RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519051.5

TSPAN18-204, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN18, Length 709 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-204ENST00000519051 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.28■■■■□ 3.56
TSPAN18-204ENST00000519051 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.13■■■□□ 2.89
TSPAN18-204ENST00000519051 ABCC9O60706 1549 aa32.5■■■□□ 2.79
TSPAN18-204ENST00000519051 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.25■■■□□ 2.59
TSPAN18-204ENST00000519051 NACADO15069 1562 aa31.22■■■□□ 2.59
TSPAN18-204ENST00000519051 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.17■■■□□ 2.58
TSPAN18-204ENST00000519051 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.03■■■□□ 2.56
TSPAN18-204ENST00000519051 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
TSPAN18-204ENST00000519051 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.87■■■□□ 2.53
TSPAN18-204ENST00000519051 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.47■■■□□ 2.47
TSPAN18-204ENST00000519051 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.39■■■□□ 2.46
TSPAN18-204ENST00000519051 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.3■■■□□ 2.44
TSPAN18-204ENST00000519051 SCRIBQ14160 1630 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPAN18-204ENST00000519051 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.01■■■□□ 2.4
TSPAN18-204ENST00000519051 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.95■■■□□ 2.39
TSPAN18-204ENST00000519051 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
TSPAN18-204ENST00000519051 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.39■■■□□ 2.3
TSPAN18-204ENST00000519051 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.23■■■□□ 2.27
TSPAN18-204ENST00000519051 SMARCA4P51532 1647 aa28.91■■■□□ 2.22
TSPAN18-204ENST00000519051 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
TSPAN18-204ENST00000519051 NCAPD3P42695 1498 aa28.83■■■□□ 2.21
TSPAN18-204ENST00000519051 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.81■■■□□ 2.2
TSPAN18-204ENST00000519051 SMARCA2P51531 1590 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPAN18-204ENST00000519051 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.71■■■□□ 2.19
TSPAN18-204ENST00000519051 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.67■■■□□ 2.18
TSPAN18-204ENST00000519051 HMGXB3Q12766 1538 aa28.64■■■□□ 2.18
TSPAN18-204ENST00000519051 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
TSPAN18-204ENST00000519051 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
TSPAN18-204ENST00000519051 WIZO95785 1651 aa28.37■■■□□ 2.13
TSPAN18-204ENST00000519051 NESP48681 1621 aa28.1■■■□□ 2.09
TSPAN18-204ENST00000519051 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
TSPAN18-204ENST00000519051 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.04■■■□□ 2.08
TSPAN18-204ENST00000519051 ERCC6Q03468 1493 aa28.02■■■□□ 2.08
TSPAN18-204ENST00000519051 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.99■■■□□ 2.07
TSPAN18-204ENST00000519051 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPAN18-204ENST00000519051 CFTRP13569 1480 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPAN18-204ENST00000519051 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPAN18-204ENST00000519051 CUX2O14529 1486 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPAN18-204ENST00000519051 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.73■■■□□ 2.03
TSPAN18-204ENST00000519051 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
TSPAN18-204ENST00000519051 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.63■■■□□ 2.01
TSPAN18-204ENST00000519051 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.59■■■□□ 2.01
TSPAN18-204ENST00000519051 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
TSPAN18-204ENST00000519051 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.57■■■□□ 2
TSPAN18-204ENST00000519051 WDR62O43379 1518 aa27.48■■□□□ 1.99
TSPAN18-204ENST00000519051 PRDM2Q13029 1718 aa27.48■■□□□ 1.99
TSPAN18-204ENST00000519051 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
TSPAN18-204ENST00000519051 ABCC8Q09428 1581 aa27.2■■□□□ 1.94
TSPAN18-204ENST00000519051 TOPBP1Q92547 1522 aa27.17■■□□□ 1.94
TSPAN18-204ENST00000519051 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPAN18-204ENST00000519051 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.06■■□□□ 1.92
TSPAN18-204ENST00000519051 IFT140Q96RY7 1462 aa27.04■■□□□ 1.92
TSPAN18-204ENST00000519051 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TSPAN18-204ENST00000519051 CUX1P39880 1505 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPAN18-204ENST00000519051 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TSPAN18-204ENST00000519051 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
TSPAN18-204ENST00000519051 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.86■■□□□ 1.89
TSPAN18-204ENST00000519051 SOGA1O94964 1423 aa26.85■■□□□ 1.89
TSPAN18-204ENST00000519051 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.82■■□□□ 1.88
TSPAN18-204ENST00000519051 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
TSPAN18-204ENST00000519051 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
TSPAN18-204ENST00000519051 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
TSPAN18-204ENST00000519051 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
TSPAN18-204ENST00000519051 TOP2BQ02880 1626 aa26.68■■□□□ 1.86
TSPAN18-204ENST00000519051 WDR97A6NE52 1622 aa26.68■■□□□ 1.86
TSPAN18-204ENST00000519051 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.67■■□□□ 1.86
TSPAN18-204ENST00000519051 OSCARQ8IYS5 282 aa26.66■■□□□ 1.86
TSPAN18-204ENST00000519051 SYNJ1O43426 1573 aa26.65■■□□□ 1.86
TSPAN18-204ENST00000519051 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.61■■□□□ 1.85
TSPAN18-204ENST00000519051 GRIN2BQ13224 1484 aa26.54■■□□□ 1.84
TSPAN18-204ENST00000519051 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN18-204ENST00000519051 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPAN18-204ENST00000519051 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPAN18-204ENST00000519051 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TSPAN18-204ENST00000519051 FBLN2P98095 1184 aa26.44■■□□□ 1.82
TSPAN18-204ENST00000519051 CHD1O14646 1710 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPAN18-204ENST00000519051 PBRM1Q86U86 1689 aa26.41■■□□□ 1.82
TSPAN18-204ENST00000519051 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
TSPAN18-204ENST00000519051 SYNJ2O15056 1496 aa26.37■■□□□ 1.81
TSPAN18-204ENST00000519051 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.29■■□□□ 1.8
TSPAN18-204ENST00000519051 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.23■■□□□ 1.79
TSPAN18-204ENST00000519051 ADAMTS12P58397 1594 aa26.22■■□□□ 1.79
TSPAN18-204ENST00000519051 KIF27Q86VH2 1401 aa26.21■■□□□ 1.79
TSPAN18-204ENST00000519051 GRIN2AQ12879 1464 aa26.18■■□□□ 1.78
TSPAN18-204ENST00000519051 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.18■■□□□ 1.78
TSPAN18-204ENST00000519051 ARHGEF11O15085 1522 aa26.17■■□□□ 1.78
TSPAN18-204ENST00000519051 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.16■■□□□ 1.78
TSPAN18-204ENST00000519051 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.16■■□□□ 1.78
TSPAN18-204ENST00000519051 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.16■■□□□ 1.78
TSPAN18-204ENST00000519051 IGF1RP08069 1367 aa26.14■■□□□ 1.78
TSPAN18-204ENST00000519051 NUP160Q12769 1436 aa26.09■■□□□ 1.77
TSPAN18-204ENST00000519051 TRIM41Q8WV44 630 aa26.09■■□□□ 1.77
TSPAN18-204ENST00000519051 CEP170Q5SW79 1584 aa26.03■■□□□ 1.76
TSPAN18-204ENST00000519051 CUL7Q14999 1698 aa26■■□□□ 1.75
TSPAN18-204ENST00000519051 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN18-204ENST00000519051 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN18-204ENST00000519051 ARAP1Q96P48 1450 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN18-204ENST00000519051 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN18-204ENST00000519051 SHROOM2Q13796 1616 aa25.87■■□□□ 1.73
TSPAN18-204ENST00000519051 JPH4Q96JJ6 628 aa25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms