RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515554.1

JADE2-210, Transcript of jade family PHD finger 2, humanhuman

TSL 4

Gene JADE2, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JADE2-210ENST00000515554 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.8■■■■■ 7.8
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JADE2-210ENST00000515554 ABCC9O60706 1549 aa57■■■■■ 6.72
JADE2-210ENST00000515554 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.42■■■■■ 6.3
JADE2-210ENST00000515554 NACADO15069 1562 aa54.08■■■■■ 6.25
JADE2-210ENST00000515554 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.58■■■■■ 6.17
JADE2-210ENST00000515554 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.43■■■■■ 6.14
JADE2-210ENST00000515554 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.29■■■■■ 6.12
JADE2-210ENST00000515554 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.25■■■■■ 6.12
JADE2-210ENST00000515554 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.01■■■■■ 6.08
JADE2-210ENST00000515554 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.93■■■■■ 6.06
JADE2-210ENST00000515554 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.81■■■■■ 6.05
JADE2-210ENST00000515554 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.78■■■■■ 6.04
JADE2-210ENST00000515554 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.21■■■■■ 5.95
JADE2-210ENST00000515554 SCRIBQ14160 1630 aa52.11■■■■■ 5.93
JADE2-210ENST00000515554 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.57■■■■■ 5.85
JADE2-210ENST00000515554 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.51■■■■■ 5.84
JADE2-210ENST00000515554 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.37■■■■■ 5.81
JADE2-210ENST00000515554 NCAPD3P42695 1498 aa49.89■■■■■ 5.58
JADE2-210ENST00000515554 SMARCA4P51532 1647 aa49.77■■■■■ 5.56
JADE2-210ENST00000515554 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.74■■■■■ 5.55
JADE2-210ENST00000515554 SMARCA2P51531 1590 aa49.66■■■■■ 5.54
JADE2-210ENST00000515554 HMGXB3Q12766 1538 aa49.59■■■■■ 5.53
JADE2-210ENST00000515554 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.53■■■■■ 5.52
JADE2-210ENST00000515554 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.32■■■■■ 5.49
JADE2-210ENST00000515554 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.26■■■■■ 5.48
JADE2-210ENST00000515554 ERCC6Q03468 1493 aa49.23■■■■■ 5.47
JADE2-210ENST00000515554 CUX2O14529 1486 aa49.18■■■■■ 5.46
JADE2-210ENST00000515554 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.13■■■■■ 5.46
JADE2-210ENST00000515554 NESP48681 1621 aa49.01■■■■■ 5.44
JADE2-210ENST00000515554 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.89■■■■■ 5.42
JADE2-210ENST00000515554 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.79■■■■■ 5.4
JADE2-210ENST00000515554 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.6■■■■■ 5.37
JADE2-210ENST00000515554 WIZO95785 1651 aa48.56■■■■■ 5.36
JADE2-210ENST00000515554 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.48■■■■■ 5.35
JADE2-210ENST00000515554 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.44■■■■■ 5.35
JADE2-210ENST00000515554 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.35■■■■■ 5.33
JADE2-210ENST00000515554 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.15■■■■■ 5.3
JADE2-210ENST00000515554 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.04■■■■■ 5.28
JADE2-210ENST00000515554 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48■■■■■ 5.27
JADE2-210ENST00000515554 WDR62O43379 1518 aa47.95■■■■■ 5.27
JADE2-210ENST00000515554 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.87■■■■■ 5.25
JADE2-210ENST00000515554 CFTRP13569 1480 aa47.85■■■■■ 5.25
JADE2-210ENST00000515554 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.8■■■■■ 5.24
JADE2-210ENST00000515554 PRDM2Q13029 1718 aa47.53■■■■■ 5.2
JADE2-210ENST00000515554 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
JADE2-210ENST00000515554 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.38■■■■■ 5.17
JADE2-210ENST00000515554 TOPBP1Q92547 1522 aa46.94■■■■■ 5.1
JADE2-210ENST00000515554 IFT140Q96RY7 1462 aa46.92■■■■■ 5.1
JADE2-210ENST00000515554 ABCC8Q09428 1581 aa46.87■■■■■ 5.09
JADE2-210ENST00000515554 OSCARQ8IYS5 282 aa46.83■■■■■ 5.09
JADE2-210ENST00000515554 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.81■■■■■ 5.08
JADE2-210ENST00000515554 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.78■■■■■ 5.08
JADE2-210ENST00000515554 TRIM41Q8WV44 630 aa46.72■■■■■ 5.07
JADE2-210ENST00000515554 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
JADE2-210ENST00000515554 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
JADE2-210ENST00000515554 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.46■■■■■ 5.03
JADE2-210ENST00000515554 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.34■■■■■ 5.01
JADE2-210ENST00000515554 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.31■■■■■ 5
JADE2-210ENST00000515554 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.31■■■■■ 5
JADE2-210ENST00000515554 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.31■■■■■ 5
JADE2-210ENST00000515554 CHD1O14646 1710 aa46.25■■■■■ 5
JADE2-210ENST00000515554 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.24■■■■■ 4.99
JADE2-210ENST00000515554 SOGA1O94964 1423 aa46.2■■■■■ 4.99
JADE2-210ENST00000515554 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.18■■■■■ 4.98
JADE2-210ENST00000515554 CUX1P39880 1505 aa46.17■■■■■ 4.98
JADE2-210ENST00000515554 ARHGEF11O15085 1522 aa46.16■■■■■ 4.98
JADE2-210ENST00000515554 WDR97A6NE52 1622 aa46.16■■■■■ 4.98
JADE2-210ENST00000515554 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.06■■■■■ 4.96
JADE2-210ENST00000515554 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.97■■■■■ 4.95
JADE2-210ENST00000515554 FBLN2P98095 1184 aa45.94■■■■■ 4.94
JADE2-210ENST00000515554 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.93■■■■■ 4.94
JADE2-210ENST00000515554 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.86■■■■■ 4.93
JADE2-210ENST00000515554 GRIN2BQ13224 1484 aa45.83■■■■■ 4.93
JADE2-210ENST00000515554 PBRM1Q86U86 1689 aa45.74■■■■■ 4.91
JADE2-210ENST00000515554 ARAP1Q96P48 1450 aa45.71■■■■■ 4.91
JADE2-210ENST00000515554 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.71■■■■■ 4.91
JADE2-210ENST00000515554 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.7■■■■■ 4.91
JADE2-210ENST00000515554 SYNJ1O43426 1573 aa45.7■■■■■ 4.91
JADE2-210ENST00000515554 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.69■■■■■ 4.9
JADE2-210ENST00000515554 SYNJ2O15056 1496 aa45.68■■■■■ 4.9
JADE2-210ENST00000515554 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.68■■■■■ 4.9
JADE2-210ENST00000515554 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.67■■■■■ 4.9
JADE2-210ENST00000515554 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.65■■■■■ 4.9
JADE2-210ENST00000515554 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.53■■■■■ 4.88
JADE2-210ENST00000515554 TOP2BQ02880 1626 aa45.5■■■■■ 4.87
JADE2-210ENST00000515554 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.48■■■■■ 4.87
JADE2-210ENST00000515554 ADAMTS12P58397 1594 aa45.29■■■■■ 4.84
JADE2-210ENST00000515554 GRIN2AQ12879 1464 aa45.25■■■■■ 4.83
JADE2-210ENST00000515554 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.14■■■■■ 4.82
JADE2-210ENST00000515554 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.13■■■■■ 4.82
JADE2-210ENST00000515554 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.11■■■■■ 4.81
JADE2-210ENST00000515554 NUP160Q12769 1436 aa45.11■■■■■ 4.81
JADE2-210ENST00000515554 CEP170Q5SW79 1584 aa45.1■■■■■ 4.81
JADE2-210ENST00000515554 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.94■■■■■ 4.79
JADE2-210ENST00000515554 SHROOM2Q13796 1616 aa44.94■■■■■ 4.79
JADE2-210ENST00000515554 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.65■■■■■ 4.74
JADE2-210ENST00000515554 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
JADE2-210ENST00000515554 KIF27Q86VH2 1401 aa44.57■■■■■ 4.72
JADE2-210ENST00000515554 JPH4Q96JJ6 628 aa44.55■■■■■ 4.72
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