RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514288.5

ZBED3-AS1-213, ZBED3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene ZBED3-AS1, Length 576 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.93■■■□□ 2.7
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.58■■■□□ 2.17
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 ABCC9O60706 1549 aa28.47■■■□□ 2.15
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.1■■□□□ 1.93
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 NACADO15069 1562 aa26.94■■□□□ 1.9
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.8■■□□□ 1.88
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.6■■□□□ 1.85
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.6■■□□□ 1.85
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.58■■□□□ 1.85
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.41■■□□□ 1.82
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.34■■□□□ 1.81
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 SCRIBQ14160 1630 aa26.13■■□□□ 1.77
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.93■■□□□ 1.74
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.72■■□□□ 1.71
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.59■■□□□ 1.69
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 SMARCA4P51532 1647 aa24.9■■□□□ 1.58
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 NCAPD3P42695 1498 aa24.87■■□□□ 1.57
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.86■■□□□ 1.57
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 SMARCA2P51531 1590 aa24.76■■□□□ 1.55
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 HMGXB3Q12766 1538 aa24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.65■■□□□ 1.54
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.63■■□□□ 1.53
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 NESP48681 1621 aa24.53■■□□□ 1.52
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 ERCC6Q03468 1493 aa24.51■■□□□ 1.51
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 CUX2O14529 1486 aa24.41■■□□□ 1.5
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 WIZO95785 1651 aa24.37■■□□□ 1.49
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.3■■□□□ 1.48
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.23■■□□□ 1.47
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.18■■□□□ 1.46
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.12■■□□□ 1.45
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.1■■□□□ 1.45
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.96■■□□□ 1.43
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 WDR62O43379 1518 aa23.91■■□□□ 1.42
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 CFTRP13569 1480 aa23.9■■□□□ 1.42
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.88■■□□□ 1.41
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.88■■□□□ 1.41
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.75■■□□□ 1.39
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 PRDM2Q13029 1718 aa23.72■■□□□ 1.39
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 TOPBP1Q92547 1522 aa23.47■■□□□ 1.35
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.39■■□□□ 1.33
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 IFT140Q96RY7 1462 aa23.38■■□□□ 1.33
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 ABCC8Q09428 1581 aa23.31■■□□□ 1.32
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 OSCARQ8IYS5 282 aa23.24■■□□□ 1.31
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 TRIM41Q8WV44 630 aa23.23■■□□□ 1.31
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.17■■□□□ 1.3
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 CUX1P39880 1505 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.12■■□□□ 1.29
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 CHD1O14646 1710 aa23.1■■□□□ 1.29
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.08■■□□□ 1.28
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.08■■□□□ 1.28
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.08■■□□□ 1.28
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 SOGA1O94964 1423 aa23.08■■□□□ 1.28
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 WDR97A6NE52 1622 aa23■■□□□ 1.27
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 ARHGEF11O15085 1522 aa22.99■■□□□ 1.27
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.98■■□□□ 1.27
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 FBLN2P98095 1184 aa22.93■■□□□ 1.26
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 PBRM1Q86U86 1689 aa22.87■■□□□ 1.25
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 GRIN2BQ13224 1484 aa22.87■■□□□ 1.25
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.84■■□□□ 1.25
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.84■■□□□ 1.25
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.82■■□□□ 1.24
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 SYNJ1O43426 1573 aa22.82■■□□□ 1.24
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.82■■□□□ 1.24
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 ARAP1Q96P48 1450 aa22.81■■□□□ 1.24
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.81■■□□□ 1.24
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 SYNJ2O15056 1496 aa22.79■■□□□ 1.24
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 TOP2BQ02880 1626 aa22.79■■□□□ 1.24
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.74■■□□□ 1.23
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 ADAMTS12P58397 1594 aa22.67■■□□□ 1.22
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 GRIN2AQ12879 1464 aa22.6■■□□□ 1.21
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 CEP170Q5SW79 1584 aa22.58■■□□□ 1.2
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.54■■□□□ 1.2
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.54■■□□□ 1.2
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.52■■□□□ 1.2
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 NUP160Q12769 1436 aa22.52■■□□□ 1.2
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 SHROOM2Q13796 1616 aa22.44■■□□□ 1.18
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.35■■□□□ 1.17
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 IGF1RP08069 1367 aa22.28■■□□□ 1.16
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ZBED3-AS1-213ENST00000514288 KIF27Q86VH2 1401 aa22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms