RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512722.1

DPYSL3-206, Transcript of dihydropyrimidinase like 3, humanhuman

TSL 3

Gene DPYSL3, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPYSL3-206ENST00000512722 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.86■■■■■ 8.13
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DPYSL3-206ENST00000512722 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.23■■■■■ 6.43
DPYSL3-206ENST00000512722 NACADO15069 1562 aa55.17■■■■■ 6.42
DPYSL3-206ENST00000512722 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.05■■■■■ 6.4
DPYSL3-206ENST00000512722 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.86■■■■■ 6.37
DPYSL3-206ENST00000512722 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.84■■■■■ 6.37
DPYSL3-206ENST00000512722 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.58■■■■■ 6.33
DPYSL3-206ENST00000512722 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.8■■■■■ 6.2
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DPYSL3-206ENST00000512722 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.41■■■■■ 6.14
DPYSL3-206ENST00000512722 SCRIBQ14160 1630 aa53.37■■■■■ 6.13
DPYSL3-206ENST00000512722 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.1■■■■■ 6.09
DPYSL3-206ENST00000512722 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.55■■■■■ 6
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DPYSL3-206ENST00000512722 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.86■■■■■ 5.89
DPYSL3-206ENST00000512722 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.56■■■■■ 5.84
DPYSL3-206ENST00000512722 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.11■■■■■ 5.77
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DPYSL3-206ENST00000512722 NCAPD3P42695 1498 aa50.88■■■■■ 5.74
DPYSL3-206ENST00000512722 SMARCA2P51531 1590 aa50.87■■■■■ 5.73
DPYSL3-206ENST00000512722 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.84■■■■■ 5.73
DPYSL3-206ENST00000512722 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.68■■■■■ 5.7
DPYSL3-206ENST00000512722 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.64■■■■■ 5.7
DPYSL3-206ENST00000512722 HMGXB3Q12766 1538 aa50.62■■■■■ 5.69
DPYSL3-206ENST00000512722 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.46■■■■■ 5.67
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DPYSL3-206ENST00000512722 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.57■■■■■ 5.53
DPYSL3-206ENST00000512722 NESP48681 1621 aa49.52■■■■■ 5.52
DPYSL3-206ENST00000512722 ERCC6Q03468 1493 aa49.51■■■■■ 5.52
DPYSL3-206ENST00000512722 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.4■■■■■ 5.5
DPYSL3-206ENST00000512722 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.27■■■■■ 5.48
DPYSL3-206ENST00000512722 CFTRP13569 1480 aa49.07■■■■■ 5.45
DPYSL3-206ENST00000512722 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.06■■■■■ 5.44
DPYSL3-206ENST00000512722 CUX2O14529 1486 aa49.04■■■■■ 5.44
DPYSL3-206ENST00000512722 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.97■■■■■ 5.43
DPYSL3-206ENST00000512722 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.84■■■■■ 5.41
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DPYSL3-206ENST00000512722 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.8■■■■■ 5.4
DPYSL3-206ENST00000512722 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.77■■■■■ 5.4
DPYSL3-206ENST00000512722 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.7■■■■■ 5.39
DPYSL3-206ENST00000512722 PRDM2Q13029 1718 aa48.68■■■■■ 5.38
DPYSL3-206ENST00000512722 WDR62O43379 1518 aa48.53■■■■■ 5.36
DPYSL3-206ENST00000512722 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.24■■■■■ 5.31
DPYSL3-206ENST00000512722 ABCC8Q09428 1581 aa48.14■■■■■ 5.3
DPYSL3-206ENST00000512722 TOPBP1Q92547 1522 aa47.99■■■■■ 5.27
DPYSL3-206ENST00000512722 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.96■■■■■ 5.27
DPYSL3-206ENST00000512722 IFT140Q96RY7 1462 aa47.78■■■■■ 5.24
DPYSL3-206ENST00000512722 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.57■■■■■ 5.21
DPYSL3-206ENST00000512722 CUX1P39880 1505 aa47.56■■■■■ 5.2
DPYSL3-206ENST00000512722 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.54■■■■■ 5.2
DPYSL3-206ENST00000512722 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.45■■■■■ 5.19
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DPYSL3-206ENST00000512722 SOGA1O94964 1423 aa47.43■■■■■ 5.18
DPYSL3-206ENST00000512722 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.42■■■■■ 5.18
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DPYSL3-206ENST00000512722 WDR97A6NE52 1622 aa47.23■■■■■ 5.15
DPYSL3-206ENST00000512722 TOP2BQ02880 1626 aa47.2■■■■■ 5.15
DPYSL3-206ENST00000512722 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.19■■■■■ 5.14
DPYSL3-206ENST00000512722 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.18■■■■■ 5.14
DPYSL3-206ENST00000512722 SYNJ1O43426 1573 aa47.1■■■■■ 5.13
DPYSL3-206ENST00000512722 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
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DPYSL3-206ENST00000512722 OSCARQ8IYS5 282 aa47.01■■■■■ 5.12
DPYSL3-206ENST00000512722 GRIN2BQ13224 1484 aa46.9■■■■■ 5.1
DPYSL3-206ENST00000512722 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.88■■■■■ 5.09
DPYSL3-206ENST00000512722 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.8■■■■■ 5.08
DPYSL3-206ENST00000512722 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.8■■■■■ 5.08
DPYSL3-206ENST00000512722 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.77■■■■■ 5.08
DPYSL3-206ENST00000512722 PBRM1Q86U86 1689 aa46.72■■■■■ 5.07
DPYSL3-206ENST00000512722 FBLN2P98095 1184 aa46.7■■■■■ 5.07
DPYSL3-206ENST00000512722 CHD1O14646 1710 aa46.67■■■■■ 5.06
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DPYSL3-206ENST00000512722 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.5■■■■■ 5.03
DPYSL3-206ENST00000512722 KIF27Q86VH2 1401 aa46.39■■■■■ 5.02
DPYSL3-206ENST00000512722 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.37■■■■■ 5.01
DPYSL3-206ENST00000512722 ADAMTS12P58397 1594 aa46.36■■■■■ 5.01
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DPYSL3-206ENST00000512722 TRIM41Q8WV44 630 aa46.2■■■■■ 4.99
DPYSL3-206ENST00000512722 ARHGEF11O15085 1522 aa46.14■■■■■ 4.98
DPYSL3-206ENST00000512722 IGF1RP08069 1367 aa46.13■■■■■ 4.98
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DPYSL3-206ENST00000512722 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.13■■■■■ 4.97
DPYSL3-206ENST00000512722 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.13■■■■■ 4.97
DPYSL3-206ENST00000512722 CUL7Q14999 1698 aa46.07■■■■■ 4.97
DPYSL3-206ENST00000512722 NUP160Q12769 1436 aa46.06■■■■■ 4.96
DPYSL3-206ENST00000512722 CEP170Q5SW79 1584 aa45.96■■■■■ 4.95
DPYSL3-206ENST00000512722 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.89■■■■■ 4.94
DPYSL3-206ENST00000512722 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.74■■■■■ 4.91
DPYSL3-206ENST00000512722 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.74■■■■■ 4.91
DPYSL3-206ENST00000512722 ARAP1Q96P48 1450 aa45.74■■■■■ 4.91
DPYSL3-206ENST00000512722 SHROOM2Q13796 1616 aa45.7■■■■■ 4.91
DPYSL3-206ENST00000512722 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.64■■■■■ 4.9
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