RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512855.5

FAM200B-218, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 5

Gene FAM200B, Length 654 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-218ENST00000512855 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.71■■■■■ 6.51
FAM200B-218ENST00000512855 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.63■■■■■ 5.53
FAM200B-218ENST00000512855 ABCC9O60706 1549 aa48.72■■■■■ 5.39
FAM200B-218ENST00000512855 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.79■■■■■ 5.08
FAM200B-218ENST00000512855 NACADO15069 1562 aa46.7■■■■■ 5.07
FAM200B-218ENST00000512855 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.52■■■■■ 5.04
FAM200B-218ENST00000512855 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.39■■■■■ 5.02
FAM200B-218ENST00000512855 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.36■■■■■ 5.01
FAM200B-218ENST00000512855 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.11■■■■■ 4.97
FAM200B-218ENST00000512855 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.75■■■■■ 4.91
FAM200B-218ENST00000512855 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.47■■■■■ 4.87
FAM200B-218ENST00000512855 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.42■■■■■ 4.86
FAM200B-218ENST00000512855 SCRIBQ14160 1630 aa45.21■■■■■ 4.83
FAM200B-218ENST00000512855 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.95■■■■■ 4.79
FAM200B-218ENST00000512855 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.92■■■■■ 4.78
FAM200B-218ENST00000512855 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
FAM200B-218ENST00000512855 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.08■■■■■ 4.65
FAM200B-218ENST00000512855 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.81■■■■■ 4.6
FAM200B-218ENST00000512855 SMARCA4P51532 1647 aa43.26■■■■■ 4.52
FAM200B-218ENST00000512855 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.18■■■■■ 4.5
FAM200B-218ENST00000512855 NCAPD3P42695 1498 aa43.12■■■■■ 4.49
FAM200B-218ENST00000512855 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.08■■■■■ 4.49
FAM200B-218ENST00000512855 SMARCA2P51531 1590 aa43.02■■■■■ 4.48
FAM200B-218ENST00000512855 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.92■■■■■ 4.46
FAM200B-218ENST00000512855 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.88■■■■■ 4.45
FAM200B-218ENST00000512855 HMGXB3Q12766 1538 aa42.87■■■■■ 4.45
FAM200B-218ENST00000512855 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.69■■■■■ 4.42
FAM200B-218ENST00000512855 WIZO95785 1651 aa42.44■■■■■ 4.39
FAM200B-218ENST00000512855 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
FAM200B-218ENST00000512855 NESP48681 1621 aa42.11■■■■■ 4.33
FAM200B-218ENST00000512855 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.99■■■■■ 4.31
FAM200B-218ENST00000512855 ERCC6Q03468 1493 aa41.98■■■■■ 4.31
FAM200B-218ENST00000512855 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
FAM200B-218ENST00000512855 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.82■■■■■ 4.29
FAM200B-218ENST00000512855 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.69■■■■■ 4.27
FAM200B-218ENST00000512855 CUX2O14529 1486 aa41.67■■■■■ 4.26
FAM200B-218ENST00000512855 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.61■■■■■ 4.25
FAM200B-218ENST00000512855 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
FAM200B-218ENST00000512855 CFTRP13569 1480 aa41.54■■■■■ 4.24
FAM200B-218ENST00000512855 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.49■■■■■ 4.23
FAM200B-218ENST00000512855 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.33■■■■■ 4.21
FAM200B-218ENST00000512855 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.29■■■■■ 4.2
FAM200B-218ENST00000512855 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.28■■■■■ 4.2
FAM200B-218ENST00000512855 PRDM2Q13029 1718 aa41.21■■■■■ 4.19
FAM200B-218ENST00000512855 WDR62O43379 1518 aa41.18■■■■■ 4.18
FAM200B-218ENST00000512855 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
FAM200B-218ENST00000512855 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
FAM200B-218ENST00000512855 TOPBP1Q92547 1522 aa40.66■■■■■ 4.1
FAM200B-218ENST00000512855 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.65■■■■■ 4.1
FAM200B-218ENST00000512855 ABCC8Q09428 1581 aa40.65■■■■■ 4.1
FAM200B-218ENST00000512855 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.59■■■■■ 4.09
FAM200B-218ENST00000512855 IFT140Q96RY7 1462 aa40.45■■■■■ 4.07
FAM200B-218ENST00000512855 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
FAM200B-218ENST00000512855 CUX1P39880 1505 aa40.28■■■■■ 4.04
FAM200B-218ENST00000512855 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
FAM200B-218ENST00000512855 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.16■■■■■ 4.02
FAM200B-218ENST00000512855 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
FAM200B-218ENST00000512855 SOGA1O94964 1423 aa40.12■■■■■ 4.01
FAM200B-218ENST00000512855 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.11■■■■■ 4.01
FAM200B-218ENST00000512855 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.02■■■■■ 4
FAM200B-218ENST00000512855 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.92■■■■□ 3.98
FAM200B-218ENST00000512855 WDR97A6NE52 1622 aa39.92■■■■□ 3.98
FAM200B-218ENST00000512855 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
FAM200B-218ENST00000512855 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.88■■■■□ 3.97
FAM200B-218ENST00000512855 OSCARQ8IYS5 282 aa39.88■■■■□ 3.97
FAM200B-218ENST00000512855 TOP2BQ02880 1626 aa39.87■■■■□ 3.97
FAM200B-218ENST00000512855 SYNJ1O43426 1573 aa39.84■■■■□ 3.97
FAM200B-218ENST00000512855 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.78■■■■□ 3.96
FAM200B-218ENST00000512855 GRIN2BQ13224 1484 aa39.68■■■■□ 3.94
FAM200B-218ENST00000512855 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.65■■■■□ 3.94
FAM200B-218ENST00000512855 CHD1O14646 1710 aa39.65■■■■□ 3.94
FAM200B-218ENST00000512855 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.65■■■■□ 3.94
FAM200B-218ENST00000512855 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.64■■■■□ 3.94
FAM200B-218ENST00000512855 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.61■■■■□ 3.93
FAM200B-218ENST00000512855 PBRM1Q86U86 1689 aa39.58■■■■□ 3.93
FAM200B-218ENST00000512855 FBLN2P98095 1184 aa39.53■■■■□ 3.92
FAM200B-218ENST00000512855 SYNJ2O15056 1496 aa39.45■■■■□ 3.91
FAM200B-218ENST00000512855 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
FAM200B-218ENST00000512855 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.3■■■■□ 3.88
FAM200B-218ENST00000512855 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.29■■■■□ 3.88
FAM200B-218ENST00000512855 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.29■■■■□ 3.88
FAM200B-218ENST00000512855 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.29■■■■□ 3.88
FAM200B-218ENST00000512855 ADAMTS12P58397 1594 aa39.27■■■■□ 3.88
FAM200B-218ENST00000512855 ARHGEF11O15085 1522 aa39.25■■■■□ 3.87
FAM200B-218ENST00000512855 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.24■■■■□ 3.87
FAM200B-218ENST00000512855 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.19■■■■□ 3.86
FAM200B-218ENST00000512855 GRIN2AQ12879 1464 aa39.17■■■■□ 3.86
FAM200B-218ENST00000512855 TRIM41Q8WV44 630 aa39.14■■■■□ 3.86
FAM200B-218ENST00000512855 KIF27Q86VH2 1401 aa39.09■■■■□ 3.85
FAM200B-218ENST00000512855 NUP160Q12769 1436 aa39.03■■■■□ 3.84
FAM200B-218ENST00000512855 CEP170Q5SW79 1584 aa38.99■■■■□ 3.83
FAM200B-218ENST00000512855 IGF1RP08069 1367 aa38.99■■■■□ 3.83
FAM200B-218ENST00000512855 ARAP1Q96P48 1450 aa38.93■■■■□ 3.82
FAM200B-218ENST00000512855 CUL7Q14999 1698 aa38.89■■■■□ 3.82
FAM200B-218ENST00000512855 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.87■■■■□ 3.81
FAM200B-218ENST00000512855 SHROOM2Q13796 1616 aa38.77■■■■□ 3.8
FAM200B-218ENST00000512855 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.73■■■■□ 3.79
FAM200B-218ENST00000512855 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.7■■■■□ 3.79
FAM200B-218ENST00000512855 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.67■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.2 ms