RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515332.5

SGMS2-209, Transcript of sphingomyelin synthase 2, human

TSL 3

Gene SGMS2, Length 498 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGMS2-209	ENST00000515332	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		62.09	■■■■■ 7.53
SGMS2-209	ENST00000515332	ABCC9	O60706	1549 aa		56.88	■■■■■ 6.7
SGMS2-209	ENST00000515332	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		56	■■■■■ 6.55
SGMS2-209	ENST00000515332	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		54.09	■■■■■ 6.25
SGMS2-209	ENST00000515332	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		53.71	■■■■■ 6.19
SGMS2-209	ENST00000515332	NACAD	O15069	1562 aa		53.15	■■■■■ 6.1
SGMS2-209	ENST00000515332	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	52.86	■■■■■ 6.05
SGMS2-209	ENST00000515332	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		52.84	■■■■■ 6.05
SGMS2-209	ENST00000515332	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		52.52	■■■■■ 6
SGMS2-209	ENST00000515332	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		52.22	■■■■■ 5.95
SGMS2-209	ENST00000515332	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		52.11	■■■■■ 5.93
SGMS2-209	ENST00000515332	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		51.35	■■■■■ 5.81
SGMS2-209	ENST00000515332	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		51.3	■■■■■ 5.8
SGMS2-209	ENST00000515332	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		51.29	■■■■■ 5.8
SGMS2-209	ENST00000515332	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	51.28	■■■■■ 5.8
SGMS2-209	ENST00000515332	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		51.18	■■■■■ 5.78
SGMS2-209	ENST00000515332	SCRIB	Q14160	1630 aa		51.07	■■■■■ 5.77
SGMS2-209	ENST00000515332	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	50.99	■■■■■ 5.75
SGMS2-209	ENST00000515332	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		50.19	■■■■■ 5.63
SGMS2-209	ENST00000515332	CUX2	O14529	1486 aa		49.27	■■■■■ 5.48
SGMS2-209	ENST00000515332	ERCC6	Q03468	1493 aa		49.14	■■■■■ 5.46
SGMS2-209	ENST00000515332	NCAPD3	P42695	1498 aa		49.09	■■■■■ 5.45
SGMS2-209	ENST00000515332	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		48.86	■■■■■ 5.41
SGMS2-209	ENST00000515332	NES	P48681	1621 aa		48.65	■■■■■ 5.38
SGMS2-209	ENST00000515332	SMARCA2	P51531	1590 aa		48.64	■■■■■ 5.38
SGMS2-209	ENST00000515332	HMGXB3	Q12766	1538 aa		48.63	■■■■■ 5.38
SGMS2-209	ENST00000515332	SMARCA4	P51532	1647 aa		48.59	■■■■■ 5.37
SGMS2-209	ENST00000515332	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	48.34	■■■■■ 5.33
SGMS2-209	ENST00000515332	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	48.26	■■■■■ 5.32
SGMS2-209	ENST00000515332	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	48.22	■■■■■ 5.31
SGMS2-209	ENST00000515332	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		48.09	■■■■■ 5.29
SGMS2-209	ENST00000515332	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		48.09	■■■■■ 5.29
SGMS2-209	ENST00000515332	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		47.95	■■■■■ 5.27
SGMS2-209	ENST00000515332	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		47.87	■■■■■ 5.25
SGMS2-209	ENST00000515332	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		47.86	■■■■■ 5.25
SGMS2-209	ENST00000515332	TRIM41	Q8WV44	630 aa		47.73	■■■■■ 5.23
SGMS2-209	ENST00000515332	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		47.58	■■■■■ 5.21
SGMS2-209	ENST00000515332	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		47.52	■■■■■ 5.2
SGMS2-209	ENST00000515332	WDR62	O43379	1518 aa		47.4	■■■■■ 5.18
SGMS2-209	ENST00000515332	WIZ	O95785	1651 aa		47.25	■■■■■ 5.15
SGMS2-209	ENST00000515332	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		47.17	■■■■■ 5.14
SGMS2-209	ENST00000515332	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		47.06	■■■■■ 5.12
SGMS2-209	ENST00000515332	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		46.93	■■■■■ 5.1
SGMS2-209	ENST00000515332	CFTR	P13569	1480 aa		46.87	■■■■■ 5.09
SGMS2-209	ENST00000515332	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	46.74	■■■■■ 5.07
SGMS2-209	ENST00000515332	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	46.57	■■■■■ 5.05
SGMS2-209	ENST00000515332	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	46.56	■■■■■ 5.04
SGMS2-209	ENST00000515332	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		46.42	■■■■■ 5.02
SGMS2-209	ENST00000515332	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		46.42	■■■■■ 5.02
SGMS2-209	ENST00000515332	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		46.42	■■■■■ 5.02
SGMS2-209	ENST00000515332	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	46.31	■■■■■ 5
SGMS2-209	ENST00000515332	PRDM2	Q13029	1718 aa		46.28	■■■■■ 5
SGMS2-209	ENST00000515332	IFT140	Q96RY7	1462 aa		46.25	■■■■■ 4.99
SGMS2-209	ENST00000515332	ARHGEF11	O15085	1522 aa		46.18	■■■■■ 4.98
SGMS2-209	ENST00000515332	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		46.08	■■■■■ 4.97
SGMS2-209	ENST00000515332	TOPBP1	Q92547	1522 aa		46.08	■■■■■ 4.97
SGMS2-209	ENST00000515332	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	45.97	■■■■■ 4.95
SGMS2-209	ENST00000515332	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		45.93	■■■■■ 4.94
SGMS2-209	ENST00000515332	ABCC8	Q09428	1581 aa		45.87	■■■■■ 4.93
SGMS2-209	ENST00000515332	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		45.82	■■■■■ 4.93
SGMS2-209	ENST00000515332	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	45.79	■■■■■ 4.92
SGMS2-209	ENST00000515332	CHD1	O14646	1710 aa		45.77	■■■■■ 4.92
SGMS2-209	ENST00000515332	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	45.71	■■■■■ 4.91
SGMS2-209	ENST00000515332	ARAP1	Q96P48	1450 aa		45.69	■■■■■ 4.91
SGMS2-209	ENST00000515332	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	45.69	■■■■■ 4.9
SGMS2-209	ENST00000515332	FBLN2	P98095	1184 aa		45.67	■■■■■ 4.9
SGMS2-209	ENST00000515332	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	45.55	■■■■■ 4.88
SGMS2-209	ENST00000515332	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		45.44	■■■■■ 4.87
SGMS2-209	ENST00000515332	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	45.39	■■■■■ 4.86
SGMS2-209	ENST00000515332	SOGA1	O94964	1423 aa		45.35	■■■■■ 4.85
SGMS2-209	ENST00000515332	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		45.29	■■■■■ 4.84
SGMS2-209	ENST00000515332	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		45.23	■■■■■ 4.83
SGMS2-209	ENST00000515332	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	45.17	■■■■■ 4.82
SGMS2-209	ENST00000515332	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		45.17	■■■■■ 4.82
SGMS2-209	ENST00000515332	WDR97	A6NE52	1622 aa		45.12	■■■■■ 4.81
SGMS2-209	ENST00000515332	SYNJ1	O43426	1573 aa		45.11	■■■■■ 4.81
SGMS2-209	ENST00000515332	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	45.09	■■■■■ 4.81
SGMS2-209	ENST00000515332	GRIN2B	Q13224	1484 aa		45.02	■■■■■ 4.8
SGMS2-209	ENST00000515332	CUX1	P39880	1505 aa		45.01	■■■■■ 4.8
SGMS2-209	ENST00000515332	SYNJ2	O15056	1496 aa		44.97	■■■■■ 4.79
SGMS2-209	ENST00000515332	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	44.92	■■■■■ 4.78
SGMS2-209	ENST00000515332	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		44.82	■■■■■ 4.77
SGMS2-209	ENST00000515332	PBRM1	Q86U86	1689 aa		44.78	■■■■■ 4.76
SGMS2-209	ENST00000515332	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		44.59	■■■■■ 4.73
SGMS2-209	ENST00000515332	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		44.58	■■■■■ 4.73
SGMS2-209	ENST00000515332	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		44.52	■■■■■ 4.72
SGMS2-209	ENST00000515332	GRIN2A	Q12879	1464 aa		44.45	■■■■■ 4.71
SGMS2-209	ENST00000515332	CEP170	Q5SW79	1584 aa		44.35	■■■■■ 4.69
SGMS2-209	ENST00000515332	ADAMTS12	P58397	1594 aa		44.32	■■■■■ 4.69
SGMS2-209	ENST00000515332	NUP160	Q12769	1436 aa		44.32	■■■■■ 4.68
SGMS2-209	ENST00000515332	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	44.25	■■■■■ 4.67
SGMS2-209	ENST00000515332	SHROOM2	Q13796	1616 aa		44.2	■■■■■ 4.67
SGMS2-209	ENST00000515332	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		44.16	■■■■■ 4.66
SGMS2-209	ENST00000515332	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		44.06	■■■■■ 4.64
SGMS2-209	ENST00000515332	TOP2B	Q02880	1626 aa		44.04	■■■■■ 4.64
SGMS2-209	ENST00000515332	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		44.04	■■■■■ 4.64
SGMS2-209	ENST00000515332	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	44	■■■■■ 4.63
SGMS2-209	ENST00000515332	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		43.99	■■■■■ 4.63
SGMS2-209	ENST00000515332	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	43.99	■■■■■ 4.63
SGMS2-209	ENST00000515332	JPH4	Q96JJ6	628 aa		43.89	■■■■■ 4.62

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