RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514932.5

GRAMD2B-216, Transcript of GRAM domain containing 2B, humanhuman

TSL 4

Gene GRAMD2B, Length 632 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2B-216ENST00000514932 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.27■■■■■ 6.76
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GRAMD2B-216ENST00000514932 ABCC9O60706 1549 aa50.44■■■■■ 5.67
GRAMD2B-216ENST00000514932 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.32■■■■■ 5.33
GRAMD2B-216ENST00000514932 NACADO15069 1562 aa48.17■■■■■ 5.3
GRAMD2B-216ENST00000514932 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.15■■■■■ 5.3
GRAMD2B-216ENST00000514932 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.74■■■■■ 5.23
GRAMD2B-216ENST00000514932 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.57■■■■■ 5.21
GRAMD2B-216ENST00000514932 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.36■■■■■ 5.17
GRAMD2B-216ENST00000514932 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.17■■■■■ 5.14
GRAMD2B-216ENST00000514932 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.11■■■■■ 5.13
GRAMD2B-216ENST00000514932 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.85■■■■■ 5.09
GRAMD2B-216ENST00000514932 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.76■■■■■ 5.08
GRAMD2B-216ENST00000514932 SCRIBQ14160 1630 aa46.55■■■■■ 5.04
GRAMD2B-216ENST00000514932 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.32■■■■■ 5.01
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GRAMD2B-216ENST00000514932 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.59■■■■■ 4.89
GRAMD2B-216ENST00000514932 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.38■■■■■ 4.86
GRAMD2B-216ENST00000514932 SMARCA4P51532 1647 aa44.5■■■■■ 4.71
GRAMD2B-216ENST00000514932 NCAPD3P42695 1498 aa44.48■■■■■ 4.71
GRAMD2B-216ENST00000514932 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.41■■■■■ 4.7
GRAMD2B-216ENST00000514932 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
GRAMD2B-216ENST00000514932 SMARCA2P51531 1590 aa44.33■■■■■ 4.69
GRAMD2B-216ENST00000514932 HMGXB3Q12766 1538 aa44.16■■■■■ 4.66
GRAMD2B-216ENST00000514932 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.11■■■■■ 4.65
GRAMD2B-216ENST00000514932 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.09■■■■■ 4.65
GRAMD2B-216ENST00000514932 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
GRAMD2B-216ENST00000514932 WIZO95785 1651 aa43.61■■■■■ 4.57
GRAMD2B-216ENST00000514932 ERCC6Q03468 1493 aa43.51■■■■■ 4.56
GRAMD2B-216ENST00000514932 NESP48681 1621 aa43.51■■■■■ 4.56
GRAMD2B-216ENST00000514932 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
GRAMD2B-216ENST00000514932 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.34■■■■■ 4.53
GRAMD2B-216ENST00000514932 CUX2O14529 1486 aa43.21■■■■■ 4.51
GRAMD2B-216ENST00000514932 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.17■■■■■ 4.5
GRAMD2B-216ENST00000514932 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.12■■■■■ 4.49
GRAMD2B-216ENST00000514932 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
GRAMD2B-216ENST00000514932 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.94■■■■■ 4.46
GRAMD2B-216ENST00000514932 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
GRAMD2B-216ENST00000514932 CFTRP13569 1480 aa42.8■■■■■ 4.44
GRAMD2B-216ENST00000514932 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.66■■■■■ 4.42
GRAMD2B-216ENST00000514932 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.64■■■■■ 4.42
GRAMD2B-216ENST00000514932 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.64■■■■■ 4.42
GRAMD2B-216ENST00000514932 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.62■■■■■ 4.41
GRAMD2B-216ENST00000514932 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.5■■■■■ 4.39
GRAMD2B-216ENST00000514932 WDR62O43379 1518 aa42.5■■■■■ 4.39
GRAMD2B-216ENST00000514932 PRDM2Q13029 1718 aa42.36■■■■■ 4.37
GRAMD2B-216ENST00000514932 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
GRAMD2B-216ENST00000514932 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
GRAMD2B-216ENST00000514932 ABCC8Q09428 1581 aa41.92■■■■■ 4.3
GRAMD2B-216ENST00000514932 TOPBP1Q92547 1522 aa41.9■■■■■ 4.3
GRAMD2B-216ENST00000514932 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.8■■■■■ 4.28
GRAMD2B-216ENST00000514932 IFT140Q96RY7 1462 aa41.75■■■■■ 4.27
GRAMD2B-216ENST00000514932 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
GRAMD2B-216ENST00000514932 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
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GRAMD2B-216ENST00000514932 CUX1P39880 1505 aa41.4■■■■■ 4.22
GRAMD2B-216ENST00000514932 SOGA1O94964 1423 aa41.39■■■■■ 4.22
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GRAMD2B-216ENST00000514932 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.34■■■■■ 4.21
GRAMD2B-216ENST00000514932 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.34■■■■■ 4.21
GRAMD2B-216ENST00000514932 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.21
GRAMD2B-216ENST00000514932 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
GRAMD2B-216ENST00000514932 WDR97A6NE52 1622 aa41.11■■■■■ 4.17
GRAMD2B-216ENST00000514932 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.01■■■■■ 4.15
GRAMD2B-216ENST00000514932 FBLN2P98095 1184 aa40.99■■■■■ 4.15
GRAMD2B-216ENST00000514932 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.93■■■■■ 4.14
GRAMD2B-216ENST00000514932 TOP2BQ02880 1626 aa40.93■■■■■ 4.14
GRAMD2B-216ENST00000514932 CHD1O14646 1710 aa40.93■■■■■ 4.14
GRAMD2B-216ENST00000514932 GRIN2BQ13224 1484 aa40.92■■■■■ 4.14
GRAMD2B-216ENST00000514932 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.91■■■■■ 4.14
GRAMD2B-216ENST00000514932 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.9■■■■■ 4.14
GRAMD2B-216ENST00000514932 TRIM41Q8WV44 630 aa40.88■■■■■ 4.13
GRAMD2B-216ENST00000514932 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.88■■■■■ 4.13
GRAMD2B-216ENST00000514932 SYNJ1O43426 1573 aa40.87■■■■■ 4.13
GRAMD2B-216ENST00000514932 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
GRAMD2B-216ENST00000514932 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
GRAMD2B-216ENST00000514932 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.76■■■■■ 4.12
GRAMD2B-216ENST00000514932 PBRM1Q86U86 1689 aa40.74■■■■■ 4.11
GRAMD2B-216ENST00000514932 SYNJ2O15056 1496 aa40.7■■■■■ 4.11
GRAMD2B-216ENST00000514932 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.7■■■■■ 4.11
GRAMD2B-216ENST00000514932 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.7■■■■■ 4.11
GRAMD2B-216ENST00000514932 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.7■■■■■ 4.11
GRAMD2B-216ENST00000514932 ARHGEF11O15085 1522 aa40.66■■■■■ 4.1
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GRAMD2B-216ENST00000514932 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.42■■■■■ 4.06
GRAMD2B-216ENST00000514932 ADAMTS12P58397 1594 aa40.4■■■■■ 4.06
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GRAMD2B-216ENST00000514932 CEP170Q5SW79 1584 aa40.17■■■■■ 4.02
GRAMD2B-216ENST00000514932 IGF1RP08069 1367 aa40.12■■■■■ 4.01
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GRAMD2B-216ENST00000514932 SHROOM2Q13796 1616 aa39.94■■■■□ 3.98
GRAMD2B-216ENST00000514932 JPH4Q96JJ6 628 aa39.91■■■■□ 3.98
GRAMD2B-216ENST00000514932 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.9■■■■□ 3.98
GRAMD2B-216ENST00000514932 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.87■■■■□ 3.97
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