RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514663.5

PACRGL-232, Transcript of parkin coregulated like, humanhuman

TSL 4

Gene PACRGL, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGL-232ENST00000514663 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.83■■■■■ 6.53
PACRGL-232ENST00000514663 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.02■■■■■ 5.6
PACRGL-232ENST00000514663 ABCC9O60706 1549 aa49.69■■■■■ 5.54
PACRGL-232ENST00000514663 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.41■■■■■ 5.18
PACRGL-232ENST00000514663 NACADO15069 1562 aa47.17■■■■■ 5.14
PACRGL-232ENST00000514663 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.83■■■■■ 5.09
PACRGL-232ENST00000514663 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.64■■■■■ 5.06
PACRGL-232ENST00000514663 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.5■■■■■ 5.03
PACRGL-232ENST00000514663 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.41■■■■■ 5.02
PACRGL-232ENST00000514663 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
PACRGL-232ENST00000514663 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.27■■■■■ 5
PACRGL-232ENST00000514663 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.14■■■■■ 4.98
PACRGL-232ENST00000514663 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.13■■■■■ 4.97
PACRGL-232ENST00000514663 SCRIBQ14160 1630 aa45.57■■■■■ 4.89
PACRGL-232ENST00000514663 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.44■■■■■ 4.87
PACRGL-232ENST00000514663 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.95■■■■■ 4.79
PACRGL-232ENST00000514663 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.91■■■■■ 4.78
PACRGL-232ENST00000514663 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.72■■■■■ 4.75
PACRGL-232ENST00000514663 NCAPD3P42695 1498 aa43.55■■■■■ 4.56
PACRGL-232ENST00000514663 SMARCA4P51532 1647 aa43.51■■■■■ 4.56
PACRGL-232ENST00000514663 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.46■■■■■ 4.55
PACRGL-232ENST00000514663 SMARCA2P51531 1590 aa43.33■■■■■ 4.53
PACRGL-232ENST00000514663 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
PACRGL-232ENST00000514663 HMGXB3Q12766 1538 aa43.27■■■■■ 4.52
PACRGL-232ENST00000514663 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.11■■■■■ 4.49
PACRGL-232ENST00000514663 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.04■■■■■ 4.48
PACRGL-232ENST00000514663 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
PACRGL-232ENST00000514663 ERCC6Q03468 1493 aa42.82■■■■■ 4.45
PACRGL-232ENST00000514663 NESP48681 1621 aa42.81■■■■■ 4.44
PACRGL-232ENST00000514663 CUX2O14529 1486 aa42.7■■■■■ 4.43
PACRGL-232ENST00000514663 WIZO95785 1651 aa42.56■■■■■ 4.4
PACRGL-232ENST00000514663 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.52■■■■■ 4.4
PACRGL-232ENST00000514663 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
PACRGL-232ENST00000514663 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.35■■■■■ 4.37
PACRGL-232ENST00000514663 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.31■■■■■ 4.36
PACRGL-232ENST00000514663 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
PACRGL-232ENST00000514663 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.21■■■■■ 4.35
PACRGL-232ENST00000514663 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.2■■■■■ 4.35
PACRGL-232ENST00000514663 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
PACRGL-232ENST00000514663 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.87■■■■■ 4.29
PACRGL-232ENST00000514663 CFTRP13569 1480 aa41.82■■■■■ 4.29
PACRGL-232ENST00000514663 WDR62O43379 1518 aa41.8■■■■■ 4.28
PACRGL-232ENST00000514663 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.75■■■■■ 4.27
PACRGL-232ENST00000514663 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.74■■■■■ 4.27
PACRGL-232ENST00000514663 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.52■■■■■ 4.24
PACRGL-232ENST00000514663 PRDM2Q13029 1718 aa41.51■■■■■ 4.24
PACRGL-232ENST00000514663 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
PACRGL-232ENST00000514663 TOPBP1Q92547 1522 aa41.01■■■■■ 4.16
PACRGL-232ENST00000514663 IFT140Q96RY7 1462 aa40.9■■■■■ 4.14
PACRGL-232ENST00000514663 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.88■■■■■ 4.13
PACRGL-232ENST00000514663 ABCC8Q09428 1581 aa40.87■■■■■ 4.13
PACRGL-232ENST00000514663 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
PACRGL-232ENST00000514663 OSCARQ8IYS5 282 aa40.72■■■■■ 4.11
PACRGL-232ENST00000514663 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
PACRGL-232ENST00000514663 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
PACRGL-232ENST00000514663 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
PACRGL-232ENST00000514663 TRIM41Q8WV44 630 aa40.55■■■■■ 4.08
PACRGL-232ENST00000514663 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.5■■■■■ 4.07
PACRGL-232ENST00000514663 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
PACRGL-232ENST00000514663 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.45■■■■■ 4.07
PACRGL-232ENST00000514663 CUX1P39880 1505 aa40.43■■■■■ 4.06
PACRGL-232ENST00000514663 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.39■■■■■ 4.06
PACRGL-232ENST00000514663 SOGA1O94964 1423 aa40.37■■■■■ 4.05
PACRGL-232ENST00000514663 CHD1O14646 1710 aa40.34■■■■■ 4.05
PACRGL-232ENST00000514663 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.3■■■■■ 4.04
PACRGL-232ENST00000514663 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.3■■■■■ 4.04
PACRGL-232ENST00000514663 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.3■■■■■ 4.04
PACRGL-232ENST00000514663 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
PACRGL-232ENST00000514663 WDR97A6NE52 1622 aa40.23■■■■■ 4.03
PACRGL-232ENST00000514663 ARHGEF11O15085 1522 aa40.17■■■■■ 4.02
PACRGL-232ENST00000514663 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.1■■■■■ 4.01
PACRGL-232ENST00000514663 FBLN2P98095 1184 aa40.06■■■■■ 4
PACRGL-232ENST00000514663 GRIN2BQ13224 1484 aa40■■■■□ 3.99
PACRGL-232ENST00000514663 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
PACRGL-232ENST00000514663 PBRM1Q86U86 1689 aa39.96■■■■□ 3.99
PACRGL-232ENST00000514663 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.95■■■■□ 3.99
PACRGL-232ENST00000514663 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.91■■■■□ 3.98
PACRGL-232ENST00000514663 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.9■■■■□ 3.98
PACRGL-232ENST00000514663 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.87■■■■□ 3.97
PACRGL-232ENST00000514663 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.87■■■■□ 3.97
PACRGL-232ENST00000514663 SYNJ2O15056 1496 aa39.85■■■■□ 3.97
PACRGL-232ENST00000514663 TOP2BQ02880 1626 aa39.84■■■■□ 3.97
PACRGL-232ENST00000514663 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
PACRGL-232ENST00000514663 SYNJ1O43426 1573 aa39.82■■■■□ 3.97
PACRGL-232ENST00000514663 ARAP1Q96P48 1450 aa39.81■■■■□ 3.96
PACRGL-232ENST00000514663 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.79■■■■□ 3.96
PACRGL-232ENST00000514663 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.77■■■■□ 3.96
PACRGL-232ENST00000514663 ADAMTS12P58397 1594 aa39.57■■■■□ 3.92
PACRGL-232ENST00000514663 GRIN2AQ12879 1464 aa39.51■■■■□ 3.92
PACRGL-232ENST00000514663 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.45■■■■□ 3.91
PACRGL-232ENST00000514663 CEP170Q5SW79 1584 aa39.41■■■■□ 3.9
PACRGL-232ENST00000514663 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.4■■■■□ 3.9
PACRGL-232ENST00000514663 NUP160Q12769 1436 aa39.4■■■■□ 3.9
PACRGL-232ENST00000514663 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.29■■■■□ 3.88
PACRGL-232ENST00000514663 SHROOM2Q13796 1616 aa39.23■■■■□ 3.87
PACRGL-232ENST00000514663 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
PACRGL-232ENST00000514663 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.01■■■■□ 3.84
PACRGL-232ENST00000514663 KIF27Q86VH2 1401 aa38.99■■■■□ 3.83
PACRGL-232ENST00000514663 IGF1RP08069 1367 aa38.99■■■■□ 3.83
PACRGL-232ENST00000514663 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
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