RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513758.2

APOBEC3B-AS1-201, APOBEC3B antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene APOBEC3B-AS1, Length 691 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.97■■□□□ 1.27
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APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.41■□□□□ 0.7
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APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.11■□□□□ 0.65
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APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 NCAPD3P42695 1498 aa17.83■□□□□ 0.45
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 SMARCA2P51531 1590 aa17.76■□□□□ 0.43
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APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.66■□□□□ 0.42
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APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ERCC6Q03468 1493 aa17.53■□□□□ 0.4
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APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CUX2O14529 1486 aa17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.38■□□□□ 0.37
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
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APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CFTRP13569 1480 aa17.16■□□□□ 0.34
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APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 WDR62O43379 1518 aa17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 PRDM2Q13029 1718 aa17.06■□□□□ 0.32
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APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ABCC8Q09428 1581 aa16.74■□□□□ 0.27
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APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
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APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CUX1P39880 1505 aa16.65■□□□□ 0.26
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APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.61■□□□□ 0.25
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APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.46■□□□□ 0.23
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APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ARHGEF11O15085 1522 aa16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 TOP2BQ02880 1626 aa16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.34■□□□□ 0.21
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 SYNJ2O15056 1496 aa16.33■□□□□ 0.2
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ARAP1Q96P48 1450 aa16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ADAMTS12P58397 1594 aa16.23■□□□□ 0.19
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 GRIN2AQ12879 1464 aa16.22■□□□□ 0.19
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 CEP170Q5SW79 1584 aa16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 NUP160Q12769 1436 aa16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 IGF1RP08069 1367 aa16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 SHROOM2Q13796 1616 aa16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 KIF27Q86VH2 1401 aa16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 JPH4Q96JJ6 628 aa16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3B-AS1-201ENST00000513758 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
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