RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514880.5

PXYLP1-214, Transcript of 2-phosphoxylose phosphatase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PXYLP1, Length 629 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXYLP1-214ENST00000514880 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.1■■■■■ 7.21
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PXYLP1-214ENST00000514880 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.67■■■■■ 5.7
PXYLP1-214ENST00000514880 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.61■■■■■ 5.69
PXYLP1-214ENST00000514880 NACADO15069 1562 aa50.45■■■■■ 5.67
PXYLP1-214ENST00000514880 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.95■■■■■ 5.59
PXYLP1-214ENST00000514880 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.88■■■■■ 5.58
PXYLP1-214ENST00000514880 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.68■■■■■ 5.54
PXYLP1-214ENST00000514880 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.55■■■■■ 5.52
PXYLP1-214ENST00000514880 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.54■■■■■ 5.52
PXYLP1-214ENST00000514880 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.24■■■■■ 5.47
PXYLP1-214ENST00000514880 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.13■■■■■ 5.46
PXYLP1-214ENST00000514880 SCRIBQ14160 1630 aa49.05■■■■■ 5.44
PXYLP1-214ENST00000514880 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.41■■■■■ 5.34
PXYLP1-214ENST00000514880 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.95■■■■■ 5.27
PXYLP1-214ENST00000514880 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.91■■■■■ 5.26
PXYLP1-214ENST00000514880 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.63■■■■■ 5.22
PXYLP1-214ENST00000514880 SMARCA4P51532 1647 aa46.77■■■■■ 5.08
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PXYLP1-214ENST00000514880 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.57■■■■■ 5.05
PXYLP1-214ENST00000514880 NCAPD3P42695 1498 aa46.56■■■■■ 5.04
PXYLP1-214ENST00000514880 SMARCA2P51531 1590 aa46.47■■■■■ 5.03
PXYLP1-214ENST00000514880 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.4■■■■■ 5.02
PXYLP1-214ENST00000514880 HMGXB3Q12766 1538 aa46.3■■■■■ 5
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PXYLP1-214ENST00000514880 WIZO95785 1651 aa45.92■■■■■ 4.94
PXYLP1-214ENST00000514880 NESP48681 1621 aa45.8■■■■■ 4.92
PXYLP1-214ENST00000514880 ERCC6Q03468 1493 aa45.7■■■■■ 4.91
PXYLP1-214ENST00000514880 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.65■■■■■ 4.9
PXYLP1-214ENST00000514880 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.43■■■■■ 4.86
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PXYLP1-214ENST00000514880 CUX2O14529 1486 aa45.24■■■■■ 4.83
PXYLP1-214ENST00000514880 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.24■■■■■ 4.83
PXYLP1-214ENST00000514880 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.21■■■■■ 4.83
PXYLP1-214ENST00000514880 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.12■■■■■ 4.81
PXYLP1-214ENST00000514880 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
PXYLP1-214ENST00000514880 CFTRP13569 1480 aa44.85■■■■■ 4.77
PXYLP1-214ENST00000514880 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.8■■■■■ 4.76
PXYLP1-214ENST00000514880 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.76■■■■■ 4.76
PXYLP1-214ENST00000514880 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.76■■■■■ 4.76
PXYLP1-214ENST00000514880 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.73■■■■■ 4.75
PXYLP1-214ENST00000514880 WDR62O43379 1518 aa44.6■■■■■ 4.73
PXYLP1-214ENST00000514880 PRDM2Q13029 1718 aa44.54■■■■■ 4.72
PXYLP1-214ENST00000514880 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.45■■■■■ 4.71
PXYLP1-214ENST00000514880 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
PXYLP1-214ENST00000514880 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.33■■■■■ 4.69
PXYLP1-214ENST00000514880 TOPBP1Q92547 1522 aa44■■■■■ 4.63
PXYLP1-214ENST00000514880 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.88■■■■■ 4.62
PXYLP1-214ENST00000514880 ABCC8Q09428 1581 aa43.81■■■■■ 4.6
PXYLP1-214ENST00000514880 IFT140Q96RY7 1462 aa43.76■■■■■ 4.6
PXYLP1-214ENST00000514880 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.75■■■■■ 4.59
PXYLP1-214ENST00000514880 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.6■■■■■ 4.57
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PXYLP1-214ENST00000514880 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.51■■■■■ 4.56
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PXYLP1-214ENST00000514880 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
PXYLP1-214ENST00000514880 CHD1O14646 1710 aa43.13■■■■■ 4.49
PXYLP1-214ENST00000514880 WDR97A6NE52 1622 aa43.11■■■■■ 4.49
PXYLP1-214ENST00000514880 FBLN2P98095 1184 aa43.06■■■■■ 4.48
PXYLP1-214ENST00000514880 SYNJ1O43426 1573 aa43.05■■■■■ 4.48
PXYLP1-214ENST00000514880 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.05■■■■■ 4.48
PXYLP1-214ENST00000514880 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43■■■■■ 4.47
PXYLP1-214ENST00000514880 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43■■■■■ 4.47
PXYLP1-214ENST00000514880 TRIM41Q8WV44 630 aa42.99■■■■■ 4.47
PXYLP1-214ENST00000514880 TOP2BQ02880 1626 aa42.99■■■■■ 4.47
PXYLP1-214ENST00000514880 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.92■■■■■ 4.46
PXYLP1-214ENST00000514880 GRIN2BQ13224 1484 aa42.91■■■■■ 4.46
PXYLP1-214ENST00000514880 PBRM1Q86U86 1689 aa42.9■■■■■ 4.46
PXYLP1-214ENST00000514880 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.88■■■■■ 4.46
PXYLP1-214ENST00000514880 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.85■■■■■ 4.45
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PXYLP1-214ENST00000514880 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.81■■■■■ 4.44
PXYLP1-214ENST00000514880 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.81■■■■■ 4.44
PXYLP1-214ENST00000514880 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
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PXYLP1-214ENST00000514880 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.53■■■■■ 4.4
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PXYLP1-214ENST00000514880 GRIN2AQ12879 1464 aa42.39■■■■■ 4.38
PXYLP1-214ENST00000514880 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.39■■■■■ 4.38
PXYLP1-214ENST00000514880 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.38■■■■■ 4.37
PXYLP1-214ENST00000514880 ARAP1Q96P48 1450 aa42.35■■■■■ 4.37
PXYLP1-214ENST00000514880 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.33■■■■■ 4.37
PXYLP1-214ENST00000514880 CEP170Q5SW79 1584 aa42.27■■■■■ 4.36
PXYLP1-214ENST00000514880 NUP160Q12769 1436 aa42.18■■■■■ 4.34
PXYLP1-214ENST00000514880 KIF27Q86VH2 1401 aa42.14■■■■■ 4.34
PXYLP1-214ENST00000514880 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.05■■■■■ 4.32
PXYLP1-214ENST00000514880 IGF1RP08069 1367 aa42.04■■■■■ 4.32
PXYLP1-214ENST00000514880 CUL7Q14999 1698 aa41.94■■■■■ 4.3
PXYLP1-214ENST00000514880 SHROOM2Q13796 1616 aa41.94■■■■■ 4.3
PXYLP1-214ENST00000514880 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.87■■■■■ 4.29
PXYLP1-214ENST00000514880 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.81■■■■■ 4.28
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