RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518088.5

HOXA-AS2-205, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXA-AS2, Length 509 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-205ENST00000518088 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.51■■■□□ 2.15
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HOXA-AS2-205ENST00000518088 ABCC9O60706 1549 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXA-AS2-205ENST00000518088 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA-AS2-205ENST00000518088 NACADO15069 1562 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXA-AS2-205ENST00000518088 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXA-AS2-205ENST00000518088 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXA-AS2-205ENST00000518088 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXA-AS2-205ENST00000518088 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
HOXA-AS2-205ENST00000518088 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
HOXA-AS2-205ENST00000518088 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SCRIBQ14160 1630 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-205ENST00000518088 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-205ENST00000518088 NCAPD3P42695 1498 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SMARCA4P51532 1647 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SMARCA2P51531 1590 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA-AS2-205ENST00000518088 HMGXB3Q12766 1538 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA-AS2-205ENST00000518088 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CUX2O14529 1486 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ERCC6Q03468 1493 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA-AS2-205ENST00000518088 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXA-AS2-205ENST00000518088 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXA-AS2-205ENST00000518088 NESP48681 1621 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXA-AS2-205ENST00000518088 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXA-AS2-205ENST00000518088 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXA-AS2-205ENST00000518088 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA-AS2-205ENST00000518088 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXA-AS2-205ENST00000518088 WIZO95785 1651 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXA-AS2-205ENST00000518088 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXA-AS2-205ENST00000518088 WDR62O43379 1518 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXA-AS2-205ENST00000518088 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-205ENST00000518088 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CFTRP13569 1480 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-205ENST00000518088 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PRDM2Q13029 1718 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-205ENST00000518088 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA-AS2-205ENST00000518088 TRIM41Q8WV44 630 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXA-AS2-205ENST00000518088 OSCARQ8IYS5 282 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA-AS2-205ENST00000518088 IFT140Q96RY7 1462 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ABCC8Q09428 1581 aa21.02■□□□□ 0.95
HOXA-AS2-205ENST00000518088 TOPBP1Q92547 1522 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
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HOXA-AS2-205ENST00000518088 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
HOXA-AS2-205ENST00000518088 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HOXA-AS2-205ENST00000518088 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXA-AS2-205ENST00000518088 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXA-AS2-205ENST00000518088 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXA-AS2-205ENST00000518088 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ARHGEF11O15085 1522 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXA-AS2-205ENST00000518088 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.75■□□□□ 0.91
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CHD1O14646 1710 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA-AS2-205ENST00000518088 WDR97A6NE52 1622 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SOGA1O94964 1423 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXA-AS2-205ENST00000518088 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXA-AS2-205ENST00000518088 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXA-AS2-205ENST00000518088 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CUX1P39880 1505 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA-AS2-205ENST00000518088 FBLN2P98095 1184 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXA-AS2-205ENST00000518088 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXA-AS2-205ENST00000518088 GRIN2BQ13224 1484 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ARAP1Q96P48 1450 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SYNJ1O43426 1573 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SYNJ2O15056 1496 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PBRM1Q86U86 1689 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA-AS2-205ENST00000518088 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA-AS2-205ENST00000518088 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
HOXA-AS2-205ENST00000518088 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXA-AS2-205ENST00000518088 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-205ENST00000518088 TOP2BQ02880 1626 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-205ENST00000518088 GRIN2AQ12879 1464 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ADAMTS12P58397 1594 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXA-AS2-205ENST00000518088 NUP160Q12769 1436 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-205ENST00000518088 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CEP170Q5SW79 1584 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SHROOM2Q13796 1616 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-205ENST00000518088 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXA-AS2-205ENST00000518088 JPH4Q96JJ6 628 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXA-AS2-205ENST00000518088 KIF27Q86VH2 1401 aa19.92■□□□□ 0.78
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