RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513007.1

PXYLP1-210, Transcript of 2-phosphoxylose phosphatase 1, humanhuman

TSL 4

Gene PXYLP1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXYLP1-210ENST00000513007 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.54■■■■■ 8.08
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PXYLP1-210ENST00000513007 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.73■■■■■ 6.51
PXYLP1-210ENST00000513007 NACADO15069 1562 aa55.4■■■■■ 6.46
PXYLP1-210ENST00000513007 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.27■■■■■ 6.44
PXYLP1-210ENST00000513007 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.69■■■■■ 6.35
PXYLP1-210ENST00000513007 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.68■■■■■ 6.34
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PXYLP1-210ENST00000513007 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.14■■■■■ 6.26
PXYLP1-210ENST00000513007 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.1■■■■■ 6.25
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PXYLP1-210ENST00000513007 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.33■■■■■ 6.13
PXYLP1-210ENST00000513007 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.83■■■■■ 6.05
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PXYLP1-210ENST00000513007 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.63■■■■■ 6.02
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PXYLP1-210ENST00000513007 SMARCA2P51531 1590 aa50.9■■■■■ 5.74
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PXYLP1-210ENST00000513007 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.53■■■■■ 5.68
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PXYLP1-210ENST00000513007 NESP48681 1621 aa50.33■■■■■ 5.65
PXYLP1-210ENST00000513007 CUX2O14529 1486 aa50.24■■■■■ 5.63
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PXYLP1-210ENST00000513007 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.66■■■■■ 5.54
PXYLP1-210ENST00000513007 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.63■■■■■ 5.54
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PXYLP1-210ENST00000513007 CFTRP13569 1480 aa49.12■■■■■ 5.45
PXYLP1-210ENST00000513007 WDR62O43379 1518 aa49.1■■■■■ 5.45
PXYLP1-210ENST00000513007 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.09■■■■■ 5.45
PXYLP1-210ENST00000513007 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.07■■■■■ 5.45
PXYLP1-210ENST00000513007 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.76■■■■■ 5.4
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PXYLP1-210ENST00000513007 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.04■■■■■ 5.28
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PXYLP1-210ENST00000513007 OSCARQ8IYS5 282 aa48.02■■■■■ 5.28
PXYLP1-210ENST00000513007 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48■■■■■ 5.28
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PXYLP1-210ENST00000513007 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.38■■■■■ 5.18
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PXYLP1-210ENST00000513007 WDR97A6NE52 1622 aa47.19■■■■■ 5.15
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PXYLP1-210ENST00000513007 GRIN2BQ13224 1484 aa47.03■■■■■ 5.12
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PXYLP1-210ENST00000513007 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.81■■■■■ 5.08
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PXYLP1-210ENST00000513007 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.75■■■■■ 5.07
PXYLP1-210ENST00000513007 TOP2BQ02880 1626 aa46.73■■■■■ 5.07
PXYLP1-210ENST00000513007 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.73■■■■■ 5.07
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PXYLP1-210ENST00000513007 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.3■■■■■ 5
PXYLP1-210ENST00000513007 CEP170Q5SW79 1584 aa46.27■■■■■ 5
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PXYLP1-210ENST00000513007 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.16■■■■■ 4.98
PXYLP1-210ENST00000513007 SHROOM2Q13796 1616 aa46.03■■■■■ 4.96
PXYLP1-210ENST00000513007 KIF27Q86VH2 1401 aa45.83■■■■■ 4.93
PXYLP1-210ENST00000513007 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.82■■■■■ 4.93
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PXYLP1-210ENST00000513007 IGF1RP08069 1367 aa45.81■■■■■ 4.92
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