RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.61■■■□□ 2.01
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ABCC9O60706 1549 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NACADO15069 1562 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.45■■□□□ 1.18
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 SCRIBQ14160 1630 aa22.14■■□□□ 1.14
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMARCA2P51531 1590 aa21.02■□□□□ 0.96
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 HMGXB3Q12766 1538 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.54■□□□□ 0.88
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 CFTRP13569 1480 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRDM2Q13029 1718 aa20.24■□□□□ 0.83
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ABCC8Q09428 1581 aa20.15■□□□□ 0.82
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.04■□□□□ 0.8
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 NESP48681 1621 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SYNJ1O43426 1573 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.96■□□□□ 0.79
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.54■□□□□ 0.72
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXC-AS2-201ENST00000513533 WDR97A6NE52 1622 aa19.47■□□□□ 0.71
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.4■□□□□ 0.7
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GRIN2BQ13224 1484 aa19.34■□□□□ 0.69
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CLIP1P30622 1438 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADAMTS12P58397 1594 aa19.18■□□□□ 0.66
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.15■□□□□ 0.66
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.15■□□□□ 0.66
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS2-201ENST00000513533 APLP2Q06481 763 aa19.12■□□□□ 0.65
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