RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.63■■■■■ 7.62
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.79■■■■■ 6.52
TCEA1-202ENST00000517351 ABCC9O60706 1549 aa54.89■■■■■ 6.38
TCEA1-202ENST00000517351 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.65■■■■■ 6.02
TCEA1-202ENST00000517351 NACADO15069 1562 aa52.52■■■■■ 6
TCEA1-202ENST00000517351 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.5■■■■■ 5.99
TCEA1-202ENST00000517351 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.11■■■■■ 5.93
TCEA1-202ENST00000517351 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.1■■■■■ 5.93
TCEA1-202ENST00000517351 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.78■■■■■ 5.88
TCEA1-202ENST00000517351 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.45■■■■■ 5.83
TCEA1-202ENST00000517351 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.25■■■■■ 5.79
TCEA1-202ENST00000517351 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.06■■■■■ 5.76
TCEA1-202ENST00000517351 SCRIBQ14160 1630 aa50.91■■■■■ 5.74
TCEA1-202ENST00000517351 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.61■■■■■ 5.69
TCEA1-202ENST00000517351 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.47■■■■■ 5.67
TCEA1-202ENST00000517351 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.75■■■■■ 5.55
TCEA1-202ENST00000517351 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.62■■■■■ 5.53
TCEA1-202ENST00000517351 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.33■■■■■ 5.49
TCEA1-202ENST00000517351 SMARCA4P51532 1647 aa48.65■■■■■ 5.38
TCEA1-202ENST00000517351 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.56■■■■■ 5.36
TCEA1-202ENST00000517351 NCAPD3P42695 1498 aa48.47■■■■■ 5.35
TCEA1-202ENST00000517351 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.46■■■■■ 5.35
TCEA1-202ENST00000517351 SMARCA2P51531 1590 aa48.39■■■■■ 5.34
TCEA1-202ENST00000517351 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.27■■■■■ 5.32
TCEA1-202ENST00000517351 HMGXB3Q12766 1538 aa48.2■■■■■ 5.31
TCEA1-202ENST00000517351 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.16■■■■■ 5.3
TCEA1-202ENST00000517351 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.06■■■■■ 5.28
TCEA1-202ENST00000517351 WIZO95785 1651 aa47.74■■■■■ 5.23
TCEA1-202ENST00000517351 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.62■■■■■ 5.21
TCEA1-202ENST00000517351 NESP48681 1621 aa47.41■■■■■ 5.18
TCEA1-202ENST00000517351 ERCC6Q03468 1493 aa47.33■■■■■ 5.17
TCEA1-202ENST00000517351 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.24■■■■■ 5.15
TCEA1-202ENST00000517351 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
TCEA1-202ENST00000517351 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.05■■■■■ 5.12
TCEA1-202ENST00000517351 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.94■■■■■ 5.1
TCEA1-202ENST00000517351 CUX2O14529 1486 aa46.89■■■■■ 5.1
TCEA1-202ENST00000517351 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.83■■■■■ 5.09
TCEA1-202ENST00000517351 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
TCEA1-202ENST00000517351 CFTRP13569 1480 aa46.7■■■■■ 5.07
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.66■■■■■ 5.06
TCEA1-202ENST00000517351 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.52■■■■■ 5.04
TCEA1-202ENST00000517351 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.49■■■■■ 5.03
TCEA1-202ENST00000517351 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.48■■■■■ 5.03
TCEA1-202ENST00000517351 PRDM2Q13029 1718 aa46.33■■■■■ 5.01
TCEA1-202ENST00000517351 WDR62O43379 1518 aa46.32■■■■■ 5.01
TCEA1-202ENST00000517351 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.27■■■■■ 5
TCEA1-202ENST00000517351 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.07■■■■■ 4.97
TCEA1-202ENST00000517351 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.79■■■■■ 4.92
TCEA1-202ENST00000517351 TOPBP1Q92547 1522 aa45.75■■■■■ 4.91
TCEA1-202ENST00000517351 ABCC8Q09428 1581 aa45.71■■■■■ 4.91
TCEA1-202ENST00000517351 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.67■■■■■ 4.9
TCEA1-202ENST00000517351 IFT140Q96RY7 1462 aa45.52■■■■■ 4.88
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.34■■■■■ 4.85
TCEA1-202ENST00000517351 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.34■■■■■ 4.85
TCEA1-202ENST00000517351 CUX1P39880 1505 aa45.3■■■■■ 4.84
TCEA1-202ENST00000517351 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
TCEA1-202ENST00000517351 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.2■■■■■ 4.83
TCEA1-202ENST00000517351 SOGA1O94964 1423 aa45.16■■■■■ 4.82
TCEA1-202ENST00000517351 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.16■■■■■ 4.82
TCEA1-202ENST00000517351 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
TCEA1-202ENST00000517351 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.06■■■■■ 4.84e-8■■□□□ 13.7
TCEA1-202ENST00000517351 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.94■■■■■ 4.79
TCEA1-202ENST00000517351 OSCARQ8IYS5 282 aa44.94■■■■■ 4.78
TCEA1-202ENST00000517351 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.92■■■■■ 4.78
TCEA1-202ENST00000517351 WDR97A6NE52 1622 aa44.86■■■■■ 4.77
TCEA1-202ENST00000517351 TOP2BQ02880 1626 aa44.83■■■■■ 4.77
TCEA1-202ENST00000517351 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.83■■■■■ 4.77
TCEA1-202ENST00000517351 SYNJ1O43426 1573 aa44.81■■■■■ 4.76
TCEA1-202ENST00000517351 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.73■■■■■ 4.75
TCEA1-202ENST00000517351 GRIN2BQ13224 1484 aa44.66■■■■■ 4.74
TCEA1-202ENST00000517351 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.64■■■■■ 4.74
TCEA1-202ENST00000517351 CHD1O14646 1710 aa44.64■■■■■ 4.74
TCEA1-202ENST00000517351 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.63■■■■■ 4.73
TCEA1-202ENST00000517351 FBLN2P98095 1184 aa44.61■■■■■ 4.73
TCEA1-202ENST00000517351 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.57■■■■■ 4.73
TCEA1-202ENST00000517351 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.56■■■■■ 4.72
TCEA1-202ENST00000517351 PBRM1Q86U86 1689 aa44.55■■■■■ 4.72
TCEA1-202ENST00000517351 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.43■■■■■ 4.7
TCEA1-202ENST00000517351 SYNJ2O15056 1496 aa44.4■■■■■ 4.7
TCEA1-202ENST00000517351 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.23■■■■■ 4.67
TCEA1-202ENST00000517351 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.23■■■■■ 4.67
TCEA1-202ENST00000517351 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.23■■■■■ 4.67
TCEA1-202ENST00000517351 TRIM41Q8WV44 630 aa44.22■■■■■ 4.67
TCEA1-202ENST00000517351 ARHGEF11O15085 1522 aa44.19■■■■■ 4.67
TCEA1-202ENST00000517351 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.19■■■■■ 4.66
TCEA1-202ENST00000517351 ADAMTS12P58397 1594 aa44.18■■■■■ 4.66
TCEA1-202ENST00000517351 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.14■■■■■ 4.66
TCEA1-202ENST00000517351 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.1■■■■■ 4.65
TCEA1-202ENST00000517351 GRIN2AQ12879 1464 aa44.08■■■■■ 4.65
TCEA1-202ENST00000517351 KIF27Q86VH2 1401 aa44■■■■■ 4.63
TCEA1-202ENST00000517351 NUP160Q12769 1436 aa43.89■■■■■ 4.62
TCEA1-202ENST00000517351 CEP170Q5SW79 1584 aa43.87■■■■■ 4.61
TCEA1-202ENST00000517351 IGF1RP08069 1367 aa43.85■■■■■ 4.61
TCEA1-202ENST00000517351 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.83■■■■■ 4.61
TCEA1-202ENST00000517351 ARAP1Q96P48 1450 aa43.83■■■■■ 4.61
TCEA1-202ENST00000517351 CUL7Q14999 1698 aa43.74■■■■■ 4.59
TCEA1-202ENST00000517351 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.6■■■■■ 4.57
TCEA1-202ENST00000517351 SHROOM2Q13796 1616 aa43.58■■■■■ 4.57
TCEA1-202ENST00000517351 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.53■■■■■ 4.56
TCEA1-202ENST00000517351 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.52■■■■■ 4.56
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