RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512153.5

COPB2-208, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 4

Gene COPB2, Length 629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-208ENST00000512153 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27■■□□□ 1.91
COPB2-208ENST00000512153 ABCC9O60706 1549 aa25.06■■□□□ 1.6
COPB2-208ENST00000512153 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.35■■□□□ 1.49
COPB2-208ENST00000512153 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.98■■□□□ 1.43
COPB2-208ENST00000512153 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.55■■□□□ 1.36
COPB2-208ENST00000512153 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.36■■□□□ 1.33
COPB2-208ENST00000512153 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
COPB2-208ENST00000512153 NACADO15069 1562 aa23.24■■□□□ 1.31
COPB2-208ENST00000512153 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.85■■□□□ 1.25
COPB2-208ENST00000512153 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.79■■□□□ 1.24
COPB2-208ENST00000512153 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.68■■□□□ 1.22
COPB2-208ENST00000512153 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.62■■□□□ 1.21
COPB2-208ENST00000512153 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.52■■□□□ 1.2
COPB2-208ENST00000512153 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.45■■□□□ 1.18
COPB2-208ENST00000512153 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.45■■□□□ 1.18
COPB2-208ENST00000512153 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
COPB2-208ENST00000512153 SCRIBQ14160 1630 aa22.27■■□□□ 1.16
COPB2-208ENST00000512153 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
COPB2-208ENST00000512153 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.2■■□□□ 1.14
COPB2-208ENST00000512153 CUX2O14529 1486 aa21.76■■□□□ 1.07
COPB2-208ENST00000512153 ERCC6Q03468 1493 aa21.73■■□□□ 1.07
COPB2-208ENST00000512153 NCAPD3P42695 1498 aa21.48■■□□□ 1.03
COPB2-208ENST00000512153 TRIM41Q8WV44 630 aa21.37■■□□□ 1.01
COPB2-208ENST00000512153 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.35■■□□□ 1.01
COPB2-208ENST00000512153 NESP48681 1621 aa21.33■■□□□ 1.01
COPB2-208ENST00000512153 SMARCA2P51531 1590 aa21.26■□□□□ 0.99
COPB2-208ENST00000512153 HMGXB3Q12766 1538 aa21.21■□□□□ 0.99
COPB2-208ENST00000512153 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
COPB2-208ENST00000512153 SMARCA4P51532 1647 aa21.14■□□□□ 0.97
COPB2-208ENST00000512153 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
COPB2-208ENST00000512153 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.06■□□□□ 0.96
COPB2-208ENST00000512153 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.06■□□□□ 0.96
COPB2-208ENST00000512153 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
COPB2-208ENST00000512153 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.95■□□□□ 0.94
COPB2-208ENST00000512153 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.88■□□□□ 0.93
COPB2-208ENST00000512153 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.87■□□□□ 0.93
COPB2-208ENST00000512153 OSCARQ8IYS5 282 aa20.85■□□□□ 0.93
COPB2-208ENST00000512153 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.85■□□□□ 0.93
COPB2-208ENST00000512153 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.8■□□□□ 0.92
COPB2-208ENST00000512153 WDR62O43379 1518 aa20.74■□□□□ 0.91
COPB2-208ENST00000512153 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.68■□□□□ 0.9
COPB2-208ENST00000512153 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.62■□□□□ 0.89
COPB2-208ENST00000512153 WIZO95785 1651 aa20.51■□□□□ 0.87
COPB2-208ENST00000512153 CFTRP13569 1480 aa20.46■□□□□ 0.87
COPB2-208ENST00000512153 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.43■□□□□ 0.86
COPB2-208ENST00000512153 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.43■□□□□ 0.86
COPB2-208ENST00000512153 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.43■□□□□ 0.86
COPB2-208ENST00000512153 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
COPB2-208ENST00000512153 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
COPB2-208ENST00000512153 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.42■□□□□ 0.86
COPB2-208ENST00000512153 ARHGEF11O15085 1522 aa20.35■□□□□ 0.85
COPB2-208ENST00000512153 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
COPB2-208ENST00000512153 IFT140Q96RY7 1462 aa20.29■□□□□ 0.84
COPB2-208ENST00000512153 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
COPB2-208ENST00000512153 FBLN2P98095 1184 aa20.25■□□□□ 0.83
COPB2-208ENST00000512153 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
COPB2-208ENST00000512153 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
COPB2-208ENST00000512153 TOPBP1Q92547 1522 aa20.13■□□□□ 0.81
COPB2-208ENST00000512153 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.811e-6■■□□□ 12.6
COPB2-208ENST00000512153 ARAP1Q96P48 1450 aa20.1■□□□□ 0.81
COPB2-208ENST00000512153 ABCC8Q09428 1581 aa20.09■□□□□ 0.81
COPB2-208ENST00000512153 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
COPB2-208ENST00000512153 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.05■□□□□ 0.8
COPB2-208ENST00000512153 PRDM2Q13029 1718 aa20.05■□□□□ 0.8
COPB2-208ENST00000512153 CHD1O14646 1710 aa20.02■□□□□ 0.79
COPB2-208ENST00000512153 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.98■□□□□ 0.79
COPB2-208ENST00000512153 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
COPB2-208ENST00000512153 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
COPB2-208ENST00000512153 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
COPB2-208ENST00000512153 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
COPB2-208ENST00000512153 SOGA1O94964 1423 aa19.88■□□□□ 0.77
COPB2-208ENST00000512153 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.87■□□□□ 0.77
COPB2-208ENST00000512153 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.83■□□□□ 0.76
COPB2-208ENST00000512153 SYNJ1O43426 1573 aa19.79■□□□□ 0.76
COPB2-208ENST00000512153 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.77■□□□□ 0.76
COPB2-208ENST00000512153 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
COPB2-208ENST00000512153 GRIN2BQ13224 1484 aa19.73■□□□□ 0.75
COPB2-208ENST00000512153 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.72■□□□□ 0.75
COPB2-208ENST00000512153 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.71■□□□□ 0.75
COPB2-208ENST00000512153 SYNJ2O15056 1496 aa19.7■□□□□ 0.74
COPB2-208ENST00000512153 WDR97A6NE52 1622 aa19.66■□□□□ 0.74
COPB2-208ENST00000512153 CUX1P39880 1505 aa19.56■□□□□ 0.72
COPB2-208ENST00000512153 PBRM1Q86U86 1689 aa19.48■□□□□ 0.71
COPB2-208ENST00000512153 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.46■□□□□ 0.71
COPB2-208ENST00000512153 GRIN2AQ12879 1464 aa19.43■□□□□ 0.7
COPB2-208ENST00000512153 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.42■□□□□ 0.7
COPB2-208ENST00000512153 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.42■□□□□ 0.7
COPB2-208ENST00000512153 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.41■□□□□ 0.7
COPB2-208ENST00000512153 CEP170Q5SW79 1584 aa19.4■□□□□ 0.7
COPB2-208ENST00000512153 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.37■□□□□ 0.69
COPB2-208ENST00000512153 NUP160Q12769 1436 aa19.36■□□□□ 0.69
COPB2-208ENST00000512153 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.34■□□□□ 0.69
COPB2-208ENST00000512153 JPH4Q96JJ6 628 aa19.33■□□□□ 0.68
COPB2-208ENST00000512153 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.33■□□□□ 0.68
COPB2-208ENST00000512153 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
COPB2-208ENST00000512153 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
COPB2-208ENST00000512153 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.29■□□□□ 0.68
COPB2-208ENST00000512153 ADAMTS12P58397 1594 aa19.28■□□□□ 0.68
COPB2-208ENST00000512153 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa19.27■□□□□ 0.68
COPB2-208ENST00000512153 SHROOM2Q13796 1616 aa19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms