RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518107.5

PDP1-204, Transcript of pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1, humanhuman

TSL 4

Gene PDP1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1-204ENST00000518107 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.2■■■■■ 6.75
PDP1-204ENST00000518107 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.43■■■■■ 5.82
PDP1-204ENST00000518107 ABCC9O60706 1549 aa51.41■■■■■ 5.82
PDP1-204ENST00000518107 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.02■■■■■ 5.44
PDP1-204ENST00000518107 NACADO15069 1562 aa48.69■■■■■ 5.39
PDP1-204ENST00000518107 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.29■■■■■ 5.32
PDP1-204ENST00000518107 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.25■■■■■ 5.31
PDP1-204ENST00000518107 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.07■■■■■ 5.29
PDP1-204ENST00000518107 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.82■■■■■ 5.25
PDP1-204ENST00000518107 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.75■■■■■ 5.23
PDP1-204ENST00000518107 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.49■■■■■ 5.19
PDP1-204ENST00000518107 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.38■■■■■ 5.17
PDP1-204ENST00000518107 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.36■■■■■ 5.17
PDP1-204ENST00000518107 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.09■■■■■ 5.13
PDP1-204ENST00000518107 SCRIBQ14160 1630 aa46.7■■■■■ 5.07
PDP1-204ENST00000518107 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.48■■■■■ 5.03
PDP1-204ENST00000518107 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.4■■■■■ 5.02
PDP1-204ENST00000518107 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.38■■■■■ 5.01
PDP1-204ENST00000518107 NCAPD3P42695 1498 aa44.94■■■■■ 4.78
PDP1-204ENST00000518107 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.73■■■■■ 4.75
PDP1-204ENST00000518107 SMARCA2P51531 1590 aa44.66■■■■■ 4.74
PDP1-204ENST00000518107 SMARCA4P51532 1647 aa44.62■■■■■ 4.73
PDP1-204ENST00000518107 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.6■■■■■ 4.73
PDP1-204ENST00000518107 HMGXB3Q12766 1538 aa44.59■■■■■ 4.73
PDP1-204ENST00000518107 CUX2O14529 1486 aa44.53■■■■■ 4.72
PDP1-204ENST00000518107 ERCC6Q03468 1493 aa44.49■■■■■ 4.71
PDP1-204ENST00000518107 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
PDP1-204ENST00000518107 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
PDP1-204ENST00000518107 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.27■■■■■ 4.68
PDP1-204ENST00000518107 NESP48681 1621 aa44.1■■■■■ 4.65
PDP1-204ENST00000518107 MROH2BQ7Z745 1585 aa44■■■■■ 4.63
PDP1-204ENST00000518107 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.94■■■■■ 4.62
PDP1-204ENST00000518107 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
PDP1-204ENST00000518107 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.73■■■■■ 4.59
PDP1-204ENST00000518107 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.55■■■■■ 4.56
PDP1-204ENST00000518107 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.53■■■■■ 4.56
PDP1-204ENST00000518107 WIZO95785 1651 aa43.43■■■■■ 4.54
PDP1-204ENST00000518107 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.29■■■■■ 4.52
PDP1-204ENST00000518107 WDR62O43379 1518 aa43.18■■■■■ 4.5
PDP1-204ENST00000518107 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.09■■■■■ 4.49
PDP1-204ENST00000518107 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.09■■■■■ 4.49
PDP1-204ENST00000518107 CFTRP13569 1480 aa43.02■■■■■ 4.48
PDP1-204ENST00000518107 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.01■■■■■ 4.48
PDP1-204ENST00000518107 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
PDP1-204ENST00000518107 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
PDP1-204ENST00000518107 PRDM2Q13029 1718 aa42.54■■■■■ 4.4
PDP1-204ENST00000518107 OSCARQ8IYS5 282 aa42.46■■■■■ 4.39
PDP1-204ENST00000518107 TRIM41Q8WV44 630 aa42.46■■■■■ 4.39
PDP1-204ENST00000518107 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.46■■■■■ 4.39
PDP1-204ENST00000518107 IFT140Q96RY7 1462 aa42.27■■■■■ 4.36
PDP1-204ENST00000518107 ABCC8Q09428 1581 aa42.22■■■■■ 4.35
PDP1-204ENST00000518107 TOPBP1Q92547 1522 aa42.17■■■■■ 4.34
PDP1-204ENST00000518107 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
PDP1-204ENST00000518107 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.03■■■■■ 4.32
PDP1-204ENST00000518107 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
PDP1-204ENST00000518107 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.8■■■■■ 4.28
PDP1-204ENST00000518107 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.8■■■■■ 4.28
PDP1-204ENST00000518107 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.8■■■■■ 4.28
PDP1-204ENST00000518107 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
PDP1-204ENST00000518107 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
PDP1-204ENST00000518107 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.71■■■■■ 4.27
PDP1-204ENST00000518107 ARHGEF11O15085 1522 aa41.69■■■■■ 4.27
PDP1-204ENST00000518107 SOGA1O94964 1423 aa41.57■■■■■ 4.25
PDP1-204ENST00000518107 CHD1O14646 1710 aa41.55■■■■■ 4.24
PDP1-204ENST00000518107 WDR97A6NE52 1622 aa41.52■■■■■ 4.24
PDP1-204ENST00000518107 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.51■■■■■ 4.24
PDP1-204ENST00000518107 FBLN2P98095 1184 aa41.48■■■■■ 4.23
PDP1-204ENST00000518107 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
PDP1-204ENST00000518107 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.44■■■■■ 4.22
PDP1-204ENST00000518107 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.39■■■■■ 4.22
PDP1-204ENST00000518107 CUX1P39880 1505 aa41.35■■■■■ 4.21
PDP1-204ENST00000518107 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.3■■■■■ 4.2
PDP1-204ENST00000518107 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
PDP1-204ENST00000518107 GRIN2BQ13224 1484 aa41.25■■■■■ 4.19
PDP1-204ENST00000518107 ARAP1Q96P48 1450 aa41.25■■■■■ 4.19
PDP1-204ENST00000518107 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
PDP1-204ENST00000518107 SYNJ1O43426 1573 aa41.16■■■■■ 4.18
PDP1-204ENST00000518107 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.14■■■■■ 4.18
PDP1-204ENST00000518107 SYNJ2O15056 1496 aa41.13■■■■■ 4.17
PDP1-204ENST00000518107 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.07■■■■■ 4.16
PDP1-204ENST00000518107 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.03■■■■■ 4.16
PDP1-204ENST00000518107 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
PDP1-204ENST00000518107 PBRM1Q86U86 1689 aa40.98■■■■■ 4.15
PDP1-204ENST00000518107 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
PDP1-204ENST00000518107 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.93■■■■■ 4.14
PDP1-204ENST00000518107 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.86■■■■■ 4.13
PDP1-204ENST00000518107 TOP2BQ02880 1626 aa40.72■■■■■ 4.11
PDP1-204ENST00000518107 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.71■■■■■ 4.11
PDP1-204ENST00000518107 GRIN2AQ12879 1464 aa40.69■■■■■ 4.1
PDP1-204ENST00000518107 ADAMTS12P58397 1594 aa40.62■■■■■ 4.09
PDP1-204ENST00000518107 NUP160Q12769 1436 aa40.59■■■■■ 4.09
PDP1-204ENST00000518107 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.58■■■■■ 4.09
PDP1-204ENST00000518107 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.54■■■■■ 4.08
PDP1-204ENST00000518107 CEP170Q5SW79 1584 aa40.48■■■■■ 4.07
PDP1-204ENST00000518107 SHROOM2Q13796 1616 aa40.38■■■■■ 4.06
PDP1-204ENST00000518107 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.37■■■■■ 4.05
PDP1-204ENST00000518107 JPH4Q96JJ6 628 aa40.18■■■■■ 4.02
PDP1-204ENST00000518107 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
PDP1-204ENST00000518107 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.04■■■■■ 4
PDP1-204ENST00000518107 KIF27Q86VH2 1401 aa39.98■■■■□ 3.99
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