RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514831.1

SMAD1-214, Transcript of SMAD family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SMAD1, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-214ENST00000514831 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58■■■■■ 6.88
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SMAD1-214ENST00000514831 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.83■■■■■ 5.57
SMAD1-214ENST00000514831 NACADO15069 1562 aa49.43■■■■■ 5.5
SMAD1-214ENST00000514831 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.3■■■■■ 5.48
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SMAD1-214ENST00000514831 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.77■■■■■ 5.4
SMAD1-214ENST00000514831 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.69■■■■■ 5.39
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SMAD1-214ENST00000514831 SCRIBQ14160 1630 aa47.52■■■■■ 5.2
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SMAD1-214ENST00000514831 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.24■■■■■ 5.15
SMAD1-214ENST00000514831 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
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SMAD1-214ENST00000514831 SMARCA4P51532 1647 aa45.34■■■■■ 4.85
SMAD1-214ENST00000514831 SMARCA2P51531 1590 aa45.31■■■■■ 4.84
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SMAD1-214ENST00000514831 ERCC6Q03468 1493 aa45.26■■■■■ 4.84
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SMAD1-214ENST00000514831 NESP48681 1621 aa44.93■■■■■ 4.78
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SMAD1-214ENST00000514831 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.01■■■■■ 4.64
SMAD1-214ENST00000514831 WDR62O43379 1518 aa43.96■■■■■ 4.63
SMAD1-214ENST00000514831 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.77■■■■■ 4.6
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SMAD1-214ENST00000514831 CFTRP13569 1480 aa43.64■■■■■ 4.58
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SMAD1-214ENST00000514831 PRDM2Q13029 1718 aa43.32■■■■■ 4.53
SMAD1-214ENST00000514831 OSCARQ8IYS5 282 aa43.08■■■■■ 4.49
SMAD1-214ENST00000514831 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.02■■■■■ 4.48
SMAD1-214ENST00000514831 IFT140Q96RY7 1462 aa42.9■■■■■ 4.46
SMAD1-214ENST00000514831 TOPBP1Q92547 1522 aa42.83■■■■■ 4.45
SMAD1-214ENST00000514831 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.83■■■■■ 4.45
SMAD1-214ENST00000514831 ABCC8Q09428 1581 aa42.73■■■■■ 4.43
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SMAD1-214ENST00000514831 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.69■■■■■ 4.42
SMAD1-214ENST00000514831 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.69■■■■■ 4.42
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SMAD1-214ENST00000514831 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.17■■■■■ 4.34
SMAD1-214ENST00000514831 WDR97A6NE52 1622 aa42.13■■■■■ 4.34
SMAD1-214ENST00000514831 SOGA1O94964 1423 aa42.12■■■■■ 4.33
SMAD1-214ENST00000514831 ARAP1Q96P48 1450 aa42.08■■■■■ 4.33
SMAD1-214ENST00000514831 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.07■■■■■ 4.33
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SMAD1-214ENST00000514831 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
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SMAD1-214ENST00000514831 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.91■■■■■ 4.3
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SMAD1-214ENST00000514831 GRIN2BQ13224 1484 aa41.84■■■■■ 4.29
SMAD1-214ENST00000514831 SYNJ2O15056 1496 aa41.75■■■■■ 4.27
SMAD1-214ENST00000514831 PBRM1Q86U86 1689 aa41.74■■■■■ 4.27
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SMAD1-214ENST00000514831 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
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SMAD1-214ENST00000514831 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.32■■■■■ 4.21
SMAD1-214ENST00000514831 GRIN2AQ12879 1464 aa41.32■■■■■ 4.2
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SMAD1-214ENST00000514831 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.32■■■■■ 4.2
SMAD1-214ENST00000514831 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
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SMAD1-214ENST00000514831 CEP170Q5SW79 1584 aa41.2■■■■■ 4.19
SMAD1-214ENST00000514831 NUP160Q12769 1436 aa41.2■■■■■ 4.19
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SMAD1-214ENST00000514831 SHROOM2Q13796 1616 aa41.11■■■■■ 4.17
SMAD1-214ENST00000514831 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.1■■■■■ 4.17
SMAD1-214ENST00000514831 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.09■■■■■ 4.17
SMAD1-214ENST00000514831 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.11
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SMAD1-214ENST00000514831 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
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