RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.73■■■■■ 4.91
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ITGA3-215ENST00000515147 SCRIBQ14160 1630 aa37.53■■■■□ 3.6
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ITGA3-215ENST00000515147 SMARCA2P51531 1590 aa35.72■■■■□ 3.31
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ITGA3-215ENST00000515147 WDR62O43379 1518 aa34.76■■■■□ 3.15
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ITGA3-215ENST00000515147 CFTRP13569 1480 aa34.44■■■■□ 3.1
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ITGA3-215ENST00000515147 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.9■■■■□ 3.02
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ITGA3-215ENST00000515147 WDR97A6NE52 1622 aa33.18■■■□□ 2.9
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ITGA3-215ENST00000515147 SHROOM2Q13796 1616 aa32.5■■■□□ 2.79
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ITGA3-215ENST00000515147 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.37■■■□□ 2.77
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ITGA3-215ENST00000515147 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.16■■■□□ 2.74
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