RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514536.5

USP46-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 2

Gene USP46, Length 1,589 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-209ENST00000514536 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.58■■■□□ 2.97
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USP46-209ENST00000514536 NACADO15069 1562 aa27.98■■■□□ 2.07
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USP46-209ENST00000514536 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.34■■□□□ 1.81
USP46-209ENST00000514536 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.28■■□□□ 1.8
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USP46-209ENST00000514536 NCAPD3P42695 1498 aa25.87■■□□□ 1.73
USP46-209ENST00000514536 SMARCA2P51531 1590 aa25.83■■□□□ 1.72
USP46-209ENST00000514536 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.72■■□□□ 1.71
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USP46-209ENST00000514536 ERCC6Q03468 1493 aa25.16■■□□□ 1.62
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USP46-209ENST00000514536 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.11■■□□□ 1.61
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USP46-209ENST00000514536 CUX2O14529 1486 aa25.1■■□□□ 1.61
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USP46-209ENST00000514536 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.85■■□□□ 1.57
USP46-209ENST00000514536 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.84■■□□□ 1.57
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USP46-209ENST00000514536 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.78■■□□□ 1.56
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USP46-209ENST00000514536 PRDM2Q13029 1718 aa24.64■■□□□ 1.53
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USP46-209ENST00000514536 TOPBP1Q92547 1522 aa24.44■■□□□ 1.5
USP46-209ENST00000514536 ABCC8Q09428 1581 aa24.42■■□□□ 1.5
USP46-209ENST00000514536 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.38■■□□□ 1.49
USP46-209ENST00000514536 CUX1P39880 1505 aa24.29■■□□□ 1.48
USP46-209ENST00000514536 IFT140Q96RY7 1462 aa24.26■■□□□ 1.47
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USP46-209ENST00000514536 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.2■■□□□ 1.46
USP46-209ENST00000514536 SOGA1O94964 1423 aa24.19■■□□□ 1.46
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USP46-209ENST00000514536 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
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USP46-209ENST00000514536 SYNJ1O43426 1573 aa24.08■■□□□ 1.44
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USP46-209ENST00000514536 TOP2BQ02880 1626 aa24.06■■□□□ 1.44
USP46-209ENST00000514536 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.02■■□□□ 1.44
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USP46-209ENST00000514536 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
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USP46-209ENST00000514536 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.95■■□□□ 1.42
USP46-209ENST00000514536 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.88■■□□□ 1.41
USP46-209ENST00000514536 WDR97A6NE52 1622 aa23.88■■□□□ 1.41
USP46-209ENST00000514536 GRIN2BQ13224 1484 aa23.86■■□□□ 1.41
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USP46-209ENST00000514536 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.79■■□□□ 1.4
USP46-209ENST00000514536 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
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USP46-209ENST00000514536 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.64■■□□□ 1.38
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USP46-209ENST00000514536 ARHGEF11O15085 1522 aa23.59■■□□□ 1.37
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USP46-209ENST00000514536 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.46■■□□□ 1.35
USP46-209ENST00000514536 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.44■■□□□ 1.34
USP46-209ENST00000514536 NUP160Q12769 1436 aa23.43■■□□□ 1.34
USP46-209ENST00000514536 CUL7Q14999 1698 aa23.4■■□□□ 1.34
USP46-209ENST00000514536 CEP170Q5SW79 1584 aa23.4■■□□□ 1.34
USP46-209ENST00000514536 ARAP1Q96P48 1450 aa23.38■■□□□ 1.33
USP46-209ENST00000514536 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.32■■□□□ 1.32
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