RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513844.1

LINC01018-204, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1018, humanhuman

TSL 4

Gene LINC01018, Length 581 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01018-204ENST00000513844 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.72■■■■■ 4.59
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LINC01018-204ENST00000513844 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.25■■■■□ 3.55
LINC01018-204ENST00000513844 NACADO15069 1562 aa37.01■■■■□ 3.52
LINC01018-204ENST00000513844 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.74■■■■□ 3.47
LINC01018-204ENST00000513844 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.57■■■■□ 3.44
LINC01018-204ENST00000513844 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.54■■■■□ 3.44
LINC01018-204ENST00000513844 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.53■■■■□ 3.44
LINC01018-204ENST00000513844 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.36■■■■□ 3.41
LINC01018-204ENST00000513844 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
LINC01018-204ENST00000513844 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.23■■■■□ 3.39
LINC01018-204ENST00000513844 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.12■■■■□ 3.37
LINC01018-204ENST00000513844 SCRIBQ14160 1630 aa35.75■■■■□ 3.31
LINC01018-204ENST00000513844 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.68■■■■□ 3.3
LINC01018-204ENST00000513844 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.35■■■■□ 3.25
LINC01018-204ENST00000513844 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
LINC01018-204ENST00000513844 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.18■■■■□ 3.22
LINC01018-204ENST00000513844 NCAPD3P42695 1498 aa34.15■■■■□ 3.06
LINC01018-204ENST00000513844 SMARCA4P51532 1647 aa34.12■■■■□ 3.05
LINC01018-204ENST00000513844 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.07■■■■□ 3.05
LINC01018-204ENST00000513844 SMARCA2P51531 1590 aa33.99■■■■□ 3.03
LINC01018-204ENST00000513844 HMGXB3Q12766 1538 aa33.95■■■■□ 3.03
LINC01018-204ENST00000513844 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
LINC01018-204ENST00000513844 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.77■■■■□ 3
LINC01018-204ENST00000513844 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
LINC01018-204ENST00000513844 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.71■■■□□ 2.99
LINC01018-204ENST00000513844 ERCC6Q03468 1493 aa33.7■■■□□ 2.99
LINC01018-204ENST00000513844 CUX2O14529 1486 aa33.63■■■□□ 2.97
LINC01018-204ENST00000513844 NESP48681 1621 aa33.63■■■□□ 2.97
LINC01018-204ENST00000513844 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.46■■■□□ 2.95
LINC01018-204ENST00000513844 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.4■■■□□ 2.94
LINC01018-204ENST00000513844 WIZO95785 1651 aa33.33■■■□□ 2.93
LINC01018-204ENST00000513844 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
LINC01018-204ENST00000513844 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.26■■■□□ 2.91
LINC01018-204ENST00000513844 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.14■■■□□ 2.9
LINC01018-204ENST00000513844 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.1■■■□□ 2.89
LINC01018-204ENST00000513844 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.01■■■□□ 2.87
LINC01018-204ENST00000513844 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.9■■■□□ 2.86
LINC01018-204ENST00000513844 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
LINC01018-204ENST00000513844 WDR62O43379 1518 aa32.84■■■□□ 2.85
LINC01018-204ENST00000513844 CFTRP13569 1480 aa32.78■■■□□ 2.84
LINC01018-204ENST00000513844 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.78■■■□□ 2.84
LINC01018-204ENST00000513844 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.75■■■□□ 2.83
LINC01018-204ENST00000513844 PRDM2Q13029 1718 aa32.56■■■□□ 2.8
LINC01018-204ENST00000513844 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.8
LINC01018-204ENST00000513844 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.49■■■□□ 2.79
LINC01018-204ENST00000513844 TOPBP1Q92547 1522 aa32.16■■■□□ 2.74
LINC01018-204ENST00000513844 IFT140Q96RY7 1462 aa32.1■■■□□ 2.73
LINC01018-204ENST00000513844 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
LINC01018-204ENST00000513844 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.07■■■□□ 2.72
LINC01018-204ENST00000513844 ABCC8Q09428 1581 aa32.05■■■□□ 2.72
LINC01018-204ENST00000513844 OSCARQ8IYS5 282 aa32.04■■■□□ 2.72
LINC01018-204ENST00000513844 TRIM41Q8WV44 630 aa32.02■■■□□ 2.72
LINC01018-204ENST00000513844 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
LINC01018-204ENST00000513844 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
LINC01018-204ENST00000513844 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
LINC01018-204ENST00000513844 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.78■■■□□ 2.68
LINC01018-204ENST00000513844 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.74■■■□□ 2.67
LINC01018-204ENST00000513844 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.74■■■□□ 2.67
LINC01018-204ENST00000513844 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.74■■■□□ 2.67
LINC01018-204ENST00000513844 CHD1O14646 1710 aa31.72■■■□□ 2.67
LINC01018-204ENST00000513844 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.72■■■□□ 2.67
LINC01018-204ENST00000513844 CUX1P39880 1505 aa31.67■■■□□ 2.66
LINC01018-204ENST00000513844 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.65■■■□□ 2.66
LINC01018-204ENST00000513844 SOGA1O94964 1423 aa31.65■■■□□ 2.66
LINC01018-204ENST00000513844 ARHGEF11O15085 1522 aa31.62■■■□□ 2.65
LINC01018-204ENST00000513844 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
LINC01018-204ENST00000513844 WDR97A6NE52 1622 aa31.56■■■□□ 2.64
LINC01018-204ENST00000513844 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
LINC01018-204ENST00000513844 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.48■■■□□ 2.63
LINC01018-204ENST00000513844 FBLN2P98095 1184 aa31.48■■■□□ 2.63
LINC01018-204ENST00000513844 GRIN2BQ13224 1484 aa31.39■■■□□ 2.62
LINC01018-204ENST00000513844 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
LINC01018-204ENST00000513844 PBRM1Q86U86 1689 aa31.36■■■□□ 2.61
LINC01018-204ENST00000513844 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.33■■■□□ 2.61
LINC01018-204ENST00000513844 ARAP1Q96P48 1450 aa31.33■■■□□ 2.61
LINC01018-204ENST00000513844 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.3■■■□□ 2.6
LINC01018-204ENST00000513844 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.29■■■□□ 2.6
LINC01018-204ENST00000513844 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.29■■■□□ 2.6
LINC01018-204ENST00000513844 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.29■■■□□ 2.6
LINC01018-204ENST00000513844 SYNJ2O15056 1496 aa31.27■■■□□ 2.6
LINC01018-204ENST00000513844 SYNJ1O43426 1573 aa31.27■■■□□ 2.6
LINC01018-204ENST00000513844 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
LINC01018-204ENST00000513844 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.21■■■□□ 2.59
LINC01018-204ENST00000513844 TOP2BQ02880 1626 aa31.18■■■□□ 2.58
LINC01018-204ENST00000513844 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.15■■■□□ 2.58
LINC01018-204ENST00000513844 ADAMTS12P58397 1594 aa31.04■■■□□ 2.56
LINC01018-204ENST00000513844 GRIN2AQ12879 1464 aa31■■■□□ 2.55
LINC01018-204ENST00000513844 CEP170Q5SW79 1584 aa30.92■■■□□ 2.54
LINC01018-204ENST00000513844 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.9■■■□□ 2.54
LINC01018-204ENST00000513844 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
LINC01018-204ENST00000513844 NUP160Q12769 1436 aa30.9■■■□□ 2.54
LINC01018-204ENST00000513844 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.89■■■□□ 2.53
LINC01018-204ENST00000513844 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.86■■■□□ 2.53
LINC01018-204ENST00000513844 SHROOM2Q13796 1616 aa30.8■■■□□ 2.52
LINC01018-204ENST00000513844 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.61■■■□□ 2.49
LINC01018-204ENST00000513844 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
LINC01018-204ENST00000513844 JPH4Q96JJ6 628 aa30.51■■■□□ 2.47
LINC01018-204ENST00000513844 KIF27Q86VH2 1401 aa30.5■■■□□ 2.47
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