RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513893.5

LINC00461-215, long intergenic non-protein coding RNA 461, humanhuman

TSL 4

Gene LINC00461, Length 555 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00461-215ENST00000513893 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.4■■■■■ 4.06
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LINC00461-215ENST00000513893 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.98■■■■□ 3.03
LINC00461-215ENST00000513893 NACADO15069 1562 aa33.85■■■■□ 3.01
LINC00461-215ENST00000513893 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
LINC00461-215ENST00000513893 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.47■■■□□ 2.95
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LINC00461-215ENST00000513893 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.24■■■□□ 2.91
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LINC00461-215ENST00000513893 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.08■■■□□ 2.89
LINC00461-215ENST00000513893 SCRIBQ14160 1630 aa32.96■■■□□ 2.87
LINC00461-215ENST00000513893 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.45■■■□□ 2.79
LINC00461-215ENST00000513893 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
LINC00461-215ENST00000513893 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.15■■■□□ 2.74
LINC00461-215ENST00000513893 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.01■■■□□ 2.71
LINC00461-215ENST00000513893 SMARCA4P51532 1647 aa31.4■■■□□ 2.62
LINC00461-215ENST00000513893 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.34■■■□□ 2.61
LINC00461-215ENST00000513893 NCAPD3P42695 1498 aa31.29■■■□□ 2.6
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LINC00461-215ENST00000513893 SMARCA2P51531 1590 aa31.17■■■□□ 2.58
LINC00461-215ENST00000513893 HMGXB3Q12766 1538 aa31.08■■■□□ 2.57
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LINC00461-215ENST00000513893 PEG3Q9GZU2 1588 aa31■■■□□ 2.55
LINC00461-215ENST00000513893 WIZO95785 1651 aa30.85■■■□□ 2.53
LINC00461-215ENST00000513893 NESP48681 1621 aa30.81■■■□□ 2.52
LINC00461-215ENST00000513893 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
LINC00461-215ENST00000513893 ERCC6Q03468 1493 aa30.69■■■□□ 2.5
LINC00461-215ENST00000513893 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.46■■■□□ 2.47
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LINC00461-215ENST00000513893 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.41■■■□□ 2.46
LINC00461-215ENST00000513893 CUX2O14529 1486 aa30.35■■■□□ 2.45
LINC00461-215ENST00000513893 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.31■■■□□ 2.44
LINC00461-215ENST00000513893 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.3■■■□□ 2.44
LINC00461-215ENST00000513893 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
LINC00461-215ENST00000513893 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.15■■■□□ 2.42
LINC00461-215ENST00000513893 CFTRP13569 1480 aa30.15■■■□□ 2.42
LINC00461-215ENST00000513893 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.09■■■□□ 2.41
LINC00461-215ENST00000513893 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.06■■■□□ 2.4
LINC00461-215ENST00000513893 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.04■■■□□ 2.4
LINC00461-215ENST00000513893 WDR62O43379 1518 aa29.95■■■□□ 2.38
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LINC00461-215ENST00000513893 PRDM2Q13029 1718 aa29.75■■■□□ 2.35
LINC00461-215ENST00000513893 TOPBP1Q92547 1522 aa29.58■■■□□ 2.33
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LINC00461-215ENST00000513893 ABCC8Q09428 1581 aa29.39■■■□□ 2.29
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LINC00461-215ENST00000513893 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.29■■■□□ 2.28
LINC00461-215ENST00000513893 CUX1P39880 1505 aa29.29■■■□□ 2.28
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LINC00461-215ENST00000513893 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.23■■■□□ 2.27
LINC00461-215ENST00000513893 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
LINC00461-215ENST00000513893 SOGA1O94964 1423 aa29.2■■■□□ 2.26
LINC00461-215ENST00000513893 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
LINC00461-215ENST00000513893 OSCARQ8IYS5 282 aa29.12■■■□□ 2.25
LINC00461-215ENST00000513893 FBLN2P98095 1184 aa28.97■■■□□ 2.23
LINC00461-215ENST00000513893 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
LINC00461-215ENST00000513893 SYNJ1O43426 1573 aa28.95■■■□□ 2.22
LINC00461-215ENST00000513893 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.92■■■□□ 2.22
LINC00461-215ENST00000513893 TRIM41Q8WV44 630 aa28.92■■■□□ 2.22
LINC00461-215ENST00000513893 WDR97A6NE52 1622 aa28.91■■■□□ 2.22
LINC00461-215ENST00000513893 CHD1O14646 1710 aa28.88■■■□□ 2.21
LINC00461-215ENST00000513893 TOP2BQ02880 1626 aa28.87■■■□□ 2.21
LINC00461-215ENST00000513893 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.85■■■□□ 2.21
LINC00461-215ENST00000513893 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.84■■■□□ 2.21
LINC00461-215ENST00000513893 GRIN2BQ13224 1484 aa28.84■■■□□ 2.21
LINC00461-215ENST00000513893 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.83■■■□□ 2.21
LINC00461-215ENST00000513893 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.76■■■□□ 2.2
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LINC00461-215ENST00000513893 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
LINC00461-215ENST00000513893 PBRM1Q86U86 1689 aa28.74■■■□□ 2.19
LINC00461-215ENST00000513893 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.71■■■□□ 2.19
LINC00461-215ENST00000513893 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.71■■■□□ 2.19
LINC00461-215ENST00000513893 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.71■■■□□ 2.19
LINC00461-215ENST00000513893 ARHGEF11O15085 1522 aa28.69■■■□□ 2.18
LINC00461-215ENST00000513893 SYNJ2O15056 1496 aa28.67■■■□□ 2.18
LINC00461-215ENST00000513893 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.57■■■□□ 2.16
LINC00461-215ENST00000513893 ADAMTS12P58397 1594 aa28.54■■■□□ 2.16
LINC00461-215ENST00000513893 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.52■■■□□ 2.16
LINC00461-215ENST00000513893 GRIN2AQ12879 1464 aa28.49■■■□□ 2.15
LINC00461-215ENST00000513893 ARAP1Q96P48 1450 aa28.47■■■□□ 2.15
LINC00461-215ENST00000513893 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.46■■■□□ 2.15
LINC00461-215ENST00000513893 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.45■■■□□ 2.15
LINC00461-215ENST00000513893 CEP170Q5SW79 1584 aa28.4■■■□□ 2.14
LINC00461-215ENST00000513893 NUP160Q12769 1436 aa28.36■■■□□ 2.13
LINC00461-215ENST00000513893 KIF27Q86VH2 1401 aa28.34■■■□□ 2.13
LINC00461-215ENST00000513893 IGF1RP08069 1367 aa28.33■■■□□ 2.13
LINC00461-215ENST00000513893 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.29■■■□□ 2.12
LINC00461-215ENST00000513893 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.19■■■□□ 2.1
LINC00461-215ENST00000513893 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.13■■■□□ 2.09
LINC00461-215ENST00000513893 SHROOM2Q13796 1616 aa28.13■■■□□ 2.09
LINC00461-215ENST00000513893 CUL7Q14999 1698 aa28.11■■■□□ 2.09
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