RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513085.1

PCSK1-204, Transcript of proprotein convertase subtilisin/kexin type 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCSK1, Length 1,481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1-204ENST00000513085 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.52■■■□□ 2.64
PCSK1-204ENST00000513085 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.73■■■□□ 2.03
PCSK1-204ENST00000513085 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PCSK1-204ENST00000513085 ABCC9O60706 1549 aa26.26■■□□□ 1.79
PCSK1-204ENST00000513085 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.18■■□□□ 1.78
PCSK1-204ENST00000513085 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.03■■□□□ 1.76
PCSK1-204ENST00000513085 MYO15BQ96JP2 1530 aa26■■□□□ 1.75
PCSK1-204ENST00000513085 NACADO15069 1562 aa25.88■■□□□ 1.73
PCSK1-204ENST00000513085 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.71■■□□□ 1.71
PCSK1-204ENST00000513085 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.33■■□□□ 1.65
PCSK1-204ENST00000513085 SCRIBQ14160 1630 aa25.28■■□□□ 1.64
PCSK1-204ENST00000513085 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.06■■□□□ 1.6
PCSK1-204ENST00000513085 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.81■■□□□ 1.56
PCSK1-204ENST00000513085 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
PCSK1-204ENST00000513085 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.64■■□□□ 1.53
PCSK1-204ENST00000513085 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PCSK1-204ENST00000513085 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.4■■□□□ 1.5
PCSK1-204ENST00000513085 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PCSK1-204ENST00000513085 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PCSK1-204ENST00000513085 SMARCA4P51532 1647 aa24.29■■□□□ 1.48
PCSK1-204ENST00000513085 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.27■■□□□ 1.48
PCSK1-204ENST00000513085 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PCSK1-204ENST00000513085 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.06■■□□□ 1.44
PCSK1-204ENST00000513085 WIZO95785 1651 aa24.06■■□□□ 1.44
PCSK1-204ENST00000513085 SMARCA2P51531 1590 aa24.02■■□□□ 1.44
PCSK1-204ENST00000513085 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.94■■□□□ 1.42
PCSK1-204ENST00000513085 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
PCSK1-204ENST00000513085 NCAPD3P42695 1498 aa23.84■■□□□ 1.41
PCSK1-204ENST00000513085 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
PCSK1-204ENST00000513085 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.81■■□□□ 1.4
PCSK1-204ENST00000513085 HMGXB3Q12766 1538 aa23.81■■□□□ 1.4
PCSK1-204ENST00000513085 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.58■■□□□ 1.37
PCSK1-204ENST00000513085 CFTRP13569 1480 aa23.22■■□□□ 1.31
PCSK1-204ENST00000513085 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.19■■□□□ 1.3
PCSK1-204ENST00000513085 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.16■■□□□ 1.3
PCSK1-204ENST00000513085 PRDM2Q13029 1718 aa23.14■■□□□ 1.3
PCSK1-204ENST00000513085 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.11■■□□□ 1.29
PCSK1-204ENST00000513085 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.11■■□□□ 1.29
PCSK1-204ENST00000513085 TRIM41Q8WV44 630 aa22.98■■□□□ 1.27
PCSK1-204ENST00000513085 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.94■■□□□ 1.26
PCSK1-204ENST00000513085 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
PCSK1-204ENST00000513085 ABCC8Q09428 1581 aa22.93■■□□□ 1.26
PCSK1-204ENST00000513085 NESP48681 1621 aa22.93■■□□□ 1.26
PCSK1-204ENST00000513085 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.9■■□□□ 1.26
PCSK1-204ENST00000513085 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.82■■□□□ 1.24
PCSK1-204ENST00000513085 TOP2BQ02880 1626 aa22.79■■□□□ 1.24
PCSK1-204ENST00000513085 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.78■■□□□ 1.24
PCSK1-204ENST00000513085 SYNJ1O43426 1573 aa22.77■■□□□ 1.24
PCSK1-204ENST00000513085 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.73■■□□□ 1.23
PCSK1-204ENST00000513085 CUX1P39880 1505 aa22.72■■□□□ 1.23
PCSK1-204ENST00000513085 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.69■■□□□ 1.22
PCSK1-204ENST00000513085 ERCC6Q03468 1493 aa22.64■■□□□ 1.21
PCSK1-204ENST00000513085 TOPBP1Q92547 1522 aa22.62■■□□□ 1.21
PCSK1-204ENST00000513085 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.61■■□□□ 1.21
PCSK1-204ENST00000513085 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PCSK1-204ENST00000513085 EEA1Q15075 1411 aa22.58■■□□□ 1.2
PCSK1-204ENST00000513085 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.54■■□□□ 1.2
PCSK1-204ENST00000513085 WDR62O43379 1518 aa22.5■■□□□ 1.19
PCSK1-204ENST00000513085 CUX2O14529 1486 aa22.48■■□□□ 1.19
PCSK1-204ENST00000513085 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PCSK1-204ENST00000513085 SOGA1O94964 1423 aa22.45■■□□□ 1.18
PCSK1-204ENST00000513085 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PCSK1-204ENST00000513085 KIF27Q86VH2 1401 aa22.42■■□□□ 1.18
PCSK1-204ENST00000513085 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PCSK1-204ENST00000513085 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.39■■□□□ 1.17
PCSK1-204ENST00000513085 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.37■■□□□ 1.17
PCSK1-204ENST00000513085 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.34■■□□□ 1.17
PCSK1-204ENST00000513085 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.33■■□□□ 1.17
PCSK1-204ENST00000513085 WDR97A6NE52 1622 aa22.32■■□□□ 1.16
PCSK1-204ENST00000513085 IFT140Q96RY7 1462 aa22.32■■□□□ 1.16
PCSK1-204ENST00000513085 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PCSK1-204ENST00000513085 KIF21BO75037 1637 aa22.21■■□□□ 1.15
PCSK1-204ENST00000513085 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.21■■□□□ 1.15
PCSK1-204ENST00000513085 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.19■■□□□ 1.14
PCSK1-204ENST00000513085 IGF1RP08069 1367 aa22.18■■□□□ 1.14
PCSK1-204ENST00000513085 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.17■■□□□ 1.14
PCSK1-204ENST00000513085 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.17■■□□□ 1.14
PCSK1-204ENST00000513085 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PCSK1-204ENST00000513085 GOLGA3Q08378 1498 aa22.16■■□□□ 1.14
PCSK1-204ENST00000513085 PRXQ9BXM0 1461 aa22.15■■□□□ 1.14
PCSK1-204ENST00000513085 CUL7Q14999 1698 aa22.13■■□□□ 1.13
PCSK1-204ENST00000513085 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.09■■□□□ 1.13
PCSK1-204ENST00000513085 GRIN2BQ13224 1484 aa22.09■■□□□ 1.13
PCSK1-204ENST00000513085 PBRM1Q86U86 1689 aa22.08■■□□□ 1.13
PCSK1-204ENST00000513085 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
PCSK1-204ENST00000513085 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.06■■□□□ 1.12
PCSK1-204ENST00000513085 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PCSK1-204ENST00000513085 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PCSK1-204ENST00000513085 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PCSK1-204ENST00000513085 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.04■■□□□ 1.12
PCSK1-204ENST00000513085 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22■■□□□ 1.11
PCSK1-204ENST00000513085 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.97■■□□□ 1.11
PCSK1-204ENST00000513085 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PCSK1-204ENST00000513085 ADAMTS12P58397 1594 aa21.92■■□□□ 1.1
PCSK1-204ENST00000513085 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.89■■□□□ 1.1
PCSK1-204ENST00000513085 SYNJ2O15056 1496 aa21.84■■□□□ 1.09
PCSK1-204ENST00000513085 CEP162Q5TB80 1403 aa21.83■■□□□ 1.09
PCSK1-204ENST00000513085 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.81■■□□□ 1.08
PCSK1-204ENST00000513085 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PCSK1-204ENST00000513085 GRIN2AQ12879 1464 aa21.78■■□□□ 1.08
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