RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514898.1

RUFY3-213, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene RUFY3, Length 482 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-213ENST00000514898 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.03■■■■■ 7.04
RUFY3-213ENST00000514898 ABCC9O60706 1549 aa53.46■■■■■ 6.15
RUFY3-213ENST00000514898 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.1■■■■■ 6.09
RUFY3-213ENST00000514898 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.69■■■■■ 5.71
RUFY3-213ENST00000514898 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.62■■■■■ 5.69
RUFY3-213ENST00000514898 NACADO15069 1562 aa50.3■■■■■ 5.64
RUFY3-213ENST00000514898 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.81■■■■■ 5.56
RUFY3-213ENST00000514898 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.72■■■■■ 5.55
RUFY3-213ENST00000514898 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.64■■■■■ 5.54
RUFY3-213ENST00000514898 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.54■■■■■ 5.52
RUFY3-213ENST00000514898 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.37■■■■■ 5.49
RUFY3-213ENST00000514898 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.85■■■■■ 5.41
RUFY3-213ENST00000514898 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.76■■■■■ 5.4
RUFY3-213ENST00000514898 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.59■■■■■ 5.37
RUFY3-213ENST00000514898 SCRIBQ14160 1630 aa48.33■■■■■ 5.33
RUFY3-213ENST00000514898 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.29■■■■■ 5.32
RUFY3-213ENST00000514898 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.2■■■■■ 5.31
RUFY3-213ENST00000514898 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
RUFY3-213ENST00000514898 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.7■■■■■ 5.07
RUFY3-213ENST00000514898 NCAPD3P42695 1498 aa46.49■■■■■ 5.03
RUFY3-213ENST00000514898 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.27■■■■■ 5
RUFY3-213ENST00000514898 CUX2O14529 1486 aa46.24■■■■■ 4.99
RUFY3-213ENST00000514898 SMARCA4P51532 1647 aa46.11■■■■■ 4.97
RUFY3-213ENST00000514898 ERCC6Q03468 1493 aa46.11■■■■■ 4.97
RUFY3-213ENST00000514898 HMGXB3Q12766 1538 aa46.08■■■■■ 4.97
RUFY3-213ENST00000514898 SMARCA2P51531 1590 aa46.07■■■■■ 4.97
RUFY3-213ENST00000514898 NESP48681 1621 aa45.87■■■■■ 4.93
RUFY3-213ENST00000514898 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.79■■■■■ 4.92
RUFY3-213ENST00000514898 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
RUFY3-213ENST00000514898 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.72■■■■■ 4.91
RUFY3-213ENST00000514898 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.5■■■■■ 4.87
RUFY3-213ENST00000514898 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.48■■■■■ 4.87
RUFY3-213ENST00000514898 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.44■■■■■ 4.86
RUFY3-213ENST00000514898 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.23■■■■■ 4.83
RUFY3-213ENST00000514898 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.16■■■■■ 4.82
RUFY3-213ENST00000514898 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.02■■■■■ 4.8
RUFY3-213ENST00000514898 WIZO95785 1651 aa44.9■■■■■ 4.78
RUFY3-213ENST00000514898 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.83■■■■■ 4.77
RUFY3-213ENST00000514898 WDR62O43379 1518 aa44.77■■■■■ 4.76
RUFY3-213ENST00000514898 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.53■■■■■ 4.72
RUFY3-213ENST00000514898 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.48■■■■■ 4.71
RUFY3-213ENST00000514898 CFTRP13569 1480 aa44.46■■■■■ 4.71
RUFY3-213ENST00000514898 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
RUFY3-213ENST00000514898 TRIM41Q8WV44 630 aa44.35■■■■■ 4.69
RUFY3-213ENST00000514898 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
RUFY3-213ENST00000514898 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
RUFY3-213ENST00000514898 OSCARQ8IYS5 282 aa44.03■■■■■ 4.64
RUFY3-213ENST00000514898 PRDM2Q13029 1718 aa43.92■■■■■ 4.62
RUFY3-213ENST00000514898 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.82■■■■■ 4.6
RUFY3-213ENST00000514898 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
RUFY3-213ENST00000514898 IFT140Q96RY7 1462 aa43.69■■■■■ 4.58
RUFY3-213ENST00000514898 TOPBP1Q92547 1522 aa43.63■■■■■ 4.57
RUFY3-213ENST00000514898 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.55■■■■■ 4.56
RUFY3-213ENST00000514898 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.55■■■■■ 4.56
RUFY3-213ENST00000514898 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.55■■■■■ 4.56
RUFY3-213ENST00000514898 ABCC8Q09428 1581 aa43.45■■■■■ 4.55
RUFY3-213ENST00000514898 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
RUFY3-213ENST00000514898 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.41■■■■■ 4.54
RUFY3-213ENST00000514898 ARHGEF11O15085 1522 aa43.38■■■■■ 4.53
RUFY3-213ENST00000514898 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
RUFY3-213ENST00000514898 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.24■■■■■ 4.51
RUFY3-213ENST00000514898 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
RUFY3-213ENST00000514898 CHD1O14646 1710 aa43.15■■■■■ 4.5
RUFY3-213ENST00000514898 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.02■■■■■ 4.48
RUFY3-213ENST00000514898 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.01■■■■■ 4.48
RUFY3-213ENST00000514898 ARAP1Q96P48 1450 aa42.95■■■■■ 4.47
RUFY3-213ENST00000514898 SOGA1O94964 1423 aa42.91■■■■■ 4.46
RUFY3-213ENST00000514898 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
RUFY3-213ENST00000514898 FBLN2P98095 1184 aa42.9■■■■■ 4.46
RUFY3-213ENST00000514898 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.81■■■■■ 4.44
RUFY3-213ENST00000514898 WDR97A6NE52 1622 aa42.78■■■■■ 4.44
RUFY3-213ENST00000514898 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.76■■■■■ 4.44
RUFY3-213ENST00000514898 CUX1P39880 1505 aa42.76■■■■■ 4.44
RUFY3-213ENST00000514898 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.71■■■■■ 4.43
RUFY3-213ENST00000514898 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
RUFY3-213ENST00000514898 GRIN2BQ13224 1484 aa42.59■■■■■ 4.41
RUFY3-213ENST00000514898 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
RUFY3-213ENST00000514898 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
RUFY3-213ENST00000514898 SYNJ1O43426 1573 aa42.55■■■■■ 4.4
RUFY3-213ENST00000514898 SYNJ2O15056 1496 aa42.51■■■■■ 4.4
RUFY3-213ENST00000514898 PBRM1Q86U86 1689 aa42.39■■■■■ 4.38
RUFY3-213ENST00000514898 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.39■■■■■ 4.38
RUFY3-213ENST00000514898 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.33■■■■■ 4.37
RUFY3-213ENST00000514898 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.31■■■■■ 4.36
RUFY3-213ENST00000514898 GRIN2AQ12879 1464 aa42.06■■■■■ 4.32
RUFY3-213ENST00000514898 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.03■■■■■ 4.32
RUFY3-213ENST00000514898 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.03■■■■■ 4.32
RUFY3-213ENST00000514898 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
RUFY3-213ENST00000514898 ADAMTS12P58397 1594 aa42■■■■■ 4.31
RUFY3-213ENST00000514898 NUP160Q12769 1436 aa41.98■■■■■ 4.31
RUFY3-213ENST00000514898 CEP170Q5SW79 1584 aa41.96■■■■■ 4.31
RUFY3-213ENST00000514898 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.95■■■■■ 4.31
RUFY3-213ENST00000514898 TOP2BQ02880 1626 aa41.95■■■■■ 4.31
RUFY3-213ENST00000514898 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.85■■■■■ 4.29
RUFY3-213ENST00000514898 SHROOM2Q13796 1616 aa41.84■■■■■ 4.29
RUFY3-213ENST00000514898 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.77■■■■■ 4.28
RUFY3-213ENST00000514898 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
RUFY3-213ENST00000514898 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
RUFY3-213ENST00000514898 JPH4Q96JJ6 628 aa41.49■■■■■ 4.23
RUFY3-213ENST00000514898 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.47■■■■■ 4.23
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