RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518773.1

EGR3-202, Transcript of early growth response 3, humanhuman

TSL 4

Gene EGR3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3-202ENST00000518773 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.61■■■■■ 7.77
EGR3-202ENST00000518773 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.77■■■■■ 6.68
EGR3-202ENST00000518773 ABCC9O60706 1549 aa55.71■■■■■ 6.51
EGR3-202ENST00000518773 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.57■■■■■ 6.17
EGR3-202ENST00000518773 NACADO15069 1562 aa53.42■■■■■ 6.14
EGR3-202ENST00000518773 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.29■■■■■ 6.12
EGR3-202ENST00000518773 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.01■■■■■ 6.08
EGR3-202ENST00000518773 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.92■■■■■ 6.06
EGR3-202ENST00000518773 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.66■■■■■ 6.02
EGR3-202ENST00000518773 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.32■■■■■ 5.97
EGR3-202ENST00000518773 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.98■■■■■ 5.91
EGR3-202ENST00000518773 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.84■■■■■ 5.89
EGR3-202ENST00000518773 SCRIBQ14160 1630 aa51.7■■■■■ 5.87
EGR3-202ENST00000518773 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.4■■■■■ 5.82
EGR3-202ENST00000518773 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.29■■■■■ 5.8
EGR3-202ENST00000518773 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.55■■■■■ 5.68
EGR3-202ENST00000518773 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.42■■■■■ 5.66
EGR3-202ENST00000518773 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.12■■■■■ 5.61
EGR3-202ENST00000518773 SMARCA4P51532 1647 aa49.45■■■■■ 5.51
EGR3-202ENST00000518773 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.37■■■■■ 5.49
EGR3-202ENST00000518773 NCAPD3P42695 1498 aa49.25■■■■■ 5.47
EGR3-202ENST00000518773 SMARCA2P51531 1590 aa49.22■■■■■ 5.47
EGR3-202ENST00000518773 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.21■■■■■ 5.47
EGR3-202ENST00000518773 HMGXB3Q12766 1538 aa49.01■■■■■ 5.44
EGR3-202ENST00000518773 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.98■■■■■ 5.43
EGR3-202ENST00000518773 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.96■■■■■ 5.43
EGR3-202ENST00000518773 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.84■■■■■ 5.41
EGR3-202ENST00000518773 WIZO95785 1651 aa48.47■■■■■ 5.35
EGR3-202ENST00000518773 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.32■■■■■ 5.33
EGR3-202ENST00000518773 ERCC6Q03468 1493 aa48.12■■■■■ 5.29
EGR3-202ENST00000518773 NESP48681 1621 aa48.1■■■■■ 5.29
EGR3-202ENST00000518773 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.05■■■■■ 5.28
EGR3-202ENST00000518773 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
EGR3-202ENST00000518773 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.8■■■■■ 5.24
EGR3-202ENST00000518773 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.73■■■■■ 5.23
EGR3-202ENST00000518773 CUX2O14529 1486 aa47.71■■■■■ 5.23
EGR3-202ENST00000518773 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.61■■■■■ 5.21
EGR3-202ENST00000518773 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
EGR3-202ENST00000518773 CFTRP13569 1480 aa47.45■■■■■ 5.19
EGR3-202ENST00000518773 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.36■■■■■ 5.17
EGR3-202ENST00000518773 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.26■■■■■ 5.16
EGR3-202ENST00000518773 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.26■■■■■ 5.16
EGR3-202ENST00000518773 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.22■■■■■ 5.15
EGR3-202ENST00000518773 PRDM2Q13029 1718 aa47.19■■■■■ 5.14
EGR3-202ENST00000518773 WDR62O43379 1518 aa47.07■■■■■ 5.13
EGR3-202ENST00000518773 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.91■■■■■ 5.1
EGR3-202ENST00000518773 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.75■■■■■ 5.07
EGR3-202ENST00000518773 ABCC8Q09428 1581 aa46.54■■■■■ 5.04
EGR3-202ENST00000518773 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.52■■■■■ 5.04
EGR3-202ENST00000518773 TOPBP1Q92547 1522 aa46.46■■■■■ 5.03
EGR3-202ENST00000518773 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.41■■■■■ 5.02
EGR3-202ENST00000518773 IFT140Q96RY7 1462 aa46.27■■■■■ 5
EGR3-202ENST00000518773 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.04■■■■■ 4.96
EGR3-202ENST00000518773 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46■■■■■ 4.95
EGR3-202ENST00000518773 CUX1P39880 1505 aa45.98■■■■■ 4.95
EGR3-202ENST00000518773 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.97■■■■■ 4.95
EGR3-202ENST00000518773 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.9■■■■■ 4.94
EGR3-202ENST00000518773 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.88■■■■■ 4.94
EGR3-202ENST00000518773 SOGA1O94964 1423 aa45.87■■■■■ 4.93
EGR3-202ENST00000518773 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.8■■■■■ 4.92
EGR3-202ENST00000518773 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.73■■■■■ 4.91
EGR3-202ENST00000518773 OSCARQ8IYS5 282 aa45.69■■■■■ 4.9
EGR3-202ENST00000518773 WDR97A6NE52 1622 aa45.69■■■■■ 4.9
EGR3-202ENST00000518773 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.62■■■■■ 4.89
EGR3-202ENST00000518773 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.6■■■■■ 4.89
EGR3-202ENST00000518773 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.57■■■■■ 4.89
EGR3-202ENST00000518773 TOP2BQ02880 1626 aa45.56■■■■■ 4.88
EGR3-202ENST00000518773 SYNJ1O43426 1573 aa45.49■■■■■ 4.87
EGR3-202ENST00000518773 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.45■■■■■ 4.87
EGR3-202ENST00000518773 CHD1O14646 1710 aa45.39■■■■■ 4.86
EGR3-202ENST00000518773 GRIN2BQ13224 1484 aa45.38■■■■■ 4.86
EGR3-202ENST00000518773 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.35■■■■■ 4.85
EGR3-202ENST00000518773 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.33■■■■■ 4.85
EGR3-202ENST00000518773 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.31■■■■■ 4.84
EGR3-202ENST00000518773 PBRM1Q86U86 1689 aa45.31■■■■■ 4.84
EGR3-202ENST00000518773 FBLN2P98095 1184 aa45.3■■■■■ 4.84
EGR3-202ENST00000518773 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.3■■■■■ 4.84
EGR3-202ENST00000518773 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
EGR3-202ENST00000518773 SYNJ2O15056 1496 aa45.12■■■■■ 4.81
EGR3-202ENST00000518773 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.95■■■■■ 4.79
EGR3-202ENST00000518773 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.95■■■■■ 4.79
EGR3-202ENST00000518773 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.95■■■■■ 4.79
EGR3-202ENST00000518773 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.94■■■■■ 4.78
EGR3-202ENST00000518773 ARHGEF11O15085 1522 aa44.91■■■■■ 4.78
EGR3-202ENST00000518773 TRIM41Q8WV44 630 aa44.89■■■■■ 4.78
EGR3-202ENST00000518773 ADAMTS12P58397 1594 aa44.89■■■■■ 4.78
EGR3-202ENST00000518773 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.84■■■■■ 4.77
EGR3-202ENST00000518773 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.82■■■■■ 4.77
EGR3-202ENST00000518773 GRIN2AQ12879 1464 aa44.78■■■■■ 4.76
EGR3-202ENST00000518773 KIF27Q86VH2 1401 aa44.73■■■■■ 4.75
EGR3-202ENST00000518773 NUP160Q12769 1436 aa44.58■■■■■ 4.73
EGR3-202ENST00000518773 CEP170Q5SW79 1584 aa44.55■■■■■ 4.72
EGR3-202ENST00000518773 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.51■■■■■ 4.72
EGR3-202ENST00000518773 CUL7Q14999 1698 aa44.51■■■■■ 4.72
EGR3-202ENST00000518773 IGF1RP08069 1367 aa44.5■■■■■ 4.71
EGR3-202ENST00000518773 ARAP1Q96P48 1450 aa44.49■■■■■ 4.71
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EGR3-202ENST00000518773 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.28■■■■■ 4.68
EGR3-202ENST00000518773 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.23■■■■■ 4.67
EGR3-202ENST00000518773 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.14■■■■■ 4.66
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