RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514285.1

SERF1B-207, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 2

Gene SERF1B, Length 433 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-207ENST00000514285 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.63■■■■□ 3.29
SERF1B-207ENST00000514285 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.75■■■□□ 2.67
SERF1B-207ENST00000514285 ABCC9O60706 1549 aa31.09■■■□□ 2.57
SERF1B-207ENST00000514285 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.92■■■□□ 2.38
SERF1B-207ENST00000514285 NACADO15069 1562 aa29.87■■■□□ 2.37
SERF1B-207ENST00000514285 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.74■■■□□ 2.35
SERF1B-207ENST00000514285 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
SERF1B-207ENST00000514285 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.69■■■□□ 2.34
SERF1B-207ENST00000514285 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.51■■■□□ 2.32
SERF1B-207ENST00000514285 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.19■■■□□ 2.26
SERF1B-207ENST00000514285 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
SERF1B-207ENST00000514285 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.98■■■□□ 2.23
SERF1B-207ENST00000514285 SCRIBQ14160 1630 aa28.93■■■□□ 2.22
SERF1B-207ENST00000514285 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.77■■■□□ 2.2
SERF1B-207ENST00000514285 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.57■■■□□ 2.16
SERF1B-207ENST00000514285 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
SERF1B-207ENST00000514285 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.14■■■□□ 2.09
SERF1B-207ENST00000514285 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.97■■■□□ 2.07
SERF1B-207ENST00000514285 SMARCA4P51532 1647 aa27.67■■■□□ 2.02
SERF1B-207ENST00000514285 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
SERF1B-207ENST00000514285 NCAPD3P42695 1498 aa27.55■■■□□ 2
SERF1B-207ENST00000514285 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.54■■■□□ 2
SERF1B-207ENST00000514285 SMARCA2P51531 1590 aa27.53■■■□□ 2
SERF1B-207ENST00000514285 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.44■■□□□ 1.98
SERF1B-207ENST00000514285 HMGXB3Q12766 1538 aa27.43■■□□□ 1.98
SERF1B-207ENST00000514285 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.43■■□□□ 1.98
SERF1B-207ENST00000514285 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
SERF1B-207ENST00000514285 WIZO95785 1651 aa27.13■■□□□ 1.93
SERF1B-207ENST00000514285 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
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SERF1B-207ENST00000514285 NESP48681 1621 aa26.87■■□□□ 1.89
SERF1B-207ENST00000514285 ERCC6Q03468 1493 aa26.86■■□□□ 1.89
SERF1B-207ENST00000514285 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.85■■□□□ 1.89
SERF1B-207ENST00000514285 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.73■■□□□ 1.87
SERF1B-207ENST00000514285 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.67■■□□□ 1.86
SERF1B-207ENST00000514285 CUX2O14529 1486 aa26.62■■□□□ 1.85
SERF1B-207ENST00000514285 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.57■■□□□ 1.84
SERF1B-207ENST00000514285 CFTRP13569 1480 aa26.57■■□□□ 1.84
SERF1B-207ENST00000514285 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.53■■□□□ 1.84
SERF1B-207ENST00000514285 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SERF1B-207ENST00000514285 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.43■■□□□ 1.82
SERF1B-207ENST00000514285 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.42■■□□□ 1.82
SERF1B-207ENST00000514285 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.4■■□□□ 1.82
SERF1B-207ENST00000514285 PRDM2Q13029 1718 aa26.36■■□□□ 1.81
SERF1B-207ENST00000514285 WDR62O43379 1518 aa26.33■■□□□ 1.81
SERF1B-207ENST00000514285 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SERF1B-207ENST00000514285 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SERF1B-207ENST00000514285 ABCC8Q09428 1581 aa26.02■■□□□ 1.76
SERF1B-207ENST00000514285 TOPBP1Q92547 1522 aa25.99■■□□□ 1.75
SERF1B-207ENST00000514285 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.98■■□□□ 1.75
SERF1B-207ENST00000514285 IFT140Q96RY7 1462 aa25.88■■□□□ 1.73
SERF1B-207ENST00000514285 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.84■■□□□ 1.73
SERF1B-207ENST00000514285 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
SERF1B-207ENST00000514285 CUX1P39880 1505 aa25.76■■□□□ 1.71
SERF1B-207ENST00000514285 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
SERF1B-207ENST00000514285 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SERF1B-207ENST00000514285 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.69■■□□□ 1.7
SERF1B-207ENST00000514285 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
SERF1B-207ENST00000514285 SOGA1O94964 1423 aa25.64■■□□□ 1.7
SERF1B-207ENST00000514285 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.63■■□□□ 1.69
SERF1B-207ENST00000514285 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
SERF1B-207ENST00000514285 WDR97A6NE52 1622 aa25.56■■□□□ 1.68
SERF1B-207ENST00000514285 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
SERF1B-207ENST00000514285 TOP2BQ02880 1626 aa25.53■■□□□ 1.68
SERF1B-207ENST00000514285 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.52■■□□□ 1.68
SERF1B-207ENST00000514285 SYNJ1O43426 1573 aa25.5■■□□□ 1.67
SERF1B-207ENST00000514285 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SERF1B-207ENST00000514285 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-207ENST00000514285 OSCARQ8IYS5 282 aa25.45■■□□□ 1.66
SERF1B-207ENST00000514285 GRIN2BQ13224 1484 aa25.39■■□□□ 1.65
SERF1B-207ENST00000514285 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.37■■□□□ 1.65
SERF1B-207ENST00000514285 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-207ENST00000514285 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-207ENST00000514285 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SERF1B-207ENST00000514285 CHD1O14646 1710 aa25.32■■□□□ 1.64
SERF1B-207ENST00000514285 PBRM1Q86U86 1689 aa25.32■■□□□ 1.64
SERF1B-207ENST00000514285 FBLN2P98095 1184 aa25.26■■□□□ 1.63
SERF1B-207ENST00000514285 SYNJ2O15056 1496 aa25.24■■□□□ 1.63
SERF1B-207ENST00000514285 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-207ENST00000514285 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.16■■□□□ 1.62
SERF1B-207ENST00000514285 ADAMTS12P58397 1594 aa25.14■■□□□ 1.61
SERF1B-207ENST00000514285 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.09■■□□□ 1.61
SERF1B-207ENST00000514285 ARHGEF11O15085 1522 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-207ENST00000514285 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-207ENST00000514285 KIF27Q86VH2 1401 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-207ENST00000514285 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-207ENST00000514285 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-207ENST00000514285 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-207ENST00000514285 GRIN2AQ12879 1464 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-207ENST00000514285 NUP160Q12769 1436 aa24.96■■□□□ 1.59
SERF1B-207ENST00000514285 TRIM41Q8WV44 630 aa24.94■■□□□ 1.58
SERF1B-207ENST00000514285 IGF1RP08069 1367 aa24.93■■□□□ 1.58
SERF1B-207ENST00000514285 CEP170Q5SW79 1584 aa24.93■■□□□ 1.58
SERF1B-207ENST00000514285 CUL7Q14999 1698 aa24.91■■□□□ 1.58
SERF1B-207ENST00000514285 ARAP1Q96P48 1450 aa24.85■■□□□ 1.57
SERF1B-207ENST00000514285 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.8■■□□□ 1.56
SERF1B-207ENST00000514285 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.79■■□□□ 1.56
SERF1B-207ENST00000514285 SHROOM2Q13796 1616 aa24.77■■□□□ 1.56
SERF1B-207ENST00000514285 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.76■■□□□ 1.55
SERF1B-207ENST00000514285 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.69■■□□□ 1.54
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