RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515319.6_PAR_Y

ZBED1-205, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 905 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.84■■■■□ 3.97
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y ABCC9O60706 1549 aa36.95■■■■□ 3.51
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.16■■■■□ 3.38
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.35■■■■□ 3.25
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.82■■■■□ 3.16
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y NACADO15069 1562 aa34.36■■■■□ 3.09
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.26■■■■□ 3.08
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.07■■■■□ 3.05
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.06■■■■□ 3.04
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y BICRAQ9NZM4 1560 aa33.8■■■■□ 3
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y MYO15BQ96JP2 1530 aa33.56■■■□□ 2.96
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y CECR2Q9BXF3 1484 aa33.37■■■□□ 2.93
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.35■■■□□ 2.93
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.25■■■□□ 2.91
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.08■■■□□ 2.89
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y SCRIBQ14160 1630 aa32.91■■■□□ 2.86
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.83■■■□□ 2.85
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y CUX2O14529 1486 aa32.17■■■□□ 2.74
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y ERCC6Q03468 1493 aa31.99■■■□□ 2.71
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y NCAPD3P42695 1498 aa31.69■■■□□ 2.66
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y NESP48681 1621 aa31.5■■■□□ 2.63
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.5■■■□□ 2.63
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y HMGXB3Q12766 1538 aa31.4■■■□□ 2.62
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y SMARCA2P51531 1590 aa31.39■■■□□ 2.61
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y TRIM41Q8WV44 630 aa31.36■■■□□ 2.61
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y SMARCA4P51532 1647 aa31.28■■■□□ 2.6
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.15■■■□□ 2.58
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.12■■■□□ 2.57
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.99■■■□□ 2.55
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y PEG3Q9GZU2 1588 aa30.95■■■□□ 2.54
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y MRC2Q9UBG0 1479 aa30.78■■■□□ 2.52
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y WDR62O43379 1518 aa30.73■■■□□ 2.51
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y CADPSQ9ULU8 1353 aa30.7■■■□□ 2.51
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y MROH2BQ7Z745 1585 aa30.69■■■□□ 2.5
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y OSCARQ8IYS5 282 aa30.57■■■□□ 2.48
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y CEP164Q9UPV0 1460 aa30.5■■■□□ 2.47
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.38■■■□□ 2.45
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y WIZO95785 1651 aa30.33■■■□□ 2.45
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.29■■■□□ 2.44
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.29■■■□□ 2.44
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.29■■■□□ 2.44
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y CFTRP13569 1480 aa30.18■■■□□ 2.42
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y ARHGEF11O15085 1522 aa30.09■■■□□ 2.41
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.93■■■□□ 2.38
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y IFT140Q96RY7 1462 aa29.91■■■□□ 2.38
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y PRDM2Q13029 1718 aa29.91■■■□□ 2.38
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y CHD1O14646 1710 aa29.74■■■□□ 2.35
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y ARAP1Q96P48 1450 aa29.73■■■□□ 2.35
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y TOPBP1Q92547 1522 aa29.71■■■□□ 2.35
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y FBLN2P98095 1184 aa29.59■■■□□ 2.33
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y ABCC8Q09428 1581 aa29.59■■■□□ 2.33
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.57■■■□□ 2.32
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.54■■■□□ 2.32
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y CCDC88BA6NC98 1476 aa29.52■■■□□ 2.32
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y CLASP1Q7Z460 1538 aa29.31■■■□□ 2.28
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.27■■■□□ 2.28
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y SYNJ1O43426 1573 aa29.26■■■□□ 2.27
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.25■■■□□ 2.27
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y SOGA1O94964 1423 aa29.2■■■□□ 2.27
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y WDR97A6NE52 1622 aa29.16■■■□□ 2.26
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y GAPVD1Q14C86 1478 aa29.08■■■□□ 2.25
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.06■■■□□ 2.24
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y SYNJ2O15056 1496 aa29.05■■■□□ 2.24
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y GRIN2BQ13224 1484 aa29.04■■■□□ 2.24
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y PBRM1Q86U86 1689 aa28.94■■■□□ 2.22
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y CUX1P39880 1505 aa28.89■■■□□ 2.22
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.8■■■□□ 2.2
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.72■■■□□ 2.19
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.72■■■□□ 2.19
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y CEP170Q5SW79 1584 aa28.69■■■□□ 2.18
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y GRIN2AQ12879 1464 aa28.67■■■□□ 2.18
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.66■■■□□ 2.18
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y NUP160Q12769 1436 aa28.59■■■□□ 2.17
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y SHROOM2Q13796 1616 aa28.58■■■□□ 2.17
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y ADAMTS12P58397 1594 aa28.57■■■□□ 2.16
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y FAM69CQ0P6D2 419 aa28.44■■■□□ 2.14
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.43■■■□□ 2.14
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.4■■■□□ 2.14
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.4■■■□□ 2.14
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.37■■■□□ 2.13
ZBED1-205ENST00000515319_PAR_Y NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
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