 ERCC6Q03468 1493 aa42.99■■■■■ 4.47
LOXL2-205ENST00000519243 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.89■■■■■ 4.46
LOXL2-205ENST00000519243 CUX2O14529 1486 aa42.78■■■■■ 4.44
LOXL2-205ENST00000519243 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.71■■■■■ 4.43
LOXL2-205ENST00000519243 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
LOXL2-205ENST00000519243 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.61■■■■■ 4.41
LOXL2-205ENST00000519243 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.55■■■■■ 4.4
LOXL2-205ENST00000519243 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
LOXL2-205ENST00000519243 CFTRP13569 1480 aa42.36■■■■■ 4.37
LOXL2-205ENST00000519243 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.22■■■■■ 4.35
LOXL2-205ENST00000519243 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.2■■■■■ 4.35
LOXL2-205ENST00000519243 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.18■■■■■ 4.34
LOXL2-205ENST00000519243 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.15■■■■■ 4.34
LOXL2-205ENST00000519243 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.13■■■■■ 4.34
LOXL2-205ENST00000519243 WDR62O43379 1518 aa42.1■■■■■ 4.33
LOXL2-205ENST00000519243 PRDM2Q13029 1718 aa41.95■■■■■ 4.31
LOXL2-205ENST00000519243 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
LOXL2-205ENST00000519243 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
LOXL2-205ENST00000519243 TOPBP1Q92547 1522 aa41.48■■■■■ 4.23
LOXL2-205ENST00000519243 ABCC8Q09428 1581 aa41.42■■■■■ 4.22
LOXL2-205ENST00000519243 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.35■■■■■ 4.21
LOXL2-205ENST00000519243 IFT140Q96RY7 1462 aa41.3■■■■■ 4.2
LOXL2-205ENST00000519243 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
LOXL2-205ENST00000519243 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
LOXL2-205ENST00000519243 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
LOXL2-205ENST00000519243 CUX1P39880 1505 aa41.01■■■■■ 4.16
LOXL2-205ENST00000519243 OSCARQ8IYS5 282 aa40.97■■■■■ 4.15
LOXL2-205ENST00000519243 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
LOXL2-205ENST00000519243 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.94■■■■■ 4.14
LOXL2-205ENST00000519243 SOGA1O94964 1423 aa40.93■■■■■ 4.14
LOXL2-205ENST00000519243 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.91■■■■■ 4.14
LOXL2-205ENST00000519243 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.9■■■■■ 4.14
LOXL2-205ENST00000519243 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
LOXL2-205ENST00000519243 WDR97A6NE52 1622 aa40.66■■■■■ 4.1
LOXL2-205ENST00000519243 CHD1O14646 1710 aa40.56■■■■■ 4.08
LOXL2-205ENST00000519243 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.51■■■■■ 4.08
LOXL2-205ENST00000519243 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.51■■■■■ 4.08
LOXL2-205ENST00000519243 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.5■■■■■ 4.07
LOXL2-205ENST00000519243 TOP2BQ02880 1626 aa40.49■■■■■ 4.07
LOXL2-205ENST00000519243 GRIN2BQ13224 1484 aa40.47■■■■■ 4.07
LOXL2-205ENST00000519243 SYNJ1O43426 1573 aa40.47■■■■■ 4.07
LOXL2-205ENST00000519243 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.46■■■■■ 4.07
LOXL2-205ENST00000519243 FBLN2P98095 1184 aa40.43■■■■■ 4.06
LOXL2-205ENST00000519243 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.41■■■■■ 4.06
LOXL2-205ENST00000519243 TRIM41Q8WV44 630 aa40.41■■■■■ 4.06
LOXL2-205ENST00000519243 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
LOXL2-205ENST00000519243 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.38■■■■■ 4.05
LOXL2-205ENST00000519243 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.34■■■■■ 4.05
LOXL2-205ENST00000519243 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.34■■■■■ 4.05
LOXL2-205ENST00000519243 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.34■■■■■ 4.05
LOXL2-205ENST00000519243 PBRM1Q86U86 1689 aa40.34■■■■■ 4.05
LOXL2-205ENST00000519243 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
LOXL2-205ENST00000519243 ARHGEF11O15085 1522 aa40.27■■■■■ 4.04
LOXL2-205ENST00000519243 SYNJ2O15056 1496 aa40.26■■■■■ 4.03
LOXL2-205ENST00000519243 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.14■■■■■ 4.02
LOXL2-205ENST00000519243 ADAMTS12P58397 1594 aa39.99■■■■□ 3.99
LOXL2-205ENST00000519243 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.99■■■■□ 3.99
LOXL2-205ENST00000519243 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.95■■■■□ 3.99
LOXL2-205ENST00000519243 GRIN2AQ12879 1464 aa39.94■■■■□ 3.98
LOXL2-205ENST00000519243 ARAP1Q96P48 1450 aa39.94■■■■□ 3.98
LOXL2-205ENST00000519243 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.93■■■■□ 3.98
LOXL2-205ENST00000519243 NUP160Q12769 1436 aa39.83■■■■□ 3.97
LOXL2-205ENST00000519243 CEP170Q5SW79 1584 aa39.8■■■■□ 3.96
LOXL2-205ENST00000519243 IGF1RP08069 1367 aa39.72■■■■□ 3.95
LOXL2-205ENST00000519243 KIF27Q86VH2 1401 aa39.69■■■■□ 3.94
LOXL2-205ENST00000519243 SHROOM2Q13796 1616 aa39.59■■■■□ 3.93
LOXL2-205ENST00000519243 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.58■■■■□ 3.93
LOXL2-205ENST00000519243 CUL7Q14999 1698 aa39.49■■■■□ 3.91
LOXL2-205ENST00000519243 JPH4Q96JJ6 628 aa39.45■■■■□ 3.91
LOXL2-205ENST00000519243 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.4■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms